导读:本文包含了晶体结构测定论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:晶体,结构,葛根,射线,淀粉,空间,氢键。
晶体结构测定论文文献综述
韩普[1]（2019）在《直接法在低分辨蛋白质晶体结构测定中的新应用》一文中研究指出蛋白质结构与功能的探索是生命科学最重要的研究领域之一,对蛋白质叁维结构的精确测定有助于在分子水平上深入了解生命过程,同时也将极大地推进药理学和药物设计的发展。在蛋白质晶体学中,直接法最初被应用于确定重原子坐标以及从头测定原子分辨率的蛋白结构。而通过将直接法与其他结构分析方法相结合,可以在蛋白质晶体学中开创出更多新的应用。基于此点,本研究论文系统探索了直接法在低分辨蛋白质结构解析方面的几项新应用。在双空间迭代的计算框架下,通过将直接法同多种解析方法结合,作者相继完成了:(1)多套弱信号的单波长反常散射(SAD)数据的自动化解析;(2)提出直接法辅助的MAD/MIR相位推演双空间迭代方法,并利用直接法成功实现了低分辨相位向高分辨母体数据的自动化扩展和优化(6.9埃到2.8埃和6.8埃到3.0埃);(3)实现了低分辨膜蛋白晶体结构的从头测定和自动化建模,并提出一套完整的结构解析方案。本论文分为6个章节的内容,其中第一、二章是对蛋白质晶体学和直接法相关的基础知识的阐述。第叁、四、五章则依次介绍了直接法在弱反常散射信号、低分辨蛋白质晶体结构解析方面的相关研究及重要应用。第一章:引言。主要介绍了蛋白质晶体学的发展历程、蛋白质的叁维结构、蛋白质晶体结构测定的一般步骤,最后详细列举了叁种常见的结构分析方法。第二章:介绍直接法在蛋白质晶体学领域已有的研究及应用。这些应用包括直接法与常规的单波长反常散射法和单对同晶置换法(SAD/SIR)相结合成功破除相位双解,以及在此基础上发展的直接法SAD/SIR相位推演及碎片扩展双空间迭代和直接法辅助的部分结构扩展双空间迭代。以上应用逐步整合成一条自动化的蛋白质结构解析流水线IPCAS,并于2018年发布了其2.0新版本。第叁章:16套弱反常散射信号SAD数据在IPCAS中的自动化测定。单波长反常散射法是蛋白质晶体结构解析的主流方法,但该技术存在相位模糊的问题,如果数据中反常散射信号微弱,通常就更难以获取准确相位和精确结构。而本章的研究工作将16套弱反常散射信号的SAD数据在IPCAS流水线中进行逐个解析并取得了理想结果。在相同条件下的对比试验中,IPCAS的解析结果要好于国际上流行的两个晶体学结构解析程序包PHENIX和CRANK2。第四章:直接法MAD/MIR相位推演双空间迭代以及低分辨相位扩展。多波长反常散射法和多对同晶置换法(MAD/MIR)都是低分辨蛋白质晶体结构测定的有效工具。作者在本章提出了直接法MAD/MIR相位推演双空间迭代,经试验证明能够在传统MAD/MIR方法基础上有效提高低分辨相位的质量,并利用直接法成功完成了低分辨相位向高分辨母体数据的自动化扩展(6.9埃到2.8埃和6.8埃到3.0埃)。第五章:低分辨膜蛋白结构的从头测定和自动化建模。膜蛋白叁维结构的精确解析在结构生物学和药理学上都具有重要意义。以直接法双空间迭代为基础,作者在低分辨膜蛋白数据的相位推演和自动化建模方面进行了新方法和新策略的探索,并最终提出一套完整的结构解析方案。方法的创新体现在以下3点:(i)利用分辨率扫描先验搜索非晶体学对称性(NCS);(ii)交替建模策略;(iii)直接法双空间迭代框架内的模型和相位的合并与反馈。作者通过成功解析4套具有挑战性的低分辨(最低4.5埃)膜蛋白数据,证明了此方法的可行性以及潜在的广泛应用价值。第六章:结论与展望。(本文来源于《中国科学院大学(中国科学院物理研究所)》期刊2019-06-01）
