论文摘要
指出了在生命科学领域,非模式生物具有越来越重要的地位,对非模式生物的研究大幅拓宽了生命科学研究的广度,促进发现更多新的科学问题,弥补模式生物在研究中的不足之处。传统的转录组分析存在流程操作复杂、工作效率低、入门门槛高等问题。基于Snakemake的转录组分析框架,能够运用数据标签批量处理多个数据,无需使用者多次设置参数,大大提高了工作效率。利用Snakemake初步搭建转录组分析框架,在野生型和FUL基因型番茄样品的RNA-Seq转录本数据进行测试。本研究工作为非计算机背景的研究人员进行转录组分析提供了方便,对相关转录组数据分析研究具有一定参考意义。
论文目录
文章来源
类型: 期刊论文
作者: 李岸林,刘长宁
关键词: 分析框架,非模式生物,转录组分析
来源: 绿色科技 2019年14期
年度: 2019
分类: 农业科技,基础科学
专业: 生物学
单位: 中国科学院西双版纳热带植物园热带植物资源可持续利用重点实验室,中国科学院大学
基金: 国家自然科学基金资助项目(编号:31471220)
分类号: Q78
DOI: 10.16663/j.cnki.lskj.2019.14.075
页码: 207-210
总页数: 4
文件大小: 714K
下载量: 50
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