导读:本文包含了编码外显子论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:基因,多态性,蛋白,密码子,汉族,卵泡,转录。
编码外显子论文文献综述
陈海迪[1]（2018）在《GPHA蛋白编码区中的Alu元件外显子化与功能化研究》一文中研究指出Alu元件对灵长类基因的调节以及基因组演化极其重要。不同基因中都发现了 Alu元件形成的新外显子产生,对于Alu外显子的功能研究也有很多。然而,Alu元件在蛋白编码区插入后的作用机制仍然未知。我们在35亿年前的糖蛋白激素共用的α亚基(GPHA)演化中发现插入了一个外显子—Alu-J,Alu-J外显子化在成熟GPHA多肽N端编码了额外的多肽(Alu-J编码的多肽),导致了剪接变异体Alu-GPHA出现在类人猿灵长类中。有趣的是,在类人猿的演化过程中发现Alu-J编码的多肽在猿系物种和人中发生了适应性进化。Alu-J编码的的多肽可以作为妊娠早期检测的一个新的Marker,并且能够延长人绒毛膜促性腺激素(HCG)的半衰期。而且,研究发现Alu-HCG无论是体内还是体外都是一个更高效的激素。我们的研究是第一个揭示了在蛋白编码区存在的Alu元件编码的多肽具有能够增加整个蛋白稳定性的功能,提供了 Alu外显子在蛋白编码区的潜在多种功能的研究。更重要的是,因为绒毛膜促性腺激素CG与绒毛膜受血的胎盘形成方式相关联,GPHA中的Alu-J外显子化及功能化为灵长类中绒毛膜受血的胎盘形成方式的演化提供了新的解释。(本文来源于《南京师范大学》期刊2018-05-28）
曹锡梅,罗旭光,张潮,郭大玮[2]（2018）在《LPS炎性刺激对SAF基因编码区外显子e4B保留和剪切的影响》一文中研究指出目的探讨LPS刺激对血清淀粉样蛋白A转录激活因子(SAF)外显子e4B保留和剪切的影响。方法 LPS刺激不同时间THP-1细胞和去除刺激后放线菌素D处理THP-1细胞的cDNA作模板进行半定量和定量聚合酶链式反应。结果 LPS刺激2h SAF基因外显子e4B保留的转录子表达下降、e4B剪切的转录子表达增高,延长刺激至24h,二者的表达呈下降趋势。LPS刺激12h和24h后去除刺激给予放线菌素D初始,上述转录子表达增高;延长放线菌素D作用至2h,二者表达下降。结论延长LPS刺激SAF基因外显子e4B保留和剪切的转录子表达下降可能和RNA降解有关。(本文来源于《解剖科学进展》期刊2018年03期）
周白玉,张兵,陈海明,王兴林,刘祖明[3]（2015）在《黔西南汉族人群表皮生长因子前体蛋白编码序列第14和16外显子中单核苷酸多态性研究》一文中研究指出背景与目的单核苷酸多态性(SNPs)在蛋白编码序列中多以富集成簇的方式分布,并提示其可能有民族区域和人种之间的差异性,然而SNPs在黔西南汉族人群表皮生长因子前体蛋白(prepro EGF)编码序列第14和16外显子中的分布状况迄今尚未见报道,本研究拟对35例黔西南汉族受试者进行研究,旨在分析SNPs在prepro EGF编码序列第14和16外显子中的分布特征。方法设计合成4条引物,分别对35例汉族受试者prepro EGF编码序列第14和16外显子区段进行PCR扩增和产物的DNA测序;检索单核苷酸多态性资料库(db SNP)获取资料并与测序结果进行对比分析。结果 35例黔西南汉族受试者中13例(37.1%)在prepro EGF编码序列的2 525 bp位点出现SNPs,基因型为AG和GG,频率分别为69.2%和30.8%,其等位基因频率分别为A 34.6%和G 65.4%;27例(77.1%)在2 576 bp位点有SNPs,基因型为AA和AG,频率分别为66.7%和33.3%,等位基因频率分别为A 83.3%和G 16.7%。相比之下,北京汉族受试者较黔西南汉族受试者在prepro EGF编码序列第14外显子内多了1个单核苷酸多态位点,即2 619 bp位点;欧美等其他民族不仅在prepro EGF编码序列第14外显子内分布有rs199935855等7个SNPs,而且在其第16外显子内也分布有rs149396988等6个SNPs;黔西南汉族和北京汉族受试者在prepro EGF编码序列的第16外显子内均未见有SNPs分布。结论在黔西南汉族、北京汉族和欧美等民族的prepro EGF编码序列第14和16外显子中,SNPs分别具有各民族、各种族的特征性分布,据此可区分不同地域的种族和人群,甚至进行个体识别。也可将这些呈特征性分布的SNPs视为遗传标记进而深入研究SNPs与疾病发生的关系。(本文来源于《中国全科医学》期刊2015年29期）