刘玙[2]（2018）在《晶体结构测定中正空间法的自动化和性能调优》一文中研究指出晶体结构测定的手段可以大致分为倒空间法和正空间法:前者的核心在于提取各衍射峰所对应结构因子的振幅,并设法从振幅反推相位,然后通过Fourier变换从各衍射峰的结构因子得到晶胞内的电子密度分布;后者以晶胞内原子的坐标组合为自变量,通过全局最优化算法寻找使计算得到的衍射谱和实际测得的衍射谱最接近的原子坐标。和倒空间法相比,正空间法对衍射谱的分辨率要求更低、对衍射峰重迭的容忍度更高,因此更加适合处理从粉末衍射得到的数据。在正空间法的求解过程中,对结构中成键关系的先验知识可以发挥极大的作用,因此正空间法特别适合求解分子晶体、框架晶体等等类型的结构,但其在求解成键关系总体未知的结构时仍然会遇到许多困难。为了降低最优化算法中搜索空间的维数,对于后一类型的结构常常可以使用等效点系组合(EPC)法:通过将晶胞中的原子分配到可用的Wyckoff位置,原先以晶胞中所有n个原子的坐标为自变量的3n维最优化问题可以转化为多个互相独立的最优化问题,每个问题以一个EPC中独立原子的可变坐标为自变量,而且这些最优化问题的维数在多数情况下远小于3n。在用正空间法求解晶体结构时,常常会遇到计算的衍射谱和实际谱很接近,但在化学上不合理的晶体模型;其中最常见的问题之一是原子重迭,即一些原子对的间距明显小于化学上允许的下限。为了尽量自动化地处理原子重迭问题,须要在全局最优化的过程中高效地实时检测和排除存在原子重迭的模型;对原子重迭的检测属于计算几何中的碰撞检测问题,而我们首先需要的就是一种实时的晶体学碰撞检测算法。本人基于碰撞检测中常用的轴对齐包围盒(AABB)模型,并结合晶胞特殊的几何构造,提出了一种通用的晶体学碰撞检测算法框架。在此基础之上,针对成键关系总体未知的结构,本人对计算几何中常用的sweep and prune(SAP)算法进行了修改,使之能以O(n log n)的时间复杂度检测晶体模型中的原子重迭;此外,考虑到这类结构的求解往往会使用EPC法,本人也提出一种利用等效点系对称性显着减少碰撞检测计算量的方法。基于以上的碰撞检测算法,本人设计了一种评估晶胞中原子重迭状况的函数,该函数可用于在最优化的过程中实时排除存在原子重迭的模型;此外,上述的碰撞检测算法不仅有助于更高效地避免原子重迭,而且对于晶胞中配位多面体、原子键价等等的计算也具有重要的意义。为了让上文所述的排除原子重迭的机制在求解未知结构的过程中发挥实际的作用,本人开发了decryst这套使用正空间法从粉末衍射数据求解晶体结构的软件。decryst在功能上和以前的EPCryst类似:两者都使用EPC法处理已指标化的数据,并把求解流程分为生成EPC列表、对各EPC进行统计分析、对每个EPC进行全局最优化和导出解模型等4个主要步骤;因为EPC法的缘故,两者都特别适合求解成键关系总体未知的结构。和EPCryst相比,decryst最重要的优势在于后者可以在最优化的过程中利用上文中的机制自动、高效地排除原子重迭。此外,受到Unix中make程序的启发,在decryst的实现中,本人首次将增量计算的思想以一种具有通用性的方式应用于最优化的过程中,使其性能得到了明显的提升;decryst也使用一种增量算法生成EPC,这不仅极大地降低了其内存需求,而且为在生成EPC时对其进行实时筛选做了准备。为了适应目前科学计算的发展趋势,本人在设计decryst时也加入了对并行和分布式计算的支持,使之可以通过同时利用多个处理器实现对晶体结构测定的进一步加速。