导读:本文包含了电子克隆论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:信息学,生物,电子,基因,激酶,茶树,磷酸。
电子克隆论文文献综述
贺望兴,杨普香,李延升,石旭平,黎小萍[1]（2019）在《灵芝尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因的电子克隆与生物信息学分析》一文中研究指出尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(UGPase)是灵芝多糖合成途径的关键酶,用电子克隆方法得到灵芝UGPase基因,并利用生物信息学软件对UGPase基因编码蛋白的理化性质、亚细胞定位、亲/疏水性、信号肽、蛋白结构域、蛋白高级结构以及系统进化树的构建等方面进行了预测和分析。结果表明:UGPase基因全长1691 bp,包含一个1515 bp的完整开放阅读框,编码504个氨基酸;该蛋白不存在信号肽和跨膜结构域,它是定位于细胞质内的一种亲水性稳定蛋白酶;它的高级结构主要是由α螺旋结构和无规则卷曲结构所组成;同源比对分析显示,该酶基因编码的氨基酸序列和其他动植物的UGPase酶相比在序列组成、高级结构方面具有一定的相似性。(本文来源于《江西农业学报》期刊2019年09期）
王希,陈丽,赵春雷[2]（2019）在《电子克隆获取甜菜富亮氨酸类受体蛋白激酶基因BvLRR-RPK2;1完整编码区》一文中研究指出针对前期获得的甜菜分子标记位点进行分析,以获得甜菜中该位点相关的基因。结合电子克隆与常规克隆,获取并验证目的基因片段,最后预测基因产物结构与功能。结果获得了一段长3 467bp的片段,其中包含一个长3 141 bp的完整编码区,编码一个长1 046 aa的富亮氨酸类受体蛋白激酶。将基因命名为BvLRR-RPK2;1。基因编码区在基因组中连续存在,无内含子区域。基因翻译产物BvLRR-RPK2;1具有一个跨膜结构域,具有LRR-RPK家族的特征性结构域,与已知的LRR-RPK/RLK类蛋白序列相似性在85%以下,与甜菜本身的预测序列在编码区内部有5个碱基、2个氨基酸的差异。本文获得了一个甜菜中未经克隆的LRR-RPK2编码区,并预测了其产物功能。(本文来源于《中国糖料》期刊2019年03期）
徐煲铧,刘瑞彬,余绍东,张应中[3]（2019）在《茶树SBPase基因的电子克隆与生物信息学分析》一文中研究指出通过EST序列电子克隆技术,获得参与茶树光合作用的SBPase基因的cDNA拼接序列,对序列进行了生物信息学分析和功能预测,构建了系统进化树。本研究结果可为今后开展山茶属植物光合基因的功能研究奠定重要基础。(本文来源于《现代农业科技》期刊2019年07期）
任伟超,李阳,郝锟,张巍,许忠海[4]（2019）在《葛枣猕猴桃果糖激酶基因电子克隆和生物信息学分析》一文中研究指出目的:果糖激酶是促进果糖磷酸化关键代谢步骤重要的酶。通过电子克隆技术对葛枣猕猴桃果糖激酶基因进行预测。方法:以毛花猕猴桃果糖激酶序列为探针,基于美国国立生物技术信息中心(NCBI)中葛枣猕猴桃的EST数据库和CAP3在线软件进行序列拼接,利用生物信息学数据库及相关软件对其结构和功能进行预测分析。结果:葛枣猕猴桃果糖激酶基因全长1 015 bp,包含957 bp的开放阅读框,编码318个氨基酸,该蛋白为疏水性蛋白。结论:本研究为进一步解释葛枣猕猴桃果糖激酶基因的分子功能奠定理论及实验基础。(本文来源于《中国药师》期刊2019年01期）
葛春艳,李雪彤,刘福鹏,郑大浩,吴委林[5]（2018）在《红景天AG基因(RrAG)的电子克隆及生物信息学分析》一文中研究指出AG基因对植物的花发育具有至关重要的作用。以拟南芥AG基因(NP_001190766. 1)为参考序列,采用电子克隆技术获得红景天AG基因(Rr AG),并通过生物信息学分析预测该基因的结构、功能等。结果表明:该基因全长为1 037 bp,包含789 bp的开放阅读框,编码262个氨基酸,理论等电点为9. 27,是定位于细胞核内不稳定的亲水性蛋白,起到转录调控的作用。序列比对发现,红景天AG编码蛋白与荞麦的AG蛋白亲缘关系最近。研究结果为进一步研究Rr AG基因的功能奠定了基础。(本文来源于《江苏农业科学》期刊2018年21期）
