炎症通路在强直性脊柱炎发病中作用的转录组学研究

论文摘要

目的:研究强直性脊柱炎（AS）的转录组学以阐释该疾病发病中涉及的关键基因和通路。方法:收集AS患者及健康对照外周血单个核细胞,提取RNA,通过高通量RNA测序的方法得到基因表达谱。采用生物信息学方法,比较AS患者及健康对照者的基因表达情况,选差异基因,并进行GO功能注释、KEGG通路富集分析、蛋白互相作用网络分析(PPD及表型分析。并用ELISA方法在AS患者和健康对照者外周血中进一步验证通路中涉及的重要细胞因子的水平。结果:AS患者和健康对照者存在153个差异表达基因（DEGs）,其中149个基因上调,4个基因下调,这些基因相互之间密切联系。通过上调基因的生物功能分析后发现,其主要与TNF信号通路、趋化因子信号传导等炎症通路相关。另外,在外周血浆中验证到,AS患者较健康对照者炎症细胞因子IL-2、IL-6、IL-10、TNF-α和IFN-γ的表达水平显著升高（P<0.05）。结论:TNF、趋化因子信号传导等信号通路以及IL-2、IL-6、IL-10、TNF-α和IFN-γ等炎症因子与AS发病有关。

论文目录

• 1 资料和方法
•   1.1 一般资料
•   1.2 差异表达基因（differentially expressed gene,DEGs）筛选
•   1.3 差异表达基因的GO（gene ontology）、KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）富集分析
•   1.4 蛋白相互作用网络分析（protein-protein interaction,PPI）
•   1.5细胞因子分析
•   1.6 统计学处理方法
• 2 结果
•   2.1 AS患者与对照组的基因表达模式差异
•   2.2 AS组与对照组的DEGs涉及的信号通路
•   2.3 AS组与对照组的DEGs编码蛋白的相互关系
•   2.4 AS组与对照组的DEGs的生物功能注释
•   2.5 炎性细胞因子差异
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 李辰璐,方锦霞,罗京,朱小春,王晓冰

关键词: 强直性脊柱炎,测序,炎症

来源: 温州医科大学学报 2019年12期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技

专业: 内分泌腺及全身性疾病

单位: 温州医科大学附属第一医院风湿免疫科

基金: 浙江省医药卫生科技计划项目（2019RC050）,温州市科技计划项目（Y20160028）

分类号: R593.23

页码: 872-877

总页数: 6

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