考虑到同一结构的各EPC互相独立,而且EPC数在多数有意义的情形下都相当大,decryst中统计分析和全局最优化任务的并行化将为求解成键关系总体未知的结构带来前所未有的机遇。decryst是运行在类Unix平台上的自由、开源软件,可以从https://gitlab.com/CasperVector/decryst获得;其设计追求简洁、灵活,而本人也希望其中的技巧可以在更多的晶体学软件中得到应用。在现有自动化工具的配合下,用decryst能简单地实现相当复杂的求解流程:利用重原子法的求解,统计分析和全局最优化后基于Bragg R因子的EPC筛选,求解前筛除必发生原子重迭的EPC、最优化中实时排除存在原子重迭的晶体模型、求解后筛除仍发生原子重迭的EPC,等等。本文的最后部分讨论了decryst的设计和实现,并以美国矿物学家晶体结构数据库(AMCSD)中若干个不同晶系和复杂度的结构为例,循序渐进地演示了decryst的基本用法和常用技巧。(本文来源于《中国科学院大学(中国科学院物理研究所)》期刊2018-12-01）
李国武,薛源,杨光明,吕福德,刘建昌[3]（2018）在《微米级“蓟县矿”晶体结构测定及其“水脆钨石”新矿物的厘定》一文中研究指出"蓟县矿"是1979年在中国河北蓟县沿河钨矿床中发现的含Pb、W的氧化物新矿物,并被当时的IMA-CMMNC批准为新矿物,但由于其结晶细小,未能得到其晶体结构,根据粉晶衍射数据,衍射特征与烧绿石超族矿物相似,故归类为含W的烧绿石超族矿物。2010年经IMA-CNMNC批准提出的新烧绿石超(本文来源于《2018年全国矿物科学与工程学术会议论文摘要文集》期刊2018-07-06）
耿挺[4]（2018）在《GPCR研究高地在张江崛起》一文中研究指出近日，中科院上海药物研究所在B型G蛋白偶联受体（GPCR）结构与功能研究方面取得又一项重要进展：首次测定了胰高血糖素受体（GCGR）全长蛋白与多肽配体复合物的叁维结构，揭示了该受体对细胞信号分子的特异性识别及其活化调控机制。这项成果有助于深入理解B型GP(本文来源于《上海科技报》期刊2018-01-05）
方玲玲,杜先锋[5]（2017）在《利用~(13)C CP/MAS测定葛根淀粉晶体结构》一文中研究指出对淀粉颗粒粒度分布、热力学性质、微观结构、淀粉晶型以及双螺旋含量和相对结晶度的测定等表征葛根淀粉的物理性质和物理化学性质进行系统性探究,并以马铃薯淀粉作为对照。结果表明,葛根淀粉颗粒粒度大小的分布模式呈双峰型;起始糊化温度为64.32℃,糊化焓为1.77 J·g~(-1)。通过固体核磁可以测定葛根淀粉的晶体结构含淀粉的晶型,双螺旋含量和相对结晶度,其中,通过对NMR图谱中化学位移在94~110 nm处的C1区进行分峰,产生了2个副峰表明了葛根淀粉为Cb型晶体,同时利用X晶体衍射(X-ray diffraction,XRD)对葛根淀粉颗粒进行,衍射角在5.7°、15.3°、17.2°和17.5°时出现明显尖峰,证明葛根淀粉晶型为C型。13C CP/MAS固体核磁和XRD对葛根淀粉相对结晶度含量的测定结果分别为28.7%和19.18%,且通过13C CP/MAS得到葛根淀粉双螺旋含量为41.21%。(本文来源于《安徽农业大学学报》期刊2017年05期）
