导读:本文包含了序列多态性论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:多态性,序列,基因,线粒体,斯坦,叶绿体,法医学。
序列多态性论文文献综述
王海丽,张静,钱文莉[1]（2019）在《河南地区汉族人群20个短串联重复序列位点遗传多态性分析》一文中研究指出目的探讨河南地区汉族人群CSF1PO、D12S391、D13S317、D16S539、D18S51、D19S433、D1S1656、D21S11、D2S1338、D3S1358、D5S818、D6S1043、D7S820、D8S1179、FGA、Penta D、Penta E、TH01、TPOX、vWA共20个短串联重复序列(STR)位点的遗传多态性分布情况。方法选取河南地区无血缘关系汉族个体94例,其中男性46例,女性48例;年龄18～40岁,平均年龄29岁。用磁珠法提取受试者的外周血DNA样本,采用多重聚合酶链反应扩增技术和荧光检测技术对20个常染色体STR基因座进行复合扩增,并使用ABI 3500遗传分析仪进行基因分型。GeneMapper v3.2软件进行等位基因数据分析。结果 20个STR位点的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡,具有群体代表性(P> 0.05)。20个STR位点的个体识别率、多态性信息含量、非父排除率、杂合度分别为0.785 2～0.978 6、0.547 9～0.916 6、0.296 2～0.775 3、0.604 4～0.890 1,其中Penta E位点的个体识别率和非父排除率最高,分别为0.978 6和0.775 3。20个STR位点的累计个体识别率和累计非父排除率均> 99.999 999%。结论 20个STR位点在河南地区汉族人群中具有群体代表性,且其具有较高的个体识别率和非父排除率,在法医学和群体遗传学研究中具有一定的应用价值。Penta E位点具有高度个体识别能力和鉴别能力,可作为核心位点用于法医个体识别和亲权关系鉴定中。(本文来源于《生物医学工程与临床》期刊2019年06期）
张力鹏,滕彦娇,宋文芹,陈成彬[2]（2019）在《西藏地区红景天属植物ITS,rbcL,trnS-G序列多态性分析》一文中研究指出以西藏红景天为研究材料,利用DNA条形码(核糖体内转录间隔区ITS以及两对叶绿体DNA序列rbcL和trnS-G),对所收集的44个样品进行克隆与测序,并结合NCBI中已报道的22种红景天ITS,rbcL,trnS-G序列进行分析.利用Mega5.0软件基于DNA条形码序列分析上述样本的遗传距离结果显示,ITS和trnS-G序列在红景天属植物种间的差异明显,rbcL序列的差异较小.所构建的N-J进化树结果显示ITS对红景天物种的识别能力优于rbcL和trnS-G,但任何单一的DNA条形码均无法成功辨识全部的红景天属植物.其中ITS序列可以清晰的分辨出大花红景天与圣地红景天,并且不同地理居群间的样本差异较小,rbcL+trnS-G组合DNA条形码可以清晰分辨出长鞭红景天.本研究对西藏红景天属植物进行了遗传多样性分析,为其开发与利用提供指导.(本文来源于《南开大学学报(自然科学版)》期刊2019年05期）
李显,龙开旭,俸祥仁,潘堂峰,李铭[3]（2019）在《河流型水牛热休克蛋白70(HSP70)基因CDS序列的多态性分析》一文中研究指出为了研究河流型水牛HSP70基因CDS序列的多态性,试验首先从摩拉水牛、尼里/拉菲水牛、槟榔江水牛、地中海水牛冷冻精液中抽提基因组DNA,以基因组DNA为模板扩增获得河流型水牛HSP70基因,对其进行基因克隆,测序,序列分析;其次对26头摩拉水牛、43头尼里/拉菲水牛HSP70基因CDS序列进行测序、高分辨率熔解曲线检测分析。结果显示:河流型水牛的HSP70基因CDS序列长度为1 927 bp,4个品种HSP70基因CDS序列相似度高达99%以上;摩拉、尼里/拉菲种公牛HSP70基因CDS序列存在相同的SNP位点,分别是C602T、A708T、A1284G,并产生不同的基因型。摩拉公牛HSP70基因CDs区602 bp位点、尼里/拉菲602 bp位点处于Hardy-Weinberg不平衡状态。试验结果说明了HSP70基因在进化上具有高度保守性,但在同一群体中存在多态性。(本文来源于《上海畜牧兽医通讯》期刊2019年05期）
