随机多态性扩增论文-尹明华,占学林,徐文慧,谢妮妮,蔡红

随机多态性扩增论文-尹明华,占学林,徐文慧,谢妮妮,蔡红

导读:本文包含了随机多态性扩增论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:叁叶青,种质资源,遗传多样性,随机扩增多态性DNA

随机多态性扩增论文文献综述

尹明华,占学林,徐文慧,谢妮妮,蔡红[1](2018)在《叁叶青种质资源遗传多样性的随机扩增多态性DNA分析》一文中研究指出利用RAPD技术对64个叁叶青种质资源样本进行遗传多样性分析,从40对引物中筛选出10对引物进行批量PCR实验。结果表明:64个叁叶青样本的观测等位基因数(Na)为1. 666 7~2. 000 0,有效等位基因数(Ne)为1. 247 9~1. 701 3,Nei’s基因多样性指数为0. 167 0~0. 398 4,Shannon多样性指数(I)为0. 262 8~0. 583 0,平均多态位点为7. 5,平均多态百分数为93. 145%;在遗传相似系数0. 720 56处,可以将64个叁叶青样本分成11大类;在遗传相似系数0. 697 04处,则可将64个叁叶青样本分成4大类;聚类分析的结果与种源的地理距离存在不一致性,这可能与种质资源库的地形、气候等自然因素有关。表明所测叁叶青种质资源遗传多样性丰富,具有一定的开发利用价值,可为合理保护叁叶青的基因资源及其遗传改良提供科学依据。(本文来源于《浙江农业学报》期刊2018年11期)

王羽,董文龙,张喜庆,马红霞,高云航[2](2017)在《随机扩增多态性DNA技术对绿色气球菌的相关性分析》一文中研究指出随着分子生物学的发展,16S、23S rRNA以及16S~23S rRNA已应用于菌种鉴定。16S~23S rRNA的基因间隔区相对于前两者有较高的变异性,弥补了16S和23S rRNA保守性强,分化程度不够的缺点。本研究对7株绿色气球菌和两株屎肠球菌扩增16S~23S rRNA基因间隔序列。通过随机扩增多态性DNA技术分析绿色气球菌DNA,评价不同菌株间的克隆相关性及耐药性。(本文来源于《中国兽药杂志》期刊2017年12期)

刘雪,邢益平,严玉娟,韩亚萍,严友德[3](2017)在《随机扩增多态性技术联合荧光定量高敏检测叁种疱疹病毒方法的建立》一文中研究指出目的:建立一种随机扩增多态性技术(RAPD)联合荧光定量聚合酶链式反应(q PCR)高敏定量检测单纯疱疹病毒(HSV)、人类巨细胞病毒(HCMV)、水痘带状疱疹病毒(VZV)的新方法。方法:根据文献筛选出数十条随机引物,分别对叁种疱疹病毒进行随机扩增,产物经2%琼脂糖凝胶电泳,选取稳定清晰条带进行分离、纯化及克隆测序,应用blast-nr比对genebank现有病毒序列,选取高于99%匹配度的基因序列作为目的片段,并在其内部用primer3.0设计特异性内引物。经过引物筛选及条件优化后建立RAPD联合q PCR检测新方法,分别检测叁种疱疹病毒。结果:经过筛选,确定了HSV、HCMV、VZV扩增灵敏性及特异性最好一组引物,建立的RAPD-q PCR可分别检测出1:10~6 HSV、1:10~5 HCMV和1:10~5 VZVDNA,而单一q PCR仅能检测1:10~3 HSV、1:10~2HCMV和1:103 VZVDNA。RAPD-q PCR相比于单一q PCR灵敏性提高100-1000倍,RAPD-q PCR扩增大于1:10~5病毒DNA得到的CT值均小于22.96±0.81,与10~2 copies/μL的标准线相距远,易于区分阴性和阳性。此外,用乙型肝炎病毒及疱疹病毒互为对照未见非特异扩增,特异性好。结论:随机扩增多态性技术联合荧光定量是一种检测叁种病毒高度灵敏及特异的检测方法。(本文来源于《现代生物医学进展》期刊2017年21期)