Mirabzadeh-Ardakani,A,晋大鹏[4]（2014）在《牛DEFB103基因的一个新的非编码外显子和单倍型变异的鉴定》一文中研究指出DEFB103基因是β-防御素基因家族的一员。本试验采用多套引物对DEFB103转录体进行扩增、鉴定。RT-PCR检测结果发现,cDNA的起点位于起始密码子前514~678bp,3′UTR为终止密码子后约53bp。5′UTR中存在7个SNPs,由4个不同的单倍型基因组DNA组成。对这些单倍型数据分析发现,目前在大多数牛中至少含有2个带有ATG起始密码子的DEFB103cDNA的完整拷贝,但大多数为不完整拷贝。试验在牛中检测到1个非编码外显子1a、1个261bp的内含子1a,随后在绵羊和山羊中也预测到。序列分析结果表明,DEFB103基因5′UTR区存在2种类型的缺失(4和8bp)。以上结果表明,这些拷贝可能不是后生成的。(本文来源于《中国畜牧兽医》期刊2014年10期）
杨秋丽,哈福,李大林,袁跃云,袁峰[5]（2013）在《牛科物种FSHβ基因外显子3编码区遗传多态性及其生物信息学分析》一文中研究指出促卵泡素是动物垂体前叶分泌的重要繁殖调控激素。采用PCR产物直接测序法对河流型和沼泽型水牛、牦牛和大额牛的FSHβ基因外显子3编码区进行群体变异检测,并进行了生物信息学分析。牛科物种FSHβ基因外显子3编码区均为231 bp。在水牛中共发现16个SNP位点,其中异义替换13个,推测4个异义替换对FSH功能有显着影响(subPSEC<-3)。沼泽型水牛中发现的SNP位点均与河流型水牛共享,但它们在两类水牛中的群体遗传组成不同。在普通牛、牦牛和大额牛中分别确定8,3,1个SNP位点,但只有SNP307是异义替换,普通牛与牦牛共享该位点,推测其对FSH功能无显着影响(subPSEC>-3)。在山羊中有11个SNP位点,8个为异义替换,推测只有SNP253对FSH功能有显着影响(subPSEC<-3)。在绵羊中有3个SNP位点,皆为同义替换。确定水牛特有的核苷酸位点4个,山羊特有的位点1个,普通牛、牦牛和大额牛共有的核苷酸位点4个,山羊和绵羊中共有的位点2个,这些位点编码氨基酸的差异可能引起了不同类型牛科物种间FSHβ亚基功能上的差异性。(本文来源于《华北农学报》期刊2013年02期）
苗永旺,哈福,高华山,袁峰,李大林[6]（2012）在《水牛、大额牛和牦牛抑制素α亚基编码基因外显子1多态性分析》一文中研究指出为了揭示牛科物种INHA基因的遗传特征,该文采用PCR产物直接测序法对水牛、大额牛和牦牛INHA基因外显子1及其侧翼序列进行多态性检测,并结合已发表的包括牛科物种在内的一些哺乳动物数据进行了比较分析。结果表明,在水牛INHA基因外显子1中存在c.73C>A替换,为同义替换,河流型和沼泽型水牛编码产物一致;在大额牛的INHA基因外显子1中发现c.62C>T、c.187G>A替换,分别引起INHA中氨基酸发生p.P21L、p.V63M改变,两者均为相同性质氨基酸的替换;在牦牛中发现c.62C>T、c.129A>G替换,前者也引起编码氨基酸发生p.P21L替换,后者为同义替换。在INHA基因5'侧翼区所测出的序列中,水牛、大额牛和牦牛等物种内均未发现SNP位点,但在种间发现存在c.-6T>G的替换,大额牛、牦牛和普通牛均为c.-6G,而水牛为c.-6T。在INHA基因内含子中,水牛的第31～36位核苷酸处发现有6个碱基的缺失,即c.262+31_262+36delTCTGAC;该位点在河流型水牛中野生型(+/+)占主体,而在沼泽型水牛中则缺失型(-/-)占主体。