6株猪流行性腹泻病毒N基因的克隆与分析

论文摘要

为了解安徽省猪流行性腹泻病毒（PEDV）的遗传变异情况,采用胶体金试纸条检测安徽省境内发生疑似猪流行性腹泻病的病猪粪便（2013—2017年）;对PEDV抗原阳性猪样品,利用RT-PCR方法扩增其PEDV N基因,并进行测序和序列分析。结果发现,经胶体金试纸条检测确认了6个猪流行性腹泻发病猪场;对来自该6个猪场的病料样品或病毒传代培养物进行RT-PCR扩增和测序,共获得6株PEDV流行毒株的N基因序列,其序列全长均为1 326 bp,将其分别命名为N12、N22、N32、N42、N52和N62。核苷酸同源性分析显示,6株PEDV分离株N基因之间序列同源性为94.8%～99.8%。其中,5株PEDV分离株（N12、N22、N32、N52和N62）与PEDV疫苗株、经典毒株、2011年之前的我国分离株（LZC、CHS）的同源性较低（94.1%～96.3%）,亲缘关系较远;与2011年后国内外PEDV分离株存在较高同源性（96.9%～99.2%）,亲缘关系较近;而N42正好相反。该研究表明,近年来安徽各地猪场以PEDV新变异毒株的流行为主。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 主要试剂、材料
•   1.2 病料来源和处理
•   1.3 引物设计
•   1.4 PCR扩增
•   1.5 序列分析
• 2 结果
•   2.1 基因克隆与测序
•   2.2 基因同源性分析
•   2.3 PEDV N基因遗传进化分析
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 潘孝成,沈学怀,赵瑞宏,戴银,胡晓苗,侯宏艳,周学利,张丹俊

关键词: 猪流行性腹泻病毒,基因,克隆,序列分析

来源: 畜牧与饲料科学 2019年09期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,畜牧与动物医学

单位: 安徽省农业科学院畜牧兽医研究所

基金: 安徽省科技重点研发项目(1704a07020066),安徽省农业科学院平台项目(2019YL065),安徽省农业科学院创新团队(13C0405),安徽省生猪产业技术体系项目(AHCYTX-05-09),安徽省科技重大专项(17030701008)

分类号: S852.651

页码: 23-26

总页数: 4

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