裂殖壶菌诱变株高产DHA机理的转录组学分析

论文摘要

利用RNA-seq技术对裂殖壶菌SR21的原始菌株和ARTP诱变所获取的DHA高产菌株NA2进行转录组分析。对基因进行功能注释和代谢通路的分类,寻找差异表达基因,并将这些基因归类到相关的代谢途径中,揭示诱变菌NA2中DHA产量提高的分子机理。结果表明:与原始菌株比较,诱变菌NA2中有314个基因上调,3个基因下调;上调的基因主要参与氨基酸代谢和能量代谢,为多不饱和脂肪酸的积累供应更多的乙酰辅酶A（乙酰-CoA）和还原型辅酶Ⅱ（NADPH）。利用荧光定量PCR验证基因的差异表达情况,结果与转录组分析一致。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 实验材料
•   1.2 转录组分析方法
•     1.2.1 RNA测序及数据处理
•     1.2.2 测序数据分析
•     1.2.3 实时荧光定量PCR验证（RT-qPCR）
• 2 结果与讨论
•   2.1 总RNA样品质量评估
•   2.2 测序数据质量评估
•   2.3 基因功能注释
•   2.4 差异基因表达
•     2.4.1 基因差异表达分析
•     2.4.2 Kegg富集分析
•   2.5 RT-qPCR验证
• 3 结 论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 胡爱云,龚定芳,李莎

关键词: 裂殖壶菌,转录组学分析,荧光定量

来源: 中国油脂 2019年12期

年度: 2019

分类: 工程科技Ⅰ辑,基础科学

专业: 生物学

单位: 无锡太湖学院江苏省物联网应用技术重点建设实验室,江南大学生物工程学院工业生物技术教育部重点实验室

基金: 江苏省高等学校自然科学研究面上项目(18KJB510045),江苏省物联网应用技术重点建设实验室开放课题(18WXWL02)

分类号: Q939.9

页码: 120-126

总页数: 7

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