段忠意[6]（2017）在《鸡蛋壳超微结构与晶体结构的测定及全基因组关联分析》一文中研究指出蛋壳为胚胎生长发育提供了一个相对独立和稳定的内部环境,同时也是胚胎发育所需钙离子的来源。品质好的蛋壳在一定程度上能够降低食品安全的风险,也能减少由于蛋壳破损导致的经济损失,提高经济效益。同时蛋壳的形成过程也是一种经典的生物矿化模型。本研究使用鸡的600K高密度SNP芯片,对白来航与东乡绿壳蛋鸡正反交得到的F2群体进行SNP分型,使用扫描电镜与X射线晶体衍射两种方法,测定蛋壳超微结构与晶体结构,阐释其遗传基础,并探讨蛋壳超微结构与晶体结构之间的关系。选择F2群体927只母鸡进行基因分型,每只鸡收集66周龄的1个鸡蛋,取鸡蛋赤道部位蛋壳,使用扫描电镜测定蛋壳厚度(EST)、有效层厚度(ET)、乳突层厚度(MT)与乳突密度(MD)。使用混合线性模型进行全基因组关联分析。结果显示,EST、ET、MT与MD的表型变异系数分别为12.17%、14.83%、20.44%与23.83%,基于全基因组SNP估计的遗传力分别为0.39、0.36、0.17 与 0.19。719、784、1、10 个 SNP 分别与 EST、ET、MT、MD 显着相关。与 EST 和 ET 显着关联的SNP位于1号染色体的59.4Mb至68.5Mb区间,与MD显着关联的SNP位于6号染色体的20.6Mb至21.4Mb区间,与MT显着关联的SNP位于9号染色体的4.9Mb位置。ABCC9,KCNJ8,ITPR2和WNK1四个候选基因与ET和EST显着相关,它们均通过子宫组织的离子转运系统参与到蛋壳的形成过程。MT一方面受到乳突与乳突之间空间的影响;另一方面受到ITM2C的调控,其可能的作用方式是通过ITM2C-RIT2-Calmodulin-ITPR蛋白质之间的相互作用链条实现其对MT的调控。MD受到KNDC1的调控,其可能的作用方式有两种:其一是直接的方式,KNDC1与纤维核蛋白直接相互作用;其二是间接方式,KNDC1参与信号转导调控其它修饰蛋白来修饰纤维核蛋白。使用Rigaku R-AXIS SPIDERX射线晶体衍射仪测定晶体参数,获得前9个主要衍射峰的积分强度、总积分强度(TA)与晶体取向度(OD)。使用混合线性模型进行全基因组关联分析。结果显示,TA与蛋壳超微结构性状及蛋壳常规品质性状存在正相关关系,与OD之间存在负相关,说明颗粒越大的晶体,取向度越低,越倾向于随机分布。TA与OD的表型变异系数分别为9.4%与23.72%,基于全基因组SNP估计的遗传力分别为0.23与0.06。位于1号染色体55.7～69.3 Mb区间的621个SNP与TA显着相关。根据它们对应基因的功能及其mRNA与蛋白质在子宫组织细胞中的表达量,本研究认为DERA基因对蛋壳晶体的生长调节起到了重要作用。其作用途径可能有3种:一是为子宫组织细胞基质蛋白的合成及其与离子的转运过程中提供能量;二是降低高Ca2+浓度应激压力,保持细胞活性,并为蛋壳晶体的生长稳定地提供所需的Ca2+;叁是通过调控子宫液中ATP的浓度,对蛋壳晶体的生长产生作用。(本文来源于《中国农业大学》期刊2017-05-01）
董成[7]（2016）在《粉末衍射晶体结构测定的几个实例》一文中研究指出本文介绍我们利用实验室或同步辐射X射线粉末衍射数据和EXPO2014程序测定晶体结构得到的新结果,主要包括新型的ZnTeO_3单斜相、拓扑还原Tb_(0.45)Ca_(0.55)MnO_(2.67)立方相和奥美拉唑钠水合物等几种化合物的晶体结构。作者想通过这些实例来具体说明利用粉末衍射测(本文来源于《中国晶体学会第六届学术年会暨会员代表大会论文摘要集——多晶（粉晶）衍射分会》期刊2016-12-19）
