T-RFLP和454焦磷酸测序方法分析制麦过程细菌群落的动态变化

T-RFLP和454焦磷酸测序方法分析制麦过程细菌群落的动态变化

论文摘要

确定微生物菌群特性是制麦管理与优化的关键一步。本研究以两个不同收获年份及两个同批次不同制麦方式的大麦为样品,采用两种非培养计数方法,即16S核糖体RNA(16S rRNA)末端限制片段长度多态性(T-RFLP)和454焦磷酸测序,检测制麦过程细菌及乳酸菌菌群结构,以期全面、准确分析细菌群落结构及动态变化。研究结果显示:不同收获年份的大麦细菌菌群结构存在差异,整个细菌群落结构随着制麦过程而发生变化,而不同发芽方式之间并没有明显的区别。454焦磷酸测序结果显示乳酸菌有139个运算分类单元(OTU),所有样品有88%的序列覆盖了5个OTU(如Weissella、Lactobacillus和Leuconostoc菌属),说明制麦过程乳酸菌的多样性较低,优势乳酸菌相对数量随着制麦条件变化而波动,并且大麦的收获年份和制麦环境也影响乳酸菌的菌群结构。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料和仪器
  •   1.2 细菌总DNA提取
  •   1.3 T-RFLP分析
  •   1.4 16S rRNA基因扩增子的测序
  • 2 结果与讨论
  •   2.1 T-RFLP分析
  •     2.1.1 细菌菌群
  •     2.1.2 乳酸菌菌群
  •   2.2 乳酸菌16S rRNA基因扩增子的焦磷酸测序
  • 3 结语
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 邱然,陆健

    关键词: 麦芽,微生物菌群,乳酸菌,末端限制片段长度多态性

    来源: 食品与生物技术学报 2019年04期

    年度: 2019

    分类: 工程科技Ⅰ辑,基础科学

    专业: 生物学,轻工业手工业

    单位: 江南大学生物工程学院,江南大学工业生物技术教育部重点实验室,粮食发酵工艺与技术国家工程实验室江南大学

    基金: 国家973计划项目(2013CB733602),国家863计划项目(2013AA102109),江苏高校优势学科建设工程资助项目(NCET-20180121-3)

    分类号: TS201.3

    页码: 71-77

    总页数: 7

    文件大小: 2358K

    下载量: 53

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