杨艳平,时晓玉,张颖,李文,王洁娣[4](2017)在《1例阴道定植阿萨希毛孢子菌的基因鉴定及随机扩增多态性DNA分析》一文中研究指出报道1例阿萨希毛孢子菌阴道定植病例。1例25岁健康妇女偶有阴道分泌物稍增多及轻微瘙痒。妇科检查见少量淡黄色均质化分泌物附着于阴道黏膜,阴道分泌物Nugent评分3分。对两次阴道分离菌株进行形态学观察、温度试验、尿素酶试验、药敏试验、3个rDNA基因测序及随机扩增多态性DNA(RAPD)分析。间隔3个月两次阴道分泌物培养均分离出土黄色、表面皱褶的酵母样菌落。该菌在25~37℃生长良好,最佳生长温度为27℃。小培养可见分隔菌丝、假菌丝、关节菌丝、分生孢子、关节孢子和芽生孢子。尿素酶试验阳性。3个rDNA基因测序和RAPD分析显示两次分离菌株为同一种阿萨希毛孢子菌。E-test和Neo-Sensitabs药敏试验发现本菌株对伏立康唑敏感。随访3个月患者仍无明显症状。(本文来源于《中国真菌学杂志》期刊2017年01期)

牛佳牧,李梓僮,曲莉[5](2016)在《龟甲及其伪品随机扩增DNA多态性(RAPD)鉴定方法研究》一文中研究指出目的建立一种快速、准确的龟甲及其伪品随机扩增DNA多态性(RAPD)鉴定方法,为龟甲的鉴别提供可靠依据.方法采用盐析法从龟甲及其伪品中提取mt DNA,并进行随机DNA多态性扩增.结果通过电泳图谱明显看出正品龟甲与其常见伪品mt DNA随机扩增产物条带数量和位置均不同,说明本文建立的方法可以有效区分正品龟甲与其常见伪品.结论 RAPD技术为龟甲及其伪品的鉴别提供一种简单、有效、可信度高的方法.(本文来源于《北华大学学报(自然科学版)》期刊2016年06期)

武中庸,倪春霞,赵吴静,蒲万霞[6](2016)在《牛源金黄色葡萄球菌随机扩增多态性分型》一文中研究指出利用引物AP7建立随机引物多态性扩增体系对176株引起我国不同地区奶牛乳房炎的金黄色葡萄球菌分离株进行基因分型研究。结果表明,176株金黄色葡萄球菌均得到清晰的RAPD指纹图谱,扩增产物为2~9条带,产物大小为240~4500bp。菌株共分为12个基因型,其中Ⅰ型35株(20%);Ⅱ型和Ⅷ型各7株(各4%);Ⅲ型和Ⅺ型各6株(各3.4%);Ⅳ型17株(9.8%);Ⅴ型4株(2.2%);Ⅵ型43株(25%);Ⅶ型各12株(6.9%);Ⅸ型和Ⅻ型各9株(5.2%);Ⅹ型3株(1.7%)。Ⅰ型和Ⅵ型菌株占总菌株数45%以上,为主要流行的优势菌群。各地区基因型菌株分布比例有明显差异,可能与奶牛养殖业水平和环境差异有关。(本文来源于《中国畜牧兽医学会动物微生态学分会第五届第十二次全国学术研讨会论文集》期刊2016-11-04)

向玉[7](2016)在《肺炎克雷伯菌AmpC酶基因分型和随机扩增DNA多态性研究》一文中研究指出目的了解我院肺炎克雷伯菌AmpC酶的基因分型及耐药情况,指导临床合理使用抗生素。方法采用K-B法初筛出可疑产AmpC酶的菌株,再用叁维试验检测产AmpC酶的情况,用多重PCR进行基因分型、随机扩增DNA多态性技术进行同源性的分析。结果从临床260株肺炎克雷伯菌中初筛出57株可疑产AmpC酶的菌株,叁维试验检测57株菌中AmpC酶阳性有51株,产AmpC酶的肺炎克雷伯菌大多数是DHA型占90%,只有很少一部分产MIX型占6%、FOX型占2%和ACC型占2%。通过15种药物对产AmpC酶肺炎克雷伯菌耐药性的分析,51株对亚胺培南的敏感性为98.0%,对头孢西丁耐药性为100%,对其他第叁代头孢菌素的耐药性均超过70%。结论我院临床分离产AmpC酶的肺炎克雷伯菌主要基因型是DHA型,且呈多重耐药。(本文来源于《四川解剖学杂志》期刊2016年03期)