吴小山,邵惠民,王化勤[8]（2015）在《用射线技术测定HgBa_2Ca_2Cu_3O_(8+δ)的晶体结构》一文中研究指出该项目用X射线衍射、中子衍射、电子衍射、X射线光电子能谱和离子束方法等多种实验分析手段研究了HgBa_2Ca_2Cu_3O_(8+δ)薄膜及Hg_(1-x)Pb_xBa_2Ca_2Cu_3O_(8+δ)的晶体结构,并建立了导致超导电的结构模型,发表研究论文22篇。该项目已达到国际先进水平,有些结果是国际上首创。其突出的创造性成果有以下几点。(1)由于HS易挥发及污染设备,本项目在国际上首次考虑用离子束注入与脉冲激光沉积相结合的(本文来源于《中国分析测试协会科学技术奖发展回顾》期刊2015-07-01）
杨雪菲[9]（2015）在《调控水稻光敏不育基因的pms3的RNA二级结构测定和RPA3017蛋白的晶体结构研究》一文中研究指出农垦58S为光温敏雄性核不育水稻品种,其在长日高温下不育、在短日低温下可育,是水稻育种中两系法的重要种质资源。前人已对控制这种光敏感核不育的基因进行了遗传定位与分析,研究发现pms3是直接导致农垦58S与农垦58育性分离的基因,分离克隆后对其进行初步功能研究发现pms3的候选基因transcript-1不编码蛋白质而是转录成为long non-coding RNA(lnc RNA),在58S与58N中仅有一个SNP的差别。pms3的trascript-1转录出的RNA并不翻译蛋白质,所以研究其发挥功能的机理可以通过研究其作为mi RNA对下游的核酸或蛋白质互作起到的调控育性的作用,或者依靠研究其作为lnc RNA折迭出二级结构然后与蛋白质相互作用从而发挥的功能。RNA的二级结构可以利用软件预测和实验探测两种方法来研究,本研究用了多种预测RNA二级结构的软件,对transcript-1的全长以及截短部分结构进行了预测,并且在实验方法上用引物扩增法分析二羟基酰化(SHAPE)以及其他化学方法测定transcript-1转录的lnc RNA的二级结构,试图分析结构对其功能发挥的作用,以及其在SNP周围以及mi RNA识别位点和剪切位点处的结构特点。微生物系统中信号的传导主要由双组分体系(Two-component system,TCS)来介导的。它可以引起细胞内对各种环境信号产生响应。双组分体系中的第二个原件是一个反应调节因子(Response Regulator,RR)这个调节因子含有一个保守的天冬氨酸残基,另一个原件是组氨酸激酶(Histidine Kinase,HK),当组氨酸激酶自磷酸化后可以将磷酸基团传递到反应调节因子的天冬氨酸上。光合细菌沼泽红假单胞菌(R.palustris)可以在低光强下进行光合作用,这一行为受到了两个串联的红光感受器细菌光敏色素Rp Bph P2和Rp Bphp3的调控。Rp Bph P2和Rp Bphp3感受到红光信号之后,C端的HK结构域就会进行自磷酸化,然后将磷酸基团进一步传递给反应调节因子RPA3017进而来调控下游的细胞内响应活动。同时RPA3017还与编码调控光合作用的LH4复合体的基因puc BAd串联,LH4复合体的产生受到红光信号的调控,因此与RPA3017的调控有密不可分的关系。为了在分子层面上理解磷酸基团是如何在Rp Bph P2/Rp Bphp3和RPA3017之间传递的,解析了RPA3017的晶体结构,分辨率为1.8?。RPA3017拥有Rossmann折迭,形成经典的Che Y型RR的(β/α)5结构。基于结构的解析以及同源建模,进一步鉴定了RPA3017接收磷酸基团的天冬氨酸Asp70附近表面的结构,这一部分直接与其上游互作蛋白Rp Bph P2和Rp Bph P3的HK结构域接触。这一结果为双组分系统中的两个组分之间的是如何在分子水平上特异性识别互作的提供了结构学的理论依据。(本文来源于《华中农业大学》期刊2015-06-01）
