东北湿地沉积物中T4型噬菌体g23基因的多样性

论文摘要

【目的】揭示我国东北典型湿地沉积物中T4型噬菌体g23基因的多样性,明确湿地环境T4型噬菌体群落分布特征,为噬菌体生态学研究提供数据支撑。【方法】采用简并性引物MZIA1bis和MZIA6对采自东北6个地点不同类型湿地沉积物土壤DNA进行PCR扩增,采用克隆测序方法,解析沉积物中T4型噬菌体g23基因组成,通过UniFrac分析T4型噬菌体群落结构在湿地沉积物中与其他环境中的差异。【结果】在东北湿地沉积物中共得到262条不同的g23基因序列,构建的系统进化树分析表明,我国东北湿地沉积物T4型噬菌体g23基因分布与海洋、湖泊及稻田生态系统中g23基因亲缘关系较近,而与东北旱地黑土g23基因分布较远;以g23基因群集表征的T4型噬菌体群落在不同地点湿地中分异明显。【结论】东北湿地生态系统T4型噬菌体群落结构复杂多样,存在着一些未知的噬菌体类群。

论文目录

• 1 材料和方法
•   1.1 湿地沉积物的采集
•   1.2 湿地沉积物总DNA提取及PCR扩增
•   1.3 克隆与测序
•   1.4 系统进化分析
•   1.5 提交序列
• 2 结果和分析
•   2.1 湿地沉积物DNA提取、PCR扩增、胶回收及克隆筛选
•   2.2 g23基因的最近亲缘序列分析
•   2.3 g23基因系统进化分析
•   2.4 T4型噬菌体g23基因序列的UniFrac分析
• 3 讨论和结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 李想,孙岩,刘俊杰,姚钦,王光华

关键词: 型噬菌体,基因,湿地沉积物,系统进化树,分析

来源: 微生物学报 2019年02期

年度: 2019

分类: 基础科学

专业: 生物学

单位: 中国科学院东北地理与农业生态研究所中国科学院黑土区农业生态重点实验室,中国科学院大学

基金: 国家自然科学基金(41571246)~~

分类号: Q933

DOI: 10.13343/j.cnki.wsxb.20180169

页码: 364-373

总页数: 10

文件大小: 2066K

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