论文摘要
近20年来,斑马鱼逐渐成为研究人类基因功能的重要模型动物。同时,通过对斑马鱼参考基因组序列和10 000多个蛋白编码基因的鉴定,表明斑马鱼至少与人类基因有75%的同源性,进一步验证了斑马鱼基因组序列可以作为衰老的研究模型。此外,其良好保守的分子和细胞生理学的广泛特征使斑马鱼成为揭示衰老、疾病和修复的潜在机制的极好模型。但是斑马鱼衰老的分子机制很少发生分子间的相互作用,因此蛋白质-蛋白相互作用（PPI）网络是非常可取的。本实验描述了斑马鱼这种生物衰老机制的模型,其涵盖了与衰老相关的87种蛋白质之间的767种相互作用。这不仅包含准确预测的PPI,还包含从文献收集以及实验所得的那些分子相互作用。同时,将这些分子相互作用模块化,形成模块化,找到11个中心基因,分析预测其衰老过程。希望能帮助研究斑马鱼的学者研究其衰老过程,提供一些假说和帮助。
论文目录
文章来源
类型: 期刊论文
作者: 李雷,蒋林华
关键词: 斑马鱼,衰老分子机制,模块化,中枢基因
来源: 生物信息学 2019年03期
年度: 2019
分类: 基础科学
专业: 生物学
单位: 上海理工大学现代光学系统重点实验室
基金: 国家自然科学基金上海市高等学校特聘教授项目(东方学者,15HJPY-MS02,No.61775139)
分类号: Q811.4
页码: 175-181
总页数: 7
文件大小: 2960K
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