王艳艳,郦银芳,张莉,王晓花[4]（2019）在《儿童STING基因启动子区序列多态性分析》一文中研究指出目的:分析儿童外周血干扰素基因刺激因子(stimulator of interferon genes,STING)启动子-436～+267区域序列变化。方法:采用PCR产物直接测序的方法,对48例儿童的STING基因启动子区进行序列分析,构建重组报告质粒pGL-3/STING(TT)和pGL-3/STING(CC),转染人类胚胎肾(human embryonic kidney,HEK)293T细胞,检测其荧光素酶活性,计算相对活性单位(the relative luciferase activity unit,RLU)。结果:发现STING基因启动子区的1个新的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点(-401)T/C;该位点TT、TC、CC这3种基因型的频率分布分别为45.8%、37.5%、16.7%;经酶切、测序鉴定,成功构建了含有该位点的STING启动子序列(-436～+267)的表达质粒pGL-3/STING(TT)和pGL-3/STING(CC)。与pGL-3/STING(TT)质粒比较,pGL-3/STING(CC)启动子的RLU明显降低。结论:STING基因(-401)T/C是一个新的SNP,该SNP可降低STING基因启动子的活性,进而可能影响基因的转录调控,影响机体对疾病的易感性。(本文来源于《南京医科大学学报(自然科学版)》期刊2019年10期）
王彩凤,陈葳,李旭[5]（2019）在《应用富含GC区SNP分型的序列特异性PCR新方法检测子宫内膜癌特定位点C729T多态性》一文中研究指出目的建立适合富含GC区SNP分型的序列特异性PCR方法,分析子宫内膜癌特定ERαExon3位点C729T多态性基因分型。方法选择22例子宫内膜癌患者与42例良性病患者为研究对象。建立富含GC区序列特异性PCR(SS-PCR)。将两对引物分别进行PCR扩增,所设计的两条特异性引物即内引物分别与DNA双链的两条单链相同,其3′端正好与SNP位点重合,由引物的3′端控制着引物的延伸反应,根据延伸产物的条带确定SNP类型;并通过在引物的3′端区域倒数第3位引入一个人为不匹配碱基来提高延伸反应的特异性。应用该方法鉴别Exon3 SNP位点C729T基因型,并通过直接测序法验证。结果建立的序列特异性PCR方法适合富含GC区SNP分型,能够准确分析子宫内膜癌的特定ERαExon3位点C729T多态性基因分型。结论富含GC区SNP分型的序列特异性PCR方法,可以用于子宫内膜癌的特定ERαExon3位点C729T多态性基因分型。(本文来源于《西安交通大学学报(医学版)》期刊2019年06期）
刘丽霞,张丽,欧阳霞辉,乔自林,付保强[6]（2019）在《荷斯坦牛DRA基因多态性及序列特征分析》一文中研究指出为探讨荷斯坦牛DRA基因的多态性及序列特征,本研究采用基因组DNA混合池扩增并直接测序的方法对荷斯坦牛DRA基因编码区进行多态性分析,同时利用生物信息学方法预测DRA基因的理化特性及其编码蛋白的高级结构。结果表明,荷斯坦牛DRA基因编码区上有4个碱基突变,包含1个错义突变和3个同义突变。DRA基因共编码253个氨基酸,编码产物是一种稳定的不可溶蛋白,具有15个潜在的磷酸化位点,二级结构为混合型,叁级结构由α-螺旋、β-折迭、β-转角和无规则卷曲组成。本研究结果为荷斯坦牛的疾病相关基因筛选和抗病分子育种提供了一定的理论依据。(本文来源于《核农学报》期刊2019年11期）
忻雅,方献平,王淑珍,童建新,来文国[7]（2019）在《简单重复序列标记和序列相关扩增多态性标记在草莓遗传多样性分析中的比较》一文中研究指出利用简单重复序列(simple sequence repeat, SSR)和序列相关扩增多态性(sequence related amplified polymorphism, SRAP)标记分析了来自国内外43个草莓品种的遗传多样性,并比较了这2种分子标记的效果差异。结果表明:30对SSR引物平均多态性位点数为6.43个,每个位点的平均多态性信息含量(polymorphism information content, PIC)值为0.628 4;20个SRAP引物组合平均多态性位点数为14.30个,PIC值高达0.911 4。基于SSR标记的聚类结果与基于SRAP标记的聚类结果的相关系数为0.817,呈显着水平。而SSR标记、SRAP标记分别与SSR+SRAP联合标记的相关系数为0.938和0.966,都达到极显着水平。SSR和SRAP标记都能较好地分析草莓遗传多样性,其中SRAP标记的效果略优于SSR标记,而SSR+SRAP联合标记分析则能更好地评估种质的遗传多样性和亲缘关系。(本文来源于《浙江大学学报(农业与生命科学版)》期刊2019年03期）
