导读:本文包含了免疫球蛋白可变区论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:免疫球蛋白,传染性,山羊,基因,免疫,引物,检查点。
免疫球蛋白可变区论文文献综述
石彬,马嘉欣,涂文静,吴皓明,陈先恋[1](2019)在《人免疫球蛋白重链可变区基因的特征分析》一文中研究指出目的:分析五类免疫球蛋白重链可变区基因的特征.方法:收集IMGT/LIGM-DB数据库中人类五类Ig重链可变区的基因序列,利用IMGT/HighV-QUEST分析其基因取用、V区AA变化、CDR3氨基酸长度和构成以及连接多样性.结果:IgM、IgG和IgE均较多地取用IGHJ4、IGHV1-69和IGHV5-51,且在IgM、IgG、IgA与IgE中可观察到几个相似的优势V-J配对.IgD具有较高的V区突变,主要体现在FR3区的高突变(AA变化值为7.2±2.4),而IgM的每个结构域的突变均明显低于其他类Ig.此外,IgD具有较高P插入发生率和插入核苷酸数明显多于其他四类Ig.结论:本研究从基因特征上描绘了人类五类Ig相互间的相似性与差异性,这些结果可为抗体工程领域提供重要参考数据.(本文来源于《聊城大学学报(自然科学版)》期刊2019年04期)
于晓慧[2](2018)在《山羊免疫球蛋白轻链可变区基因座结构及多样性机制分析》一文中研究指出免疫球蛋白分子(immunoglobulin,Ig)在适应性免疫反应中发挥着重要作用。典型的免疫球蛋白分子包括两种轻链类型,即λ链和κ链。目前对人和小鼠以及大型偶蹄目动物的相关研究已经取得一定进展,但是对山羊轻链的认识还存在空白。山羊具有采食范围广、免疫力强的特点,对山羊免疫球蛋白基因座位结构及多样性机制的研究有利于揭开动物抗病机制的神秘面纱,为提高动物和人类的免疫力奠定基础。本实验以饲养于西北农林科技大学畜禽生态试验站萨能羊原种场的萨能奶山羊为研究对象,通过5’RACE大量克隆山羊免疫球蛋白轻链可变区基因,以最近完成的山羊基因组数据库为参照基础,详尽地分析了山羊免疫球蛋白轻链的胚系基因结构及其表达多样性特点。得到了如下结果:(1)λ轻链可变区基因座位上至少包含35个V_λ基因片段,分为7个潜在有功能基因、1个开放阅读框(open reading frame,ORF)和27个假基因片段。其中7个潜在有功能基因,1个ORF1、25个假基因聚在一起,归为第一家族,p-V2和p-V27聚在一起,属于第二基因家族。3个J_λ-C_λ串联成单元排列在下游,其中的J_λ3是假基因。κ链的11个V_κ基因片段分为5个潜在有功能基因、2个ORF和4个假基因片段,根据相似度可将其全部序列归为叁个基因家族。3个有功能J_κ位于一个C_κ的上游。λ链基因座位按照V_(λ(35))-J_λ3-C_λ3-J_λ2-C_λ1-J_λ1-C_λ2排列,κ链基因座位按照V_(κ(35))-J_(κ(3))-C_κ排列。(2)利用5’RACE,从3只萨能奶山羊的脾脏中扩增得到305条无重复λ链和169条无重复κ链的可变区cDNA序列。在表达水平上,山羊轻链VJ重组对V基因的利用存在偏好性,λ链中主要表达V_λ2(26.23%)和V_λ3(73.11%),κ链主要表达V_κ2(52.07%)和V_κ4(46.15%)。从N+P核苷酸的数目和CDR3氨基酸长度的角度来看,λ链的连接多样性比κ链更加丰富。(3)统计λ链和κ链扩增的cDNA序列中单碱基替换突变与插入/缺失情况,分析体细胞高突变的特点。发现λ和κ轻链总体以C→T和A→G的突变次数最多,发生在A:T碱基对上的突变多于G:C碱基对,所以碱基替换突变多倾向发生在嘧啶核苷酸上。相较于转换突变碱基颠换突变更多。总体的突变发生在互补决定区(complementarity determining region,CDR)上的频率高于框架区(framework region,FR)。λ链的插入和缺失出现的频率也比κ链高。本研究集中分析得到了山羊免疫球蛋白轻链的基因座位结构并揭示了VJ重组和体细胞高突变机制(somatic hypermutation,SHM)对轻链可变区多样性所起到的重要作用。(本文来源于《西北农林科技大学》期刊2018-06-01)