任伟超,李相全,董上,王渌,高金辉[6]（2018）在《蒙古栎醇脱氢酶基因电子克隆及生物信息学分析》一文中研究指出以栓皮栎醇脱氢酶基因序列为探针,运用电子克隆技术进行蒙古栎醇脱氢酶基因预测和生物学分析。研究结果表明:蒙古栎醇脱氢酶基因全长594 bp,包含516 bp的开放阅读框,编码171个氨基酸;蛋白为亲水性的非分泌蛋白,不存在跨膜区;二级结构主要为无规则卷曲、延伸链和α螺旋;存在4个丝氨酸、10个苏氨酸、1个酪氨酸,可能成为蛋白激酶磷酸化位点。(本文来源于《林业科技》期刊2018年06期）
吴小斌,端木卜文,齐永文,卢颖林,李奇伟[7]（2018）在《甘蔗蔗糖磷酸合成酶基因SPS Ⅳ电子克隆及生物信息学分析》一文中研究指出蔗糖在植物生长发育过程中发挥重要作用,蔗糖磷酸合成酶(SPS)是蔗糖合成的关键酶之一。本研究以通过克隆获得的甘蔗SPS Ⅳ基因部分DNA序列为探针进行电子克隆,获得甘蔗SPS Ⅳ的编码区序列全长,并采用生物信息学方法,对该基因编码蛋白的氨基酸组成、理化性质、亚细胞定位及高级结构等方面进行预测分析。结果表明:Sc SPS Ⅳ基因编码区全长2943 bp,编码981个氨基酸,Sc SPS IV可能是不稳定的亲水性非分泌蛋白,主要表达于细胞质。遗传进化分析表明,该基因与高粱、玉米蔗糖磷酸合成酶基因同源性高。以上研究结果为Sc SPS Ⅳ基因下一步进行分子克隆、功能验证和应用提供基础。(本文来源于《甘蔗糖业》期刊2018年04期）
李菊,谢红江,杨文渊,陶炼,李洪雯[8]（2018）在《甜樱桃PaGAST基因的电子克隆及生物信息学分析》一文中研究指出为获得甜樱桃PaGAST基因的cDNA序列,并预测该基因编码蛋白的结构与功能,以草莓FaGAST1基因序列为探针,通过基于NCBI数据库中表达序列标签的电子克隆技术对甜樱桃PaGAST基因进行克隆。利用生物信息学方法对其编码蛋白的理化性质、疏水性和亲水性、信号肽序列、跨膜结构域、亚细胞定位及功能等方面进行分析。结果表明:甜樱桃PaGAST基因长度为750 bp,开放阅读框长度为324 bp,编码107个氨基酸,N末端存在信号肽序列,C末端含有保守的GASA结构域。由于PaGAST蛋白中含有的疏水性氨基酸残基较多,该蛋白具有跨膜螺旋区,是一种跨膜蛋白,且有10个预测的蛋白激酶磷酸化位点。亚细胞定位分析表明,PaGAST蛋白分布在细胞膜外的可能性很大。功能预测显示,PaGAST基因可能具有响应胁迫应答、信号转导和免疫应答方面的功能。进化分析显示甜樱桃PaGAST蛋白与桃的亲缘关系最近。在一定程度上为甜樱桃PaGAST基因的克隆及功能鉴定奠定理论基础。(本文来源于《中国农学通报》期刊2018年17期）
梅菊芬,徐德良,汤茶琴,周静峰,邵元海[9]（2018）在《茶树CsLhcb4基因的电子克隆与生物信息学分析》一文中研究指出采用电子克隆方法获得茶树CP29蛋白的c DNA序列(Cs Lhcb4),并进行相关生物信息学分析。结果表明,该基因包含1个858 bp的开放阅读框,编码285个氨基酸,分子量为31.1 ku,理论等电位点5.79。该基因为亲水蛋白,可能位于叶绿体上,属于叶绿素a/b连接蛋白超家族成员,其二级结构主要是α-螺旋和无规则卷曲,叁级结构构建模型为单体形式。序列进化分析表明,茶树CsLhcb4基因编码蛋白与大豆、欧洲大叶杨和陆地棉进化距离最近。以上结果为进一步分析CsLhcb4的功能及花青素代谢中的作用奠定基础。(本文来源于《江苏农业科学》期刊2018年09期）