董水超,陶亚秋,沈晓冬,杜峰,潘志刚[10]（2014）在《粉末X线衍射测定间氨基苯甲酸/富马酸(2/1)有机盐晶体结构》一文中研究指出以间氨基苯甲酸和富马酸为原料,采用乙醇溶液结晶法制备间氨基苯甲酸/富马酸(2/1)有机盐粉晶体。利用粉末X线衍射数据,通过指标化确定其晶胞参数并采用直接空间法解析其晶体结构。结合傅里叶红外光谱仪测定羧酸根中H的结合情况,利用Rietveld精修技术对其晶体结构进行精修,最终测定了间氨基苯甲酸/富马酸(2/1)有机盐的晶体结构。该晶体结构中不对称单元中包含1个质子化的间氨基苯甲酸和半个去质子化的富马酸。羧基上和氨基上的H全部参与氢键作用。系统分析了该晶体结构中氢键的形成方式,揭示了氢键在晶体结构中的堆砌作用,并展示了粉末X线衍射技术在有机分子晶体结构测定中应用前景。(本文来源于《南京工业大学学报(自然科学版)》期刊2014年02期）
晶体结构测定论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
晶体结构测定的手段可以大致分为倒空间法和正空间法:前者的核心在于提取各衍射峰所对应结构因子的振幅,并设法从振幅反推相位,然后通过Fourier变换从各衍射峰的结构因子得到晶胞内的电子密度分布;后者以晶胞内原子的坐标组合为自变量,通过全局最优化算法寻找使计算得到的衍射谱和实际测得的衍射谱最接近的原子坐标。和倒空间法相比,正空间法对衍射谱的分辨率要求更低、对衍射峰重迭的容忍度更高,因此更加适合处理从粉末衍射得到的数据。在正空间法的求解过程中,对结构中成键关系的先验知识可以发挥极大的作用,因此正空间法特别适合求解分子晶体、框架晶体等等类型的结构,但其在求解成键关系总体未知的结构时仍然会遇到许多困难。为了降低最优化算法中搜索空间的维数,对于后一类型的结构常常可以使用等效点系组合(EPC)法:通过将晶胞中的原子分配到可用的Wyckoff位置,原先以晶胞中所有n个原子的坐标为自变量的3n维最优化问题可以转化为多个互相独立的最优化问题,每个问题以一个EPC中独立原子的可变坐标为自变量,而且这些最优化问题的维数在多数情况下远小于3n。在用正空间法求解晶体结构时,常常会遇到计算的衍射谱和实际谱很接近,但在化学上不合理的晶体模型;其中最常见的问题之一是原子重迭,即一些原子对的间距明显小于化学上允许的下限。为了尽量自动化地处理原子重迭问题,须要在全局最优化的过程中高效地实时检测和排除存在原子重迭的模型;对原子重迭的检测属于计算几何中的碰撞检测问题,而我们首先需要的就是一种实时的晶体学碰撞检测算法。本人基于碰撞检测中常用的轴对齐包围盒(AABB)模型,并结合晶胞特殊的几何构造,提出了一种通用的晶体学碰撞检测算法框架。在此基础之上,针对成键关系总体未知的结构,本人对计算几何中常用的sweep and prune(SAP)算法进行了修改,使之能以O(n log n)的时间复杂度检测晶体模型中的原子重迭;此外,考虑到这类结构的求解往往会使用EPC法,本人也提出一种利用等效点系对称性显着减少碰撞检测计算量的方法。基于以上的碰撞检测算法,本人设计了一种评估晶胞中原子重迭状况的函数,该函数可用于在最优化的过程中实时排除存在原子重迭的模型;此外,上述的碰撞检测算法不仅有助于更高效地避免原子重迭,而且对于晶胞中配位多面体、原子键价等等的计算也具有重要的意义。为了让上文所述的排除原子重迭的机制在求解未知结构的过程中发挥实际的作用,本人开发了decryst这套使用正空间法从粉末衍射数据求解晶体结构的软件。