谭磊,王爱兵,孔小鲜,梁轩,贺峻琳[8]（2019）在《湖南省不同种类蛇源裂头蚴线粒体pnad1基因序列多态性研究》一文中研究指出目的对湖南省不同种类蛇源裂头蚴进行形态学与分子生物学鉴定,并分析其线粒体烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶第1亚基基因部分序列(pnad1)多态性。方法对从湖南永州、郴州、岳阳等地区6种常见的野生蛇体内获得的11条裂头蚴(来自大王蛇3条、乌梢蛇2条、眼镜蛇1条、灰鼠蛇2条、滑鼠蛇2条和银环蛇1条)进行形态学鉴定,PCR扩增其线粒体pnad1,并测序,分析其核苷酸序列种内差异,并与已报道的迭宫属绦虫和其他属绦虫的相应序列进行同源性比较;以土耳其斯坦东毕吸虫为外群,用软件MEGA7.0采用邻接法构建系统进化树。结果从不同蛇类分离的11条虫体经形态学鉴定为裂头蚴。PCR扩增出11条裂头蚴分离株的nad1序列,片段大小为648 bp,种内遗传差异分别为0～1.4%。与GenBank中收录的欧猬迭宫绦虫分离株序列相似性为97.8%～99.3%,与其它绦虫的序列相似性均低于74.3%。系统进化树结果显示,本研究分离的不同蛇源裂头蚴分离株与已知欧猬迭宫绦虫聚为一支,与微小膜壳绦虫和阔节裂头绦虫亲缘关系较近,与其它绦虫分支相隔较远。结论湖南省不同蛇源裂头蚴分离株均为欧猬迭宫绦虫,但存在一定的遗传变异,且线粒体pnad1基因适合作为分子标记对蛇源裂头蚴进行遗传变异研究。(本文来源于《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》期刊2019年04期）
陈竹[9]（2019）在《DNA修复基因DDB2 3'-UTR miRNA靶序列多态性与肝细胞癌遗传易感性的关联研究》一文中研究指出目的:探讨损伤特异性结合蛋白2(damage specific DNA binding protein2,DDB2)基因3'非翻译区(3’-untranslated region,3’UTR)miRNA靶序列单核苷酸多态位点(single nucleotide polymorphism,SNP)rs1050244 C>T与广西地区人群肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)遗传易感性的关系,探索HCC的发病机制。方法:采用以医院为基础的病例-对照研究,以2007年1月——2011年4月广西医科大学第一附属医院和附属肿瘤医院的HCC患者1073例和同期上述医院非肿瘤对照1119例为研究对象。应用Sequenom MassARRAY技术对DDB2基因3'-UTR区域miRNA结合序列SNP rs1050244 C>T进行基因分型。研究中病例组和对照组研究对象一般资料比较采用χ~2分析。应用多因素Logistic回归方法计算该SNP基因型与HCC发病风险的比值比(Odds ratios,OR)和95%置信区间(95%Confidence intervals,95%CI)及其与环境的交互作用。结果:一般资料比较结果显示,病例组和对照组的年龄分组、性别频率分布差异均无统计学意义(P>0.05);而病例组吸烟、饮酒及乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染等因素的频率显着高于对照组(P<0.05)。经校正年龄、性别、吸烟、饮酒和HBV感染等因素,未发现rs1050244 C>T基因型与HCC易感性显着关联。在显性遗传模型下,进一步按年龄分组、性别、吸烟、饮酒与HBV感染等因素进行分层分析,结果发现,在未感染HBV人群中,与携带rs1050244 CC基因型者相比,CT/TT基因型者罹患HCC的风险明显降低(OR=0.31,95%CI=0.13-0.72,P=0.006);基因-环境交互作用分析结果显示,HBV感染与rs1050244位点多态性存在交互作用(P_(交互)=0.002)。结论:DDB2基因3'-UTR区域rs1050244多态性与HCC易感性显着关联,但此关联仅存在于非HBV感染者中。本研究结果可进一步在更大样本人群中进行验证。(本文来源于《桂林医学院》期刊2019-06-01）