严玉娟,邢益平,施旭东,严友德,艾月梅[8](2016)在《随机扩增多态性技术联合荧光定量PCR检测结核分枝杆菌方法的建立》一文中研究指出目的结合随机扩增多态性技术(RAPD)和荧光定量聚合酶链式反应技术(qPCR)的优势,建立快速、准确地检测结核分枝杆菌的新方法。方法根据国内外文献设计随机引物,以结核分枝杆菌标准菌株H37Rv为模板进行RAPD,产物进行琼脂糖凝胶电泳,选取条带进行割胶纯化测序,在美国国家生物技术信息中心(NCBI)的基本局部比对搜索工具(BLAST)程序上进行同源性检索,结果和结核分枝杆菌匹配率都达到99%。设计特异性内引物和探针,以RAPD产物为模板进行qPCR,并优化反应条件。分别以10倍梯度稀释的一系列浓度的H37Rv和其他阴性对照菌为模板,进行qPCR和RAPD-qPCR,分析其灵敏性和特异性。结果 qPCR能够检测到30pg/μl的结核分枝杆菌,而RAPD-qPCR灵敏性提高到3fg/μl。而且RAPD-qPCR检测30pg/μl至30fg/μl的结核分枝杆菌核酸时,扩增得到的Ct值都较小[(6.58±0.19)~(14.95±0.36)],结果稳定,易于判断。qPCR和RAPD-qPCR检测其他临床常见的细菌均呈现阴性。结论 RAPD-qPCR是一种快速、准确地检测出结核分枝杆菌的新方法。(本文来源于《江苏医药》期刊2016年11期)

严玉娟[9](2016)在《随机扩增多态性技术联合荧光定量PCR检测结核分枝杆菌方法的建立与评估》一文中研究指出背景:结核病(Tuberculosis,TB)是由结核分枝杆菌引起的一种慢性呼吸道传染病,严重危害人类的健康,曾夺去了数亿人的生命。近年来,随着人口流动的增加,HIV感染的流行,多耐药位点的出现,结核病的流行又出现回升。因此,早期、快速、准确地诊断结核分枝杆菌的感染对于疾病的治疗和控制传播具有重要的意义。传统的涂片染色镜检敏感性较低,培养法耗时较长,操作繁琐。免疫学检测受到受试者免疫状态的影响,容易出现假阳性和假阴性。分子生物学检测方法如荧光定量PCR、巢式PCR、环介导的等温扩增技术及Xpert MTB/RIF技术大大提高了结核病的诊断效率,但是对于涂片阴性的结核病、肺外结核、小儿结核以及和HIV共感染的结核病,诊断的敏感性不够理想。目的:鉴于实验室诊断结核性疾病的局限性,本研究设计一种更简便、快速,灵敏性更高、特异性更强的方法用于辅助诊断结核性疾病。方法:以结核分枝杆菌标准菌株H37Rv为模板,根据国内外文献设计随机引物,进行RAPD,产物进行琼脂糖凝胶电泳,选取条带进行割胶纯化测序,在NCBI上进行BLAST同源性检索,结果和结核分枝杆菌匹配率都达到99%。设计特异性内引物和探针,以RAPD产物为模板进行荧光定量PCR,并优化反应条件。分别以10倍倍比梯度稀释的H37Rv和其他阴性对照菌为模板,进行qPCR和RAPD-qPCR,分析其灵敏性和特异性,建立了 RAPD-qPCR的方法来检测结核分枝杆菌。进一步优化反应条件,采集150个结核性临床标本和26个非结核性临床标本(包括痰液、支气管肺泡灌洗液、胸水),分别用结核分枝杆菌核酸检测试剂盒(PCR-荧光法)和RAPD-qPCR方法检测,评估两种方法检出率的差别。结果:qPCR能够检测到30 pg/μl的结核分枝杆菌,而RAPD-qPCR灵敏性提高到3 fg/μl。而且RAPD-qPCR检测30 pg/μl至30 fg/μl的结核分枝杆菌核酸时,扩增得到的Ct值都较小,为(6.58±0.19)~(14.95±0.36),结果稳定,易于判断。qPCR和RAPD-qPCR检测其他临床常见的细菌均呈现阴性,特异性达到了100%。RAPD-qPCR对150个结核性标本检出率达到27.33%,结核分枝杆菌核酸检测试剂盒(PCR-荧光法)检出率为22.67%,差异具有统计学意义。两种方法检测26个非结核性临床标本结果均呈现阴性,两种方法特异性都达到100%。结论:该方法对于临床结核分枝杆菌感染具有较高的检出率,优于传统的结核分枝杆菌核酸检测试剂盒(PCR-荧光法),特异性也达到100%,能够用于临床结核分枝杆菌感染的分子生物学检测。(本文来源于《南京医科大学》期刊2016-04-01)