decryst在功能上和以前的EPCryst类似:两者都使用EPC法处理已指标化的数据,并把求解流程分为生成EPC列表、对各EPC进行统计分析、对每个EPC进行全局最优化和导出解模型等4个主要步骤;因为EPC法的缘故,两者都特别适合求解成键关系总体未知的结构。和EPCryst相比,decryst最重要的优势在于后者可以在最优化的过程中利用上文中的机制自动、高效地排除原子重迭。此外,受到Unix中make程序的启发,在decryst的实现中,本人首次将增量计算的思想以一种具有通用性的方式应用于最优化的过程中,使其性能得到了明显的提升;decryst也使用一种增量算法生成EPC,这不仅极大地降低了其内存需求,而且为在生成EPC时对其进行实时筛选做了准备。为了适应目前科学计算的发展趋势,本人在设计decryst时也加入了对并行和分布式计算的支持,使之可以通过同时利用多个处理器实现对晶体结构测定的进一步加速。考虑到同一结构的各EPC互相独立,而且EPC数在多数有意义的情形下都相当大,decryst中统计分析和全局最优化任务的并行化将为求解成键关系总体未知的结构带来前所未有的机遇。decryst是运行在类Unix平台上的自由、开源软件,可以从https://gitlab.com/CasperVector/decryst获得;其设计追求简洁、灵活,而本人也希望其中的技巧可以在更多的晶体学软件中得到应用。在现有自动化工具的配合下,用decryst能简单地实现相当复杂的求解流程:利用重原子法的求解,统计分析和全局最优化后基于Bragg R因子的EPC筛选,求解前筛除必发生原子重迭的EPC、最优化中实时排除存在原子重迭的晶体模型、求解后筛除仍发生原子重迭的EPC,等等。本文的最后部分讨论了decryst的设计和实现,并以美国矿物学家晶体结构数据库(AMCSD)中若干个不同晶系和复杂度的结构为例,循序渐进地演示了decryst的基本用法和常用技巧。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
晶体结构测定论文参考文献
[1].韩普.直接法在低分辨蛋白质晶体结构测定中的新应用[D].中国科学院大学(中国科学院物理研究所).2019
[2].刘玙.晶体结构测定中正空间法的自动化和性能调优[D].中国科学院大学(中国科学院物理研究所).2018
[3].李国武,薛源,杨光明,吕福德,刘建昌.微米级“蓟县矿”晶体结构测定及其“水脆钨石”新矿物的厘定[C].2018年全国矿物科学与工程学术会议论文摘要文集.2018
[4].耿挺.GPCR研究高地在张江崛起[N].上海科技报.2018
[5].方玲玲,杜先锋.利用~(13)CCP/MAS测定葛根淀粉晶体结构[J].安徽农业大学学报.2017
[6].段忠意.鸡蛋壳超微结构与晶体结构的测定及全基因组关联分析[D].中国农业大学.2017
[7].董成.粉末衍射晶体结构测定的几个实例[C].中国晶体学会第六届学术年会暨会员代表大会论文摘要集——多晶（粉晶）衍射分会.2016
[8].吴小山,邵惠民,王化勤.用射线技术测定HgBa_2Ca_2Cu_3O_(8+δ)的晶体结构[C].中国分析测试协会科学技术奖发展回顾.2015
[9].杨雪菲.调控水稻光敏不育基因的pms3的RNA二级结构测定和RPA3017蛋白的晶体结构研究[D].华中农业大学.2015
[10].董水超,陶亚秋,沈晓冬,杜峰,潘志刚.粉末X线衍射测定间氨基苯甲酸/富马酸(2/1)有机盐晶体结构[J].南京工业大学学报(自然科学版).2014
论文知识图