赵宗苹,严媛,郑梅梅,刘小莉[10]（2019）在《滇龙胆基于叶绿体psbA-trnH、trnL-trnF序列多态性遗传评价》一文中研究指出目的研究云南各地区包括8个居群116个样品的滇龙胆Gentiana rigescens Franch. ex Hemsl.的遗传多样性,分析滇龙胆遗传分化和遗传结构,评价其遗传变异。方法采用试剂盒按照个体提取滇龙胆的DNA,扩增其叶绿体基因psbA-trnH、trnL-trnF并测序,两个片段拼接后综合分析。结果序列中存在22个变异位点并构成11种单倍体类型,滇龙胆的遗传多样性指数(Hd)为0.737,居群间的遗传分化系数(Gst)为0.37632、基因流(Nm)为0.41,地理区域间Gst为0.19680,Nm为1.02。结论滇龙胆具有较高的遗传多样性,且其遗传变异主要出现在居群间,而2个叶绿体DNA片段在滇龙胆的产地鉴别中意义有限,品质差异的形成可能跟环境因子有较大的关系。(本文来源于《时珍国医国药》期刊2019年05期）
序列多态性论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
以西藏红景天为研究材料,利用DNA条形码(核糖体内转录间隔区ITS以及两对叶绿体DNA序列rbcL和trnS-G),对所收集的44个样品进行克隆与测序,并结合NCBI中已报道的22种红景天ITS,rbcL,trnS-G序列进行分析.利用Mega5.0软件基于DNA条形码序列分析上述样本的遗传距离结果显示,ITS和trnS-G序列在红景天属植物种间的差异明显,rbcL序列的差异较小.所构建的N-J进化树结果显示ITS对红景天物种的识别能力优于rbcL和trnS-G,但任何单一的DNA条形码均无法成功辨识全部的红景天属植物.其中ITS序列可以清晰的分辨出大花红景天与圣地红景天,并且不同地理居群间的样本差异较小,rbcL+trnS-G组合DNA条形码可以清晰分辨出长鞭红景天.本研究对西藏红景天属植物进行了遗传多样性分析,为其开发与利用提供指导.
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
序列多态性论文参考文献
[1].王海丽,张静,钱文莉.河南地区汉族人群20个短串联重复序列位点遗传多态性分析[J].生物医学工程与临床.2019
[2].张力鹏,滕彦娇,宋文芹,陈成彬.西藏地区红景天属植物ITS,rbcL,trnS-G序列多态性分析[J].南开大学学报(自然科学版).2019
[3].李显,龙开旭,俸祥仁,潘堂峰,李铭.河流型水牛热休克蛋白70(HSP70)基因CDS序列的多态性分析[J].上海畜牧兽医通讯.2019
[4].王艳艳,郦银芳,张莉,王晓花.儿童STING基因启动子区序列多态性分析[J].南京医科大学学报(自然科学版).2019
[5].王彩凤,陈葳,李旭.应用富含GC区SNP分型的序列特异性PCR新方法检测子宫内膜癌特定位点C729T多态性[J].西安交通大学学报(医学版).2019
[6].刘丽霞,张丽,欧阳霞辉,乔自林,付保强.荷斯坦牛DRA基因多态性及序列特征分析[J].核农学报.2019
[7].忻雅,方献平,王淑珍,童建新,来文国.简单重复序列标记和序列相关扩增多态性标记在草莓遗传多样性分析中的比较[J].浙江大学学报(农业与生命科学版).2019
[8].谭磊,王爱兵,孔小鲜,梁轩,贺峻琳.湖南省不同种类蛇源裂头蚴线粒体pnad1基因序列多态性研究[J].中国寄生虫学与寄生虫病杂志.2019
[9].陈竹.DNA修复基因DDB23'-UTRmiRNA靶序列多态性与肝细胞癌遗传易感性的关联研究[D].桂林医学院.2019
[10].赵宗苹,严媛,郑梅梅,刘小莉.滇龙胆基于叶绿体psbA-trnH、trnL-trnF序列多态性遗传评价[J].时珍国医国药.2019
论文知识图
