成都平原不同种植方式折耳根表面附生细菌群落结构与抗生素抗性基因分析

论文摘要

【目的】分析有机、化肥和野生折耳根表面的附生细菌群落结构和抗生素抗性基因（ARGs）,揭示细菌群落结构与ARGs相互关系。【方法】高通量测定16SrRNAV3-V4可变区序列分析样品表面附生细菌群落结构;PCR和qPCR扩增29种ARGs基因分析样品表面ARGs污染情况;冗余分析（RDA）探讨细菌群落结构与ARGs的相互关系。【结果】折耳根表面检测到35个属的细菌,其中有机折耳根表面附生细菌多样性低于化肥和野生折耳根（P<0.05）;29种被检的ARGs中,有14种在折耳根中被检出,其中有机折耳根含有全部被检出的ARGs,化肥和野生折耳根则含有部分被检出的ARGs。折耳根表面ARGs污染的多样性和丰度显著受到样品表面的菌群结构影响,其中Lactococcus、 Escherichia、Fluviicola、Enterococcus、Sanguibacter和Acidovorax是影响ARGs最主要的菌群。【结论】有机种植极大地改变了折耳根表面附生细菌的群落结构,增加了ARGs的多样性和丰度,对有机折耳根的食品安全带来了潜在威胁。因此,有必要将ARGs污染监测纳入到有机折耳根的食品安全考核范围内。

论文目录

• 1 材料和方法
•   1.1 样品采集及预处理
•   1.2 原核微生物群落分析
•   1.3 ARGs的PCR和q PCR分析
•   1.4 统计分析
• 2 结果和分析
•   2.1 细菌群落多样性
•   2.2 ARGs的种类和丰度
•   2.3 细菌菌群与ARGs的相关性
• 3 讨论
• 4 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 芦科堃,向文良,卢倩文

关键词: 折耳根,高通量测序,原核微生物多样性,抗生素抗性基因,定量

来源: 微生物学报 2019年03期

年度: 2019

分类: 基础科学,农业科技

专业: 生物学,农作物

单位: 西华大学食品与生物工程学院四川省食品生物技术重点实验室西华大学古法酿造生物技术研究所

基金: 国家自然科学基金(31571935),四川省应用基础重点(2018JY0045),成都市一般项目(2016-NY02-00064-NC),西华大学研究生创新基金(YCJJ2017044)~~

分类号: Q938;S567.239

DOI: 10.13343/j.cnki.wsxb.20180180

页码: 489-498

总页数: 10

文件大小: 1259K

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