茶树金属耐受蛋白基因CsMTP1的克隆及生物信息学分析

论文摘要

金属耐受蛋白MTP （Metal tolerance protein）属于重金属转运蛋白家族（CDF）,在植物细胞内金属离子平衡调控过程中发挥重要作用。本研究采用RT-PCR及电子克隆的方法获得茶树重金属耐受蛋白基因CsMTP1 （NCBI-Gene ID:114289995）,其全长c DNA为1 239 bp,编码412个氨基酸残基,其编码蛋白分子量为45.61 kD,等电点为6.19;在线软件分析表明:CsMTP1蛋白含有6个跨膜结构域和1个CDF保守结构域,属于Zn-CDF亚家族,且蛋白三级结构也与已知植物锌离子转运蛋白相似;系统进化树分析结果表明:茶树CsMTP1与葡萄Vv MTP1进化同源性最高,其氨基酸序列相似度高达74.82%;RNA-Seq数据库表达分析结果显示:CsMTP1基因在茶树茎中的表达量最高,其次是根和嫩叶,老叶中的表达量最低;在线软件分析获得CsMTP1蛋白定位于液泡膜。本研究结果推测树CsMTP1蛋白属于Zn-CDF亚家族,可能参与茶树体内锌离子的转运平衡调控过程。

论文目录

• 1 结果与分析
•   1.1 CsMTP1基因全长cDNA的克隆及其编码蛋白的理化性质分析
•   1.2 CsMTP1蛋白氨基酸保守结构域分析
•   1.3 CsMTP1蛋白信号肽预测分析
•   1.4 CsMTP1蛋白氨基酸疏水性分析
•   1.5 CsMTP1蛋白的跨膜结构
•   1.6 CsMTP1蛋白三维结构分析
•   1.7 茶树CsMTP1蛋白系统进化分析
•   1.8 CsMTP1基因组织表达特异性分析
•   1.9 CsMTP1亚细胞定位分析
• 2 讨论
• 3 材料与方法
•   3.1 试验材料
•   3.2 总RNA的提取及cDNA的合成
•   3.3 茶树CsMTP1基因的克隆
•   3.4 CsMTP1蛋白生物信息学分析
• 作者贡献

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 代洪苇,童华荣,袁连玉

关键词: 茶树,基因克隆,生物信息学分析

来源: 分子植物育种 2019年22期

年度: 2019

分类: 农业科技

专业: 农作物

单位: 西南大学食品科学学院

基金: 中央高校基本科研业务费专项资金项目(XDJK2018C069,XDJK2019D032)资助

分类号: S571.1

DOI: 10.13271/j.mpb.017.007350

页码: 7350-7356

总页数: 7

文件大小: 2266K

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