分枝杆菌Rv2450c T细胞表位预测及分析

分枝杆菌Rv2450c T细胞表位预测及分析

论文摘要

对Rv2450c进行T细胞表位预测分析。在NCBI上获取Rv2450c蛋白质序列,运用ExPASY(ProtParam)对Rv2450c蛋白进行理化性质分析,Expasyde的Protscale程序对Rv2450c蛋白进行疏水性分析,NetMHC在线基本软件预测并分析Rv2450c的CD4+T细胞表位的分布情况; Bimas、NetMHC、和NetCTL软件预测并分析Rv2450c的CD8+T细胞表位的分布情况。经筛选得出CD4+T细胞的优势表位5个,CD8+T细胞优势表位2个;综合CD+T细胞表位与CD8+T细胞表位分析结果,最终筛选出T细胞表位预测为:SQGIRAWP159—166。预测出的T细胞候选表位可为结核病疫苗开发提供参考。

论文目录

  • 1 引言
  • 2 材料与方法
  •   2.1 材料
  •   2.2 分枝杆菌Rv2450c的理化性质分析
  •   2.3 分枝杆菌Rv2450c的疏水性分析
  •   2.4 分枝杆菌Rv2450c的跨膜区分析
  •   2.5 CD4+T细胞表位预测
  •   2.6 CD8+T细胞表位预测
  •     2.6.1 NetMHC对分枝杆菌Rv2450cCD8+T细胞表位预测
  •     2.6.2 BIMAS对分枝杆菌Rv2450cCD8+T细胞表位预测
  •     2.6.3 IEBD对分枝杆菌Rv2450cCD8+T细胞表位预测
  • 3 结果
  •   3.1 理化性质分析结果
  •   3.2 疏水性分析结果
  •   3.3 跨膜区分析结果
  •   3.4 CD4+T细胞表位预测结果
  •   3.5 CD8+T细胞表位预测结果
  •   3.6 CD4+T和CD8+T细胞表位综合分析结果
  • 4 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 王培东,何俊才,周放,张露,郑辉,刘(王亭),余晓丽

    关键词: 生物信息学,抗原表位

    来源: 武汉轻工大学学报 2019年01期

    年度: 2019

    分类: 工程科技Ⅰ辑,基础科学,医药卫生科技

    专业: 生物学,基础医学

    单位: 武汉轻工大学生物与制药工程学院,武汉市金银潭医院

    分类号: R392

    页码: 33-36

    总页数: 4

    文件大小: 125K

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