熊勇,李红锐,罗斌圣,杨青松[10]（2018）在《药用植物黄花蒿ATP合成酶电子克隆及生物信息学分析》一文中研究指出本文通过电子克隆的方法获得黄花蒿ATP合成酶的基因完整序列并对该蛋白特性进行相应分析.以Accession number KJ434435.1为探针,对黄花蒿的EST数据库进行搜索,获得同源较高的序列,用相关生物软件DNAMAN、MEGA进行拼接组装,并对获得核苷酸和氨基酸进行生物信息学分析.结果发现获得黄花蒿ATP合成酶基因拼接群1963bp,含有一个完整的开放阅读框(ORF)序列(1479bp),编码492个氨基酸,该蛋白质含15个α螺旋,23个β折叠及27个无规则卷曲.黄花蒿ATP合成酶蛋白的分子质量为52830.4,分子式为C_(2342)H_(3778)N_(636)O_(721)S_(14),理论等电点为5.18,该蛋白的GRAVY值为-0.048,具有亲水性的水溶性蛋白.该蛋白质序列有丝氨酸磷酸化位点(Ser)9个、苏氨酸磷酸化位点(Thr)6个、酪氨酸磷酸化位点(Tyr)4个.通过分析获得黄花蒿ATP合成酶完整的c DNA序列,该氨基酸序列不存在信号肽,无跨膜现象、非分泌型蛋白,为黄花蒿ATP合成酶实验室研究提供一定的理论基础.(本文来源于《中央民族大学学报(自然科学版)》期刊2018年02期）
电子克隆论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
针对前期获得的甜菜分子标记位点进行分析,以获得甜菜中该位点相关的基因。结合电子克隆与常规克隆,获取并验证目的基因片段,最后预测基因产物结构与功能。结果获得了一段长3 467bp的片段,其中包含一个长3 141 bp的完整编码区,编码一个长1 046 aa的富亮氨酸类受体蛋白激酶。将基因命名为BvLRR-RPK2;1。基因编码区在基因组中连续存在,无内含子区域。基因翻译产物BvLRR-RPK2;1具有一个跨膜结构域,具有LRR-RPK家族的特征性结构域,与已知的LRR-RPK/RLK类蛋白序列相似性在85%以下,与甜菜本身的预测序列在编码区内部有5个碱基、2个氨基酸的差异。本文获得了一个甜菜中未经克隆的LRR-RPK2编码区,并预测了其产物功能。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
电子克隆论文参考文献
[1].贺望兴,杨普香,李延升,石旭平,黎小萍.灵芝尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因的电子克隆与生物信息学分析[J].江西农业学报.2019
[2].王希,陈丽,赵春雷.电子克隆获取甜菜富亮氨酸类受体蛋白激酶基因BvLRR-RPK2;1完整编码区[J].中国糖料.2019
[3].徐煲铧,刘瑞彬,余绍东,张应中.茶树SBPase基因的电子克隆与生物信息学分析[J].现代农业科技.2019
[4].任伟超,李阳,郝锟,张巍,许忠海.葛枣猕猴桃果糖激酶基因电子克隆和生物信息学分析[J].中国药师.2019
[5].葛春艳,李雪彤,刘福鹏,郑大浩,吴委林.红景天AG基因(RrAG)的电子克隆及生物信息学分析[J].江苏农业科学.2018
[6].任伟超,李相全,董上,王渌,高金辉.蒙古栎醇脱氢酶基因电子克隆及生物信息学分析[J].林业科技.2018
[7].吴小斌,端木卜文,齐永文,卢颖林,李奇伟.甘蔗蔗糖磷酸合成酶基因SPSⅣ电子克隆及生物信息学分析[J].甘蔗糖业.2018
[8].李菊,谢红江,杨文渊,陶炼,李洪雯.甜樱桃PaGAST基因的电子克隆及生物信息学分析[J].中国农学通报.2018
[9].梅菊芬,徐德良,汤茶琴,周静峰,邵元海.茶树CsLhcb4基因的电子克隆与生物信息学分析[J].江苏农业科学.2018
[10].熊勇,李红锐,罗斌圣,杨青松.药用植物黄花蒿ATP合成酶电子克隆及生物信息学分析[J].中央民族大学学报(自然科学版).2018
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