北部湾海域球形棕囊藻遗传多样性分析

论文摘要

南海北部湾海域近年来连年暴发球形棕囊藻赤潮,严重威胁近海生态安全,亟待探明赤潮成因。球形棕囊藻是一种广泛分布于温带至热带海域的有害藻华微藻,具有明显的种下遗传分化。为了解北部湾海域球形棕囊藻的遗传多样性及其对赤潮藻种来源的指示意义,本研究针对分离于北部湾海域赤潮发生期间的4株棕囊藻,以核糖体28S大亚基rRNA基因(28SrDNA)D1—D2区和转录间隔区(ITS区)为靶区构建克隆文库,通过测序分析了北部湾海域球形棕囊藻的遗传多样性。结果表明,从北部湾分离的4株棕囊藻均为球形棕囊藻,但不同年份分离的球形棕囊藻藻株之间存在明显的遗传差异。部分球形棕囊藻藻株(PG2015和PG2017)的不同克隆间也存在遗传差异,这种遗传差异在由单一藻细胞建立的克隆培养系中仍存在,表明遗传差异是来自细胞内多拷贝的基因序列,可能源自不同地理种群球形棕囊藻之间的基因交流。与ITS区相比,28SrDNAD1—D2区能更好地反映球形棕囊藻遗传多样性状况,具有作为分子标记指示球形棕囊藻地理种群的潜力,但仍需深入研究。研究结果深化了对北部湾球形棕囊藻遗传多样性的认识,有望为进一步解析北部湾海域球形棕囊藻赤潮原因种来源提供判据。

论文目录

• 1 材料及方法
•   1.1 藻株分离培养
•   1.2 基因组DNA提取和PCR扩增
•   1.3 克隆文库构建和测序
• 2 结果
•   2.1 棕囊藻藻种鉴定
•   2.2 北部湾海域球形棕囊藻的遗传多样性
•   2.3 球形棕囊藻克隆培养株的遗传多样性
• 3 讨论
•   3.1 球形棕囊藻遗传多样性与地理种群的关系
•   3.2 北部湾海域球形棕囊藻遗传多样性及其对藻种来源的指示意义
• 4 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 胡晓坤,张清春,陈振帆,孔凡洲,王锦秀,于仁成

关键词: 球形棕囊藻,遗传多样性,赤潮,北部湾

来源: 海洋与湖沼 2019年03期

年度: 2019

分类: 基础科学

专业: 生物学

单位: 中国科学院海洋生态与环境科学重点实验室(中国科学院海洋研究所),中国科学院大学,青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋生态与环境科学功能实验室,中国科学院海洋大科学研究中心

基金: 科技部重点研发项目,2017YFC1404304号,青岛海洋科学与技术国家实验室鳌山科技创新计划项目,2016ASKJ02号,国家自然科学基金委面上项目,41576121号,国家自然科学基金委-山东省联合基金项目,U1606404号,中国科学院战略性先导科技专项,XDA11020304号

分类号: Q943

页码: 601-610

总页数: 10

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