轩春晓,柳军[3](2017)在《免疫检查点分子T细胞激活抑制物免疫球蛋白可变区结构域(VISTA)的研究进展》一文中研究指出T细胞激活抑制物免疫球蛋白可变区结构域(VISTA)是可抑制T细胞应答的负向免疫检查点分子,主要表达于造血细胞,具有受体和配体的双重功能,在肿瘤微环境和肿瘤浸润淋巴结中表达升高。VISTA可抑制T细胞对肿瘤抗原的应答,抑制T细胞分化为调节性T细胞(Treg),降低白细胞介素2(IL-2)的产生,具有免疫抑制和免疫调节的功能。但是VISTA并不会对B细胞的增殖产生影响。VISTA与转移性黑素瘤、诱导性黑素瘤和年龄相关的炎症表型的发生相关,并且具有与不同于程序性死亡蛋白1及配体1(PD-1/PD-L1)信号通路,联用VISTA/PD-1的单克隆抗体可取得更好的治疗效果。此外,VISTA在小鼠急性移植物抗宿主疾病模型上也表现出显着的调节作用。VISTA在免疫抑制中具有明确的功能,可能是这一生物学行为的核心控制元件,然而其天然配体及其发挥作用的内在机制尚不清楚。提示我们VISTA作为新发现的负向免疫检查点有望成为肿瘤免疫治疗的新靶点。(本文来源于《细胞与分子免疫学杂志》期刊2017年02期)
杜丽娟[4](2016)在《山羊胚系免疫球蛋白重链可变区基因座结构及多样性机制分析》一文中研究指出免疫球蛋白是动物获得性免疫系统的重要组成部分,存在于鱼类、两栖类、爬行类、鸟类和哺乳类所有的有颌动物中。目前关于免疫球蛋白的结构和表达机制的认识大多是以人或者小鼠为模型获得的,对这些机制在家养动物中的认识还比较少。山羊是重要家畜之一,以其作为试验模型研究免疫球蛋白的结构和表达特点,一方面可以了解其免疫球蛋白基因表达的分子机制,另一方面也可以为深入理解其抗病机理、开展抗病育种工作提供理论基础。本试验以西农萨能奶山羊作为研究对象,利用公布的山羊基因组数据库,通过体外克隆免疫球蛋白重链重组的可变区序列并与胚系基因比对,探究其基因座结构和多样性机制,获得如下结果:以已克隆的山羊免疫球蛋白可变区序列(NCBI登录号:EU344746-EU344750)作为种子序列在山羊基因组数据库中进行搜索,发现重链可变区VH基因分布在5个基因组Scaffold片段上,共8个基因序列,根据核苷酸相似性分成两个家族,其中第一家族包括3个潜在功能基因、1个开放阅读框片段和2个假基因片段,与绵羊第一基因家族和小鼠第二家族基因亲缘关系较近;第二家族包含2个假基因片段。3个DH片段和6个JH片段位于基因组Scaffold1847上。DH基因呈5’-DH1-DH2-DH3-3’结构排列,全部为功能基因。JH基因以5’-ψJH1-ψJH2-ψJH3-JH1-ψJH4-JH2-3’结构排列,其中JH1和JH2为功能基因,ψJH1、ψJH2、ψJH3和ψJH4是假基因。从山羊脾脏中克隆重链重组的可变区,共得到238个不同的cDNA片段。分析显示:山羊重链对可变区3种基因片段的使用均具有一定的偏好性。在所有克隆中,IGHV1-2片段表达偏好性最强;JH1的使用频率高于JH2。在225个克隆中鉴定出重排的DH片段,偏好使用第叁个开放阅读框;3个DH片段中DH1的表达偏好性最强,其次是DH3片段。在28个克隆中可能存在两个不同DH片段共同连接的情况。CDR3的长度在5~27个(平均长度为11.33)氨基酸残基。所有cDNA序列同3个潜在功能VH片段比对,分析体细胞高突变过程中碱基的替换突变和插入/缺失情况,结果显示:碱基发生转换突变的频率均高于颠换,其中以A→G的突变数目最多,其次为G→A;总体嘌呤发生替换的比例是嘧啶的2倍左右;不同区段的替换数表现为CDR2区高于CDR1,FR3区高于FR1和FR2。碱基的插入/缺失主要在CDRs区,数目多为3或者3的倍数。综上,本研究揭示了山羊免疫球蛋白重链可变区的基因座结构,并阐述了VDJ重组多样性和体细胞高突变机制对于多样化重链可变区表达谱的重要作用。(本文来源于《西北农林科技大学》期刊2016-05-01)
