中老年猕猴单个核细胞miRNA表达差异及其靶基因预测

中老年猕猴单个核细胞miRNA表达差异及其靶基因预测

论文摘要

目的研究中年与老年猕猴单个核细胞中miRNA表达差异,并预测其调控的靶基因。方法利用基于二代测序的miRNA测序方法 ,对中年和老年猕猴外周血中单个核细胞的miRNA进行测序,利用生物信息学方法对测序数据进行统计分析。结果中年与老年猕猴外周血单个核细胞的差异表达miRNA有55个,其中21个为已知miRNA,34个为新发现miRNA。已知miRNA中,有4个miRNA为上调表达,17个miRNA为下调表达。通过生物信息学分析预测发现,已知差异miRNA的调控靶基因1634个,分别富集在35个KEGG信号通路上。结论发现中年和老年猕猴血单个核细胞差异表达的miRNA,并预测出其调控的靶基因。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 实验动物
  •   1.2 miRNA测序及数据预处理
  •   1.3 miRNA的识别
  •   1.4 miRNA差异分析
  •   1.5 差异miRNA靶基因预测
  •   1.6 预测靶基因GO和KEGG富集分析
  • 2 结果
  •   2.1 差异表达miRNA
  •   2.2 差异miRNA的靶基因预测
  •   2.3 靶基因GO分析
  •   2.4 miRNA靶基因KEGG通路富集分析
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 朱向情,王强,蔡学敏,李自安,庞荣清,潘兴华

    关键词: 猕猴,年龄,表达差异,靶基因

    来源: 西南国防医药 2019年06期

    年度: 2019

    分类: 医药卫生科技,基础科学

    专业: 生物学,基础医学

    单位: 解放军联勤保障部队920医院细胞生物治疗中心干细胞与免疫细胞生物医药技术国家地方联合工程实验室云南省细胞治疗技术转化医学重点实验室云南省干细胞工程实验室

    基金: 云南省科技计划重大专项(2018ZF007),云南省应用基础研究计划(2017FB042),云南省云岭产业技术领军人才项目(2015LJ017),云南省中青年后备人才项目(2018HB002)

    分类号: R339.38;R-332

    页码: 636-639

    总页数: 4

    文件大小: 351K

    下载量: 87

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