在大额牛、牦牛和普通牛等其它牛科物种的内含子中均未发现该缺失,但与水牛相比,大额牛、牦牛和普通牛内含子中发现缺失c.262+78_262+79delTG。序列比对显示,INHA基因外显子1序列中c.43A和c.67G为水牛中所特有,而c.173A和c.255G为大额牛、牦牛和普通牛所共有,c.24C、c.47G、c.174T和c.206T为山羊所特有。大额牛、牦牛和普通牛间INHA基因外显子1序列差异较小,而山羊和水牛与它们间的差异相对较大。(本文来源于《动物学研究》期刊2012年04期）
高燕,黄国英,吴琳,刘芳,马端[7]（2010）在《法洛四联症患儿VANGL2基因外显子及5'非编码区序列分析》一文中研究指出目的探讨中国法洛四联症患儿VANGL2基因的序列变化,观察该基因是否为法洛四联症发病的候选易感基因。方法应用PCR技术以及DNA测序方法,在100例法洛四联症患儿、200名心脏结构正常的健康儿童中,对VANGL2基因编码区全部8个外显子和第一外显子上游5'非编码区前1500bp左右的碱基序列进行测序。测序后获得的数据采用Mutation Surveyor Val V3.24软件分析后进行人工比对。对所有测序片段(本文来源于《中华医学会第十五次全国儿科学术大会论文汇编（上册）》期刊2010-09-23）
杨潇,胡军,陈祥贵[8]（2008）在《人类蛋白编码基因外显子谱和同义密码子偏好的研究》一文中研究指出从UCSC数据库提取基因序列,通过codon W软件进行密码子偏好性分析。比较分析不同外显子谱的人类蛋白编码基因密码子使用偏好,发现在多外显子基因中,随着基因外显子数增加,NNU和NNA型密码子RSCU值上升,NNC型密码子RSCU值下降,UUG密码子RSCU值增加,而其它NNG型密码子RSCU值下降。作为具有最少外显子数的基因,单外显子基因密码子RSCU值具有异常的表现,表明其具有和多外显子基因不同的起源和进化过程。(本文来源于《西华大学学报(自然科学版)》期刊2008年02期）
廖斐斐[9]（2007）在《甲状腺激素受体β基因新外显子的克隆及其编码产物在大肠杆菌中的表达》一文中研究指出甲状腺激素受体(thyroid hormone receptors，TRs)与糖皮质激素、雌激素以及孕激素等激素受体同属于核受体超家族成员。1972年Oppenheimer等运用标记的T_3在大鼠肝、肾组织细胞核中首次证实TR存在。目前研究表明编码甲状腺激素受体共有两个基因：TRα和TRβ，根据转录起始位置不同及可变性剪接，TRα基因可产生TRα_1，TRα_2，TRα_3，TR△α_1，TR△α_2；TRβ则产生TRβ_1，TRβ_2，TRβ_3，TR△β_3；其中TR△α_1，△α_2，△β_3分别是TRα_1，α_2，β_3的截短型同工体。我们在大鼠肝脏中发现了一种新的甲状腺激素受体亚型，它的cDNA序列比TRβ_1在相当于外显子3和4序列之间多108个碱基序列，已在NCBI的Gene bank注册，获得登记号DQ191165，命名为TRβ△。这是目前已知的唯一的加长型TR亚型，加长部分位于外显子3和4之间，很可能在TRβ内含子3-4内存在一个新的外显子。本文目的旨在克隆此108bp序列，表达其36个氨基酸残基的肽段，以期用作免疫原制备抗体。此抗体能特异识别TRβ△，从而检查其在各组织的分布和定位。我们利用聚合酶链反应(PCR)及反转录酶聚合酶链反应(RT-PCR)分别从含有TRβ△的大鼠肝脏的基因组文库和总RNA及普通大鼠的基因组DNA和总RNA四种模板中扩增和克隆出相同的TRβ基因新外显子，将目的片段连人pGEM-TEasy载体中，测序确证后，将其酶切后插入原核细胞表达载体pGEX-3X，构建了pGEX-3X／exon重组质粒，经DNA测序确定后，将其转化大肠杆菌DH5α进行融合表达，行SDS-PAGE电泳，查看表达产物大小和表达量，并经Western-blotting进一步鉴定。表达条件经优化后，重组蛋白的表达量达到10mg／L培养基，占菌体蛋白的21.78％。包涵体变性、复性后，经Glutathione Sepharose4B亲和层析纯化，凝胶分析系统扫描显示表达产物纯度为91.97％，透析保存。此GST-36肽融合蛋白即可作为免疫原备用。(本文来源于《天津医科大学》期刊2007-05-01）
