桂枝茯苓胶囊基于生物信息学的药理网络及作用机制分析

论文摘要

目的 :探讨桂枝茯苓胶囊的药理网络及分子作用机制。方法 :应用BATMAN-TCM数据库,依据Perlman的相似性方法预测桂枝茯苓胶囊各中药成分的潜在靶标,构建蛋白相互作用网络（protein-protein interaction,PPI）并筛选核心靶标,对靶标进行基因组百科全书（Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）通路分析、基因本体（Gene Ontology）分析,探讨桂枝茯苓胶囊的药理作用网络及分子作用机制。结果 :通过batman数据库预测得到桂枝茯苓胶囊成分靶标801个,在cytoscape3.6.0计算网络拓扑结构值,通过节点参数值筛选出22个网络中的核心节点,如SRC、NOTCH1,各单味中药之间具有不同数目的共同靶标,说明它们之间可能存在某些协同或拮抗的相互作用;KEGG通路富集分析结果显示枝茯苓胶囊可能同神经活性配体-受体相互作用、钙信号途径和cGMP-PKG信号通路发挥药理作用,GO分析显示生物过程13个条目,参与生物学调节、代谢过程调控、刺激应答、细胞增殖等生物过程。结论 :本研究通过对各单味中药成分靶标的生物学分析,初步得出桂枝茯苓胶囊在分子水平上发挥疗效的作用通路及相关靶标分子参与的生物学过程,阐释了基于中医基础理论中药功效同现代药理活性的关联性,为进一步的试验研究提供分子基础和理论依据。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 成分及预测靶标
•   1.2 PPI网络的构建
•   1.3 KEGG通路富集分析
•   1.4 基因本体生物功能分析
• 2 结果
•   2.1 桂枝茯苓胶囊单味中药成分的靶标预测
•   2.2 桂枝茯苓胶囊PPI网络的构建
•   2.3 桂枝茯苓胶囊KEGG通路富集分析
•   2.4 桂枝茯苓胶囊靶标的基因本体生物功能分析
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 张晨,杨帆,宁映霞

关键词: 桂枝茯苓胶囊,生物信息学,数据库,蛋白蛋白交互网络,基因本体分析

来源: 湖南师范大学学报(医学版) 2019年02期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技,基础科学

专业: 生物学,中药学

单位: 广州市第一人民医院药学部临床药学科,广州医科大学附属第一医院体检中心,广州医科大学附属第一医院妇产科

基金: 广医大高水平大学建设科研教学学术提升项目-2018年高水平大学学术骨干培育计划(NO.B185004083)

分类号: R285;Q811.4

页码: 176-180

总页数: 5

文件大小: 1919K

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