PDCD5调控的p53信号通路的动力学分析

论文摘要

DNA双螺旋结构的发现使得生物系统的研究进入分子层次,分子层次的生物系统进行信号传导是通过细胞中DNA、RNA以及蛋白质间相互作用来实现的,进而构造了信号传导通路.信号传导通路中各个组分间的相互作用是一系列的生化反应,这些生化反应可以由数学模型描述,利用数学中的理论和方法分析数学模型,可以理解通路中各个组分表达水平的变化情况,进而探究生命机理.与肿瘤相关的信号通路是以蛋白质p53为核心并结合与之相互作用的蛋白质的网络,细胞受到外界压力会激活p53的表达,而激活的p53促进不同下游基因的表达而启动不同的细胞命运,这些细胞命运与p53的动力学有关.利用动力系统中的分岔理论,探讨通路中不同因素对p53动力学的调控,对细胞命运决定起到指导作用.在本文,基于PDCD5调控p53的信号通路,针对通路中的两个重要蛋白质PDCD5和ATM,考虑了PDCD5表达水平和ATM产生速率对p53动力学的影响.首先,在一定PDCD5表达水平下,给出p53关于ATM产生速率的典型余维一分岔图.进一步,通过PDCD5和ATM产生速率的余维二分岔图清晰看出它们对p53动力学的调控,并给出相应的时间历程图和相图.最后,通过能量面进一步分析了p53动力学的稳定性.[37]

论文目录

• 摘要
• ABSTRACT
• 第一章 绪论
•   1.1 研究背景
•   1.2 国内外研究进展
•   1.3 研究目标及内容
• 第二章 预备知识
•   2.1 生物信号通路的数学描述
•   2.2 动力系统的基本概念
•   2.3 分岔理论
•   2.4 能量面
• 第三章
•   3.1 生物背景
•   3.2 数学模型
•   3.3 研究结果
•     3.3.1 余维一分岔分析
•     3.3.2 余维二分岔分析
•     3.3.3 能量面
•   3.4 本章小结
• 第四章 结论与展望
•   4.1 结论
•   4.2 展望
• 参考文献
• 致谢
• 附录 攻读学位期间发表的学术论文

文章来源

类型: 硕士论文

作者: 郝庚星

导师: 刘全生

关键词: 产生速率,分岔分析,能量面

来源: 内蒙古大学

年度: 2019

分类: 基础科学

专业: 生物学,生物学

单位: 内蒙古大学

分类号: Q75

总页数: 38

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