包英夫[5](2014)在《抗羊传染性脓疱病毒免疫球蛋白可变区多样性研究》一文中研究指出羊传染性脓疱病(Contagious pustular dermatitis,CPD)俗称“羊口疮(Orf)”,是由羊传染性脓疱病毒(ORFV)引起绵羊、山羊以及人的一种接触传染性、嗜上皮性的人兽共患传染病。在羊口疮流行地区,该病的发病率高达90%,死亡率可达10%。该病对养羊业的危害主要表现为造成成年羊采食困难,致使营养摄入不足,机体衰弱;更重要的是造成新生羔羊吮乳困难,影响羔羊的生长发育,甚至导致死亡。因此,该病的发生给养羊业造成了很大的经济损失。 ORFV作为一种重要的人兽共患病病原,其能够编码产生多种免疫调节相关蛋白,通过在短期内破坏或阻断宿主在保护性免疫过程中发挥免疫保护作用介质成分的合成从而躲避宿主的免疫监视,甚至导致宿主再感染的发生。鉴于ORFV对羊群和人类健康危害以及其在免疫学上的特殊性,目前临床上尚缺乏高效、实用的治疗性制剂和疫苗,加强针对ORFV免疫特性的研究对于该病防控措施的制定具有重要意义,从ORFV抗体角度开展相关研究将为对于利用特异性体液免疫对该病进行免疫防御提供重要手段。本研究首先建立了ORFV感染羔羊动物模型,在此基础上,利用RT-PCR方法从ORFV感染绵羊脾脏中扩增获得免疫球蛋白重链(Immunoglobulin heavychain variable region, IgH)及轻链可变区(Immunoglobulin light chain, IgL)基因片段。利用BLAST-N程序在GenBank数据库中对测序所获得绵羊IgH与IgL基因序列进行相似性检索,并采用ExPASy(Expert ProteinAnalysis System)将其翻译成对应的氨基酸序列,应用CLUSTAL W1.83软件完成多重比对。此外,应用DNAStar软件的MegAlign、Protean程序对绵羊IgH与IgL基因编码氨基酸序列的同源性和亲水性进行分析。IgH序列比对结果显示,49条序列的核苷酸同源性分别为84.3%(H7与H38)~100%(H5与H6)不等;绵羊IgH可变区V片段氨基酸聚类结果显示,克隆H1~H49的VH区段自动聚类为2个相对独立的单位。通过BLAST-N程序在Gen-Bank数据库在线搜索,并结合其他参考序列进行比较分析,分析数据显示,D片段从9到46个碱基长度不等,无论是在核苷酸还是氨基酸序列上,其同源性均存在高度的变异性;结合其亲水性分布图可知,可变区的亲水性氨基酸主要分布在VH区域和D高变区,对照抗原指数图和表面可能性图,亲水性强的VH区域和D高变区易形成抗原决定簇。IgL基因序列分析结果显示,41条绵羊IgLV区基因之间的同源性分别为76.1%(L2与L14,L28与L16,L28与L30,L28与L31,L28与L39)~100%(L34与L41)不等,与Genbank已报道的免疫球蛋白Kappa轻链V区基因序列信息(Accession number M60441)的BLAST-N检索结果显示,它们具有相似的结构域构成。免疫球蛋白轻链可变区亲水性、抗原指数和表面可能性分析结果显示,绵羊IgLV区亲水性氨基酸主要分布在CDR1,CDR2和CDR3前端。对照抗原指数分布图和表面可能性指数图,可以看出亲水性越强的区域,越容易暴露在分子表面,较容易形成抗原决定簇,更有利于与抗原结合。以上研究不仅为揭示羊免疫球蛋白重链可变区及轻链可变区的分子特征提供重要的参考依据,加强我们对绵羊免疫球蛋白基因更深入更广泛的了解,而且将为了解羊免疫球蛋白可变区基因序列在抗体多样性中的作用奠定坚实的理论基础。此外,该研究结果也将为预测分析抗体与抗原结合靶位提供实验依据,对于疫苗的改造及疫苗安全性的提高具有重要意义。(本文来源于《吉林大学》期刊2014-06-01)
包英夫,宋德光,贺文琦,张希牧,李吉达[6](2014)在《抗ORFV免疫球蛋白重链可变区基因序列的RT-PCR扩增及其多样性》一文中研究指出利用RT-PCR方法从羊传染性脓疱病毒(Orf virus,ORFV)感染绵羊脾脏总RNA中扩增获得免疫球蛋白(immunoglobulin,Ig)重链可变区cDNA克隆,随机挑选52个阳性克隆进行测序,获得49条完整的不重复序列。序列比对结果显示,49条序列的核苷酸同源性分别为84.3%(H7与H38)~100%(H5与H6)不等;绵羊IgH可变区V片段氨基酸聚类结果显示,克隆H1~H49的VH区段自动聚类为2个相对独立的单位。通过BLAST-N程序在GenBank数据库在线搜索,并结合其他参考序列进行比较分析,分析数据显示,D片段从9到46个碱基长度不等,无论是在核苷酸还是氨基酸序列上,其同源性均存在高度的变异性;结合其亲水性分布图可知,可变区的亲水性氨基酸主要分布在VH区域和D高变区,对照抗原指数图和表面可能性图,亲水性强的VH区域和D高变区易形成抗原决定簇。(本文来源于《中国兽医学报》期刊2014年04期)
