植物发育相关miR319基因家族进化及靶基因预测分析

论文摘要

【目的】研究miR319靶基因的功能和相关生理作用机制。【方法】利用生物信息学的方法对miR319基因家族成员成熟序列进行分析及靶基因预测。【结果】miR319在不同植物中拷贝数差异较大,大部分miR319基因分散在不同染色体上,少部分分散在同一条染色体上;miR319序列在不同物种间具有高度的保守性,保守区位置分布差异较大。进化分析表明miR319基因家族的成员呈现4大分支,水稻osa-miR319a-3p和苹果mdm-miR319c有特殊的进化机制。靶基因预测表明miR319靶基因功能包括转录因子、翻译活化剂、还原酶、蛋白酶等。【结论】miR319靶基因在植物体内可能形成复杂的调控网络对植物生长发育和植物抗逆过程起着重要的调控作用,这为今后进一步研究miR319靶基因的功能和相关生理作用机制提供了重要的理论依据。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 miR319基因家族成员序列检索
•   1.2 miR319基因家族成员的多序列比对
•   1.3 miR319基因家族成员系统进化树的构建
•   1.4 miR319的靶基因预测
• 2 结果与分析
•   2.1 miR319基因家族分析
•   2.2 miR319基因家族成员的多序列比对及保守位点分析
•   2.3 miR319基因家族成员系统进化树分析
•   2.4 miR319的靶基因预测分析
• 3 讨 论
• 4 结 论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 薛巨坤,王博,王莲萍,杨春雨,国会艳,郝爱平

关键词: 生物信息学,靶基因,植物生长发育,植物抗逆

来源: 西南农业学报 2019年07期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学

单位: 牡丹江师范学院生命科学与技术学院

基金: 国家自然科学基金项目(31700587),黑龙江省教育厅备案项目(1352MSYYB002)

分类号: Q943.2

DOI: 10.16213/j.cnki.scjas.2019.7.008

页码: 1503-1511

总页数: 9

文件大小: 1928K

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