巴洛沙星胁迫下大肠杆菌的比较蛋白质组学研究

论文摘要

随着全球细菌耐药形势的日益严峻,细菌耐药机制已成为热点内容。利用iTRAQ标记的定量蛋白质组学方法,比较大肠杆菌K12 BW25113菌株在1/4 MIC巴洛沙星浓度胁迫下蛋白表达的差异。结果表明,质谱分析法共鉴定到118个差异蛋白,其中52个蛋白表达上升,66个表达下降;经生物信息学分析发现,细菌可能通过降低TCA循环、丙酮酸循环以及碳代谢等能量代谢来调整细菌的耐药状态;并通过提高核酸代谢等相关蛋白表达,减少巴洛沙星的杀菌压力,促进细菌存活。同时,利用qPCR技术验证碳代谢和嘧啶代谢途径的相关基因在mRNA水平的表达变化,表明大部分基因转录水平表达变化与蛋白水平一致。以上结果为深入研究细菌的耐药过程提供了理论依据,也为更好地控制和防治耐药细菌提供了药物作用靶点。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 材料
•   1.2 方法
•     1.2.1 MIC值及生长曲线的测定
•     1.2.2 细菌培养
•     1.2.3 全菌蛋白的提取
•     1.2.4
•     1.2.5 生物信息学分析
•     1.2.6 qPCR验证相关基因在m RNA水平的表达变化
• 2 结果
•   2.1 大肠杆菌对巴洛沙星的MIC值及生长曲线
•   2.2 巴洛沙星胁迫下大肠杆菌蛋白的SDS-PAGE图谱
•   2.3 LC-MALDI TOF/TOF质谱分析
•   2.4 差异蛋白的功能分类与注释
•   2.5 巴洛沙星胁迫下差异蛋白的代谢途径 （KEGG） 分析
•   2.6 巴洛沙星胁迫下差异蛋白的蛋白-蛋白相互作用网络
•   2.7 q-PCR验证
• 3 讨论
• 4 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 张良,陈小青,宋佳宇,毛然然,姜倩雯,林向民

关键词: 大肠杆菌,巴洛沙星,应激耐药,定量蛋白质组学

来源: 生物技术通报 2019年03期

年度: 2019

分类: 基础科学,农业科技

专业: 生物学

单位: 福建农林大学生命科学学院,福建农林大学福建省农业生态过程与安全监控重点实验室

基金: 2018年国家级大学生创新创业训练计划项目(201810389040)

分类号: Q936

DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2018-0848

页码: 103-109

总页数: 7

文件大小: 4004K

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