盛瑜,孙景昱,李明成,张丽华,李洪宇[10](2015)在《鹿鞭及其伪品随机扩增DNA多态性鉴定方法研究》一文中研究指出目的建立鹿鞭及其伪品随机扩增DNA多态性(RAPD)鉴定方法,为鹿鞭的鉴别提供可靠依据.方法采用柱层析法从鹿鞭及其伪品中提取线粒体DNA并进行随机DNA多态性扩增.结果正品鹿鞭(梅花鹿鞭和马鹿鞭)与其常见伪品(牛鞭)线粒体DNA随机扩增产物的电泳图谱有明显区别,条带数量和位置均不同,说明本方法可以有效区分正品鹿鞭与其常见伪品.结论 RAPD技术可为鹿鞭及其伪品的鉴别提供一种简单、有效、可信度高的方法.(本文来源于《北华大学学报(自然科学版)》期刊2015年05期)

随机多态性扩增论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

随着分子生物学的发展,16S、23S rRNA以及16S~23S rRNA已应用于菌种鉴定。16S~23S rRNA的基因间隔区相对于前两者有较高的变异性,弥补了16S和23S rRNA保守性强,分化程度不够的缺点。本研究对7株绿色气球菌和两株屎肠球菌扩增16S~23S rRNA基因间隔序列。通过随机扩增多态性DNA技术分析绿色气球菌DNA,评价不同菌株间的克隆相关性及耐药性。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

随机多态性扩增论文参考文献

[1].尹明华,占学林,徐文慧,谢妮妮,蔡红.叁叶青种质资源遗传多样性的随机扩增多态性DNA分析[J].浙江农业学报.2018

[2].王羽,董文龙,张喜庆,马红霞,高云航.随机扩增多态性DNA技术对绿色气球菌的相关性分析[J].中国兽药杂志.2017

[3].刘雪,邢益平,严玉娟,韩亚萍,严友德.随机扩增多态性技术联合荧光定量高敏检测叁种疱疹病毒方法的建立[J].现代生物医学进展.2017

[4].杨艳平,时晓玉,张颖,李文,王洁娣.1例阴道定植阿萨希毛孢子菌的基因鉴定及随机扩增多态性DNA分析[J].中国真菌学杂志.2017

[5].牛佳牧,李梓僮,曲莉.龟甲及其伪品随机扩增DNA多态性(RAPD)鉴定方法研究[J].北华大学学报(自然科学版).2016

[6].武中庸,倪春霞,赵吴静,蒲万霞.牛源金黄色葡萄球菌随机扩增多态性分型[C].中国畜牧兽医学会动物微生态学分会第五届第十二次全国学术研讨会论文集.2016

[7].向玉.肺炎克雷伯菌AmpC酶基因分型和随机扩增DNA多态性研究[J].四川解剖学杂志.2016

[8].严玉娟,邢益平,施旭东,严友德,艾月梅.随机扩增多态性技术联合荧光定量PCR检测结核分枝杆菌方法的建立[J].江苏医药.2016

[9].严玉娟.随机扩增多态性技术联合荧光定量PCR检测结核分枝杆菌方法的建立与评估[D].南京医科大学.2016

[10].盛瑜,孙景昱,李明成,张丽华,李洪宇.鹿鞭及其伪品随机扩增DNA多态性鉴定方法研究[J].北华大学学报(自然科学版).2015

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