姜晶,孙颖,刘红艳,牟玲,罗恩杰[7](2012)在《人免疫球蛋白重链可变区基因引物设计方法的改良》一文中研究指出针对抗体胚系基因数据库的数据不断更新和完善,为获得人全部免疫球蛋白(Ig)重链可变区基因,改进引物设计方法,自主设计针对可变区基因高度保守的框架区1(FR1)和框架区4(FR4)的引物,提取未经免疫的健康人外周血单个核细胞,通过RT-PCR扩增重链可变区基因。其DNA序列与GenBank数据库和IMGT/V-QUEST软件比对,序列分析符合人免疫球蛋白重链基本框架结构,为胚系基因重排产生的序列。多个克隆的测序结果对比分析显示了良好的多样性。获得的重链序列为研制基因工程抗体及构建噬菌体抗体库奠定了物质基础,也为扩增其他物种Ig可变区基因的引物提供新的设计思路。(本文来源于《微生物学杂志》期刊2012年02期)
刘辉,朱平[8](2010)在《表达特定免疫球蛋白可变区抗原的人B细胞系建立和其生物学特征》一文中研究指出目的建立表达特定免疫球蛋白可变区抗原的人B细胞系。方法在29例EBV转化B淋巴细胞建立永生化淋巴母细胞系中,PCR-SSP方法检测HLA-A*0201表达的细胞系,将表达HLA-A*0201的细胞系通过有限稀释培养方法获得单克隆细胞系ZP-1。分别用PCR方法、流式细胞仪和染色体核型分析检测细胞IgHV家族、细胞表面免疫表型CD分子和染色体核型表达。结果 HLA-A*0201(+)的细胞,经单克隆化培养后获得3个细胞克隆,将其中之一命名为ZP-1。PCR检测显示ZP-1细胞表达IgHV3家族;流式细胞仪检测显示ZP-1细胞表达CD19、lambda链等B细胞免疫表型;核型分析结果显示,ZP-1细胞为正常女性染色体结构。结论成功获得表达特定免疫球蛋白可变区抗原的人B细胞系,为研发B细胞相关疾病的疫苗和分子靶向药物提供良好的实验基础。(本文来源于《中国医药生物技术》期刊2010年06期)
秦立红,张金玉,赵志辉[9](2009)在《动物免疫球蛋白可变区多样性机制与抗病育种》一文中研究指出免疫球蛋白的多样性非常复杂,除了免疫球蛋白重链和轻链由于恒定区不同而形成不同类型或亚类免疫球蛋白外,重链和轻链可变区的氨基酸组成多样化是决定抗体多样性的重要因素。基因重排多样性是免疫球蛋白多样化的基础,它依赖于动物基因组水平的多拷贝可变区基因片段(V)、(本文来源于《中国兽医学报》期刊2009年12期)
魏巍,刘红柏,王荻,卢彤岩,尹家胜[10](2009)在《哲罗鱼免疫球蛋白轻链可变区序列及其多样性》一文中研究指出采用RT-PCR技术从哲罗鱼主要免疫器官脾脏总RNA中获得免疫球蛋白(immunoglobulin,Ig)轻链可变区cDNA克隆,随机挑取51个阳性克隆菌落进行测序,得到46条完整的不重复序列,用以确定哲罗鱼IgL的家族种类,为哲罗鱼病毒性疾病的疫苗研制提供理论依据。经过BLUST网络对比,结果显示:其与GenBank报导的虹鳟(序列号为X68517.1和X68519.1)序列的相似性均达90%以上,46条序列的核苷酸相同率分别为最低86.1%(P4与P43)至最高的99.8%(P21与P38)之间不等;经DNAstar5.0软件包MegAling中JotunHein方法对所得序列进行氨基酸同源性比较,得到两个不同的家族;通过可变性参数计算方法可知哲罗鱼IgL的可变性主要集中在CDRs区,可变性最高的区域为CDR3区;对可变区中CDR3序列进行分析后,得出哲罗鱼Ig轻链可变区的重排方式是Jκ基因片段位于Vκ基因片段的3′端的结论,这种重排方式增加了核苷酸不同的连接方式,使哲罗鱼抗体具有更多的可变性空间;对照其亲水性分布图可知:可变区的亲水性氨基酸主要分布于LP前端,FR1末端,完整的FR2,FR3两端,以及CDR1,CDR2和CDR3前端。(本文来源于《水产学报》期刊2009年06期)
