芽胞杆菌浸种对水稻内生细菌群落结构的影响

论文摘要

水稻内生细菌群落是反映植株内环境是否健康稳定的重要生物学指标,芽胞杆菌是防治水稻病害的重要生防微生物。为揭示芽胞杆菌浸种处理对水稻内生细菌群落结构的影响,采用Illumina MiSeq测序的方法对水稻内生细菌的16S rRNA基因进行测序,剖析了芽胞杆菌浸种处理对不同水稻组织内生细菌的微生态调控作用。结果表明,3种芽胞杆菌浸种处理可以提高水稻根和茎部内生细菌群落的丰富度和均匀度,降低叶部内生细菌群落的丰富度和均匀度,显著增加根部内生细菌群落多样性。变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)是水稻根部和茎部共有优势菌门,厚壁菌门和芽胞杆菌属(Bacillus)是叶部共有优势菌门和属。芽胞杆菌浸种处理显著提高了叶部内生厚壁菌门和芽胞杆菌属的相对丰度,增加了根系和茎部组织内生细菌的分类单元OTU(Operational Taxonomic Units)数量,对叶部组织影响不明显;降低了茎部和叶部中参与各种代谢通路的内生细菌丰度,显著增加了根部参与代谢通路的内生细菌丰度。因此,3种芽胞杆菌浸种处理可以显著改变水稻根部、茎部和叶部内生细菌群落结构,改善水稻生长的微生态环境。

论文目录

• 1 研究材料和方法
•   1.1 试验地概况
•   1.2 试验设计
•   1.3 水稻种植与样本采集
•   1.4 抽提水稻内生细菌的基因组DNA
•   1.5 16S rDNA测序
•   1.6 数据处理与分析
• 2 结果分析
•   2.1 芽胞杆菌浸种后水稻样本内生细菌序列统计和多样性
•   2.2 芽胞杆菌浸种对水稻组织内生细菌群落结构的影响
•     2.2.1 芽胞杆菌浸种对内生细菌OTU的影响
•     2.2.2 芽胞杆菌浸种对水稻内生细菌门水平丰度的影响
•     2.2.3 芽胞杆菌浸种对水稻内生细菌纲水平丰度的影响
•     2.2.4 芽胞杆菌浸种对水稻内生细菌属水平丰度的影响
•   2.3 芽胞杆菌浸种后水稻组织内生细菌的共有和独有物种
• 3 讨论
• 4 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 沙月霞,沈瑞清

关键词: 芽胞杆菌,浸种,多样性,水稻内生细菌,群落结构

来源: 生态学报 2019年22期

年度: 2019

分类: 基础科学,农业科技

专业: 植物保护

单位: 宁夏农林科学院植物保护研究所

基金: 宁夏农林科学院科技先导资金项目(NKYJ-16-26),宁夏农林科学院全产业链创新示范项目(QCYL-2018-09),国家重点研发计划(2017YFD0201606),宁夏回族自治区重点研发计划重大项目(2018BBF02018-05)

分类号: S435.111.41

页码: 8442-8451

总页数: 10

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