王军,宗志红,欧绍武,王运杰,任成涛[10]（2007）在《编码脑组织Nav1.5钠通道新外显子的克隆、鉴定和分布》一文中研究指出Nav1.5电压-门控钠通道(VGSC)被认为是心肌的特异性通道,但最近的研究发现,该通道在脑组织尤其是边缘系统中亦广泛分布.此前,在对人神经母细胞瘤细胞钠通道的基因克隆中,发现Nav1.5/SCN5A基因的第6A外显子参与编码该通道.采用人及鼠脑组织,通过RT-PCR法对Nav1.5钠通道基因进行克隆发现:Nav1.5/SCN5A基因中的第6A外显子参与编码了该通道,而心肌等其他组织却是第6外显子参与编码该通道.人Nav1.5/SCN5A基因的第6A和第6外显子都定位于3号染色体,共有92个碱基,都可以编码产生30个氨基酸,但却有7个氨基酸不同.人和鼠脑组织Nav1.5/SCN5A基因的第6A外显子仅有一个碱基不同,却产生相同的氨基酸序列.RT-PCR法证实第6A外显子在鼠脑的不同部位表达不同,第6外显子在大鼠不同组织中的表达也不同,这为深入研究不同系统中Nav1.5钠通道的功能提供了基础.(本文来源于《生物化学与生物物理进展》期刊2007年03期）
编码外显子论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的探讨LPS刺激对血清淀粉样蛋白A转录激活因子(SAF)外显子e4B保留和剪切的影响。方法 LPS刺激不同时间THP-1细胞和去除刺激后放线菌素D处理THP-1细胞的cDNA作模板进行半定量和定量聚合酶链式反应。结果 LPS刺激2h SAF基因外显子e4B保留的转录子表达下降、e4B剪切的转录子表达增高,延长刺激至24h,二者的表达呈下降趋势。LPS刺激12h和24h后去除刺激给予放线菌素D初始,上述转录子表达增高;延长放线菌素D作用至2h,二者表达下降。结论延长LPS刺激SAF基因外显子e4B保留和剪切的转录子表达下降可能和RNA降解有关。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
编码外显子论文参考文献
[1].陈海迪.GPHA蛋白编码区中的Alu元件外显子化与功能化研究[D].南京师范大学.2018
[2].曹锡梅,罗旭光,张潮,郭大玮.LPS炎性刺激对SAF基因编码区外显子e4B保留和剪切的影响[J].解剖科学进展.2018
[3].周白玉,张兵,陈海明,王兴林,刘祖明.黔西南汉族人群表皮生长因子前体蛋白编码序列第14和16外显子中单核苷酸多态性研究[J].中国全科医学.2015
[4].Mirabzadeh-Ardakani,A,晋大鹏.牛DEFB103基因的一个新的非编码外显子和单倍型变异的鉴定[J].中国畜牧兽医.2014
[5].杨秋丽,哈福,李大林,袁跃云,袁峰.牛科物种FSHβ基因外显子3编码区遗传多态性及其生物信息学分析[J].华北农学报.2013
[6].苗永旺,哈福,高华山,袁峰,李大林.水牛、大额牛和牦牛抑制素α亚基编码基因外显子1多态性分析[J].动物学研究.2012
[7].高燕,黄国英,吴琳,刘芳,马端.法洛四联症患儿VANGL2基因外显子及5'非编码区序列分析[C].中华医学会第十五次全国儿科学术大会论文汇编（上册）.2010
[8].杨潇,胡军,陈祥贵.人类蛋白编码基因外显子谱和同义密码子偏好的研究[J].西华大学学报(自然科学版).2008
[9].廖斐斐.甲状腺激素受体β基因新外显子的克隆及其编码产物在大肠杆菌中的表达[D].天津医科大学.2007
[10].王军,宗志红,欧绍武,王运杰,任成涛.编码脑组织Nav1.5钠通道新外显子的克隆、鉴定和分布[J].生物化学与生物物理进展.2007
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