免疫球蛋白可变区论文开题报告
(1)论文研究背景及目的
此处内容要求:
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例:
免疫球蛋白分子(immunoglobulin,Ig)在适应性免疫反应中发挥着重要作用。典型的免疫球蛋白分子包括两种轻链类型,即λ链和κ链。目前对人和小鼠以及大型偶蹄目动物的相关研究已经取得一定进展,但是对山羊轻链的认识还存在空白。山羊具有采食范围广、免疫力强的特点,对山羊免疫球蛋白基因座位结构及多样性机制的研究有利于揭开动物抗病机制的神秘面纱,为提高动物和人类的免疫力奠定基础。本实验以饲养于西北农林科技大学畜禽生态试验站萨能羊原种场的萨能奶山羊为研究对象,通过5’RACE大量克隆山羊免疫球蛋白轻链可变区基因,以最近完成的山羊基因组数据库为参照基础,详尽地分析了山羊免疫球蛋白轻链的胚系基因结构及其表达多样性特点。得到了如下结果:(1)λ轻链可变区基因座位上至少包含35个V_λ基因片段,分为7个潜在有功能基因、1个开放阅读框(open reading frame,ORF)和27个假基因片段。其中7个潜在有功能基因,1个ORF1、25个假基因聚在一起,归为第一家族,p-V2和p-V27聚在一起,属于第二基因家族。3个J_λ-C_λ串联成单元排列在下游,其中的J_λ3是假基因。κ链的11个V_κ基因片段分为5个潜在有功能基因、2个ORF和4个假基因片段,根据相似度可将其全部序列归为叁个基因家族。3个有功能J_κ位于一个C_κ的上游。λ链基因座位按照V_(λ(35))-J_λ3-C_λ3-J_λ2-C_λ1-J_λ1-C_λ2排列,κ链基因座位按照V_(κ(35))-J_(κ(3))-C_κ排列。(2)利用5’RACE,从3只萨能奶山羊的脾脏中扩增得到305条无重复λ链和169条无重复κ链的可变区cDNA序列。在表达水平上,山羊轻链VJ重组对V基因的利用存在偏好性,λ链中主要表达V_λ2(26.23%)和V_λ3(73.11%),κ链主要表达V_κ2(52.07%)和V_κ4(46.15%)。从N+P核苷酸的数目和CDR3氨基酸长度的角度来看,λ链的连接多样性比κ链更加丰富。(3)统计λ链和κ链扩增的cDNA序列中单碱基替换突变与插入/缺失情况,分析体细胞高突变的特点。发现λ和κ轻链总体以C→T和A→G的突变次数最多,发生在A:T碱基对上的突变多于G:C碱基对,所以碱基替换突变多倾向发生在嘧啶核苷酸上。相较于转换突变碱基颠换突变更多。总体的突变发生在互补决定区(complementarity determining region,CDR)上的频率高于框架区(framework region,FR)。λ链的插入和缺失出现的频率也比κ链高。本研究集中分析得到了山羊免疫球蛋白轻链的基因座位结构并揭示了VJ重组和体细胞高突变机制(somatic hypermutation,SHM)对轻链可变区多样性所起到的重要作用。
(2)本文研究方法
调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
免疫球蛋白可变区论文参考文献
[1].石彬,马嘉欣,涂文静,吴皓明,陈先恋.人免疫球蛋白重链可变区基因的特征分析[J].聊城大学学报(自然科学版).2019
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[3].轩春晓,柳军.免疫检查点分子T细胞激活抑制物免疫球蛋白可变区结构域(VISTA)的研究进展[J].细胞与分子免疫学杂志.2017
[4].杜丽娟.山羊胚系免疫球蛋白重链可变区基因座结构及多样性机制分析[D].西北农林科技大学.2016
[5].包英夫.抗羊传染性脓疱病毒免疫球蛋白可变区多样性研究[D].吉林大学.2014
[6].包英夫,宋德光,贺文琦,张希牧,李吉达.抗ORFV免疫球蛋白重链可变区基因序列的RT-PCR扩增及其多样性[J].中国兽医学报.2014
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