珠江河网冬季浮游细菌群落结构及其影响因素

论文摘要

为了解珠江河网冬季浮游细菌群落结构,探讨影响其群落结构的环境因素,于2017年11月和2018年1月在珠江河网（112.18°E～113.51°E,22.38°N～23.17°N）采集表层水样,借助IlluminaMiSeq高通量测序平台,运用16S rDNA扩增子技术研究珠江河网冬季浮游细菌群落结构,使用R（3.5.2）软件包以及SPSS进行统计分析及作图。结果表明,变形菌门（Proteobacteria）、放线菌门（Actinobacteria）、拟杆菌门（Bacteroidetes）、蓝细菌门（Cyanobacteria）是珠江河网丰度较高的门类,细菌群落优势种群依次为γ-变形菌纲（γ-Proteobacteria）、放线菌纲（Actinobacteria）和α-变形菌纲（α-Proteobacteria）。珠江河网冬季浮游细菌具有较高的菌群多样性（两次样品的Shannon指数分别为6.78±0.29、6.23±0.71）, NMDS分析表明,浮游细菌群落结构之间不存在显著的地域差异。Pearson相关性分析表明,温度与γ-变形菌纲（P<0.05）、放线菌纲（P<0.05）以及α-变形菌纲（P<0.01）的丰度显著正相关,pH与放线菌纲（P<0.05）、α-变形菌纲（P<0.01）的丰度以及多样性指数（Shannon:P<0.01; Simpson:P<0.01）显著负相关,溶解氧与α-变形菌纲的丰度显著负相关（P<0.05）。冗余分析（RDA）结果显示,温度、pH是影响浮游细菌群落的主要因子。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 采样地点及样品采集
•   1.2 物理化学测定
•   1.3 DNA提取、PCR扩增及上机测序
•   1.4 数据分析
• 2 结果与分析
•   2.1 浮游细菌的群落组成
•   2.2 浮游细菌群落多样性分析
•   2.3 环境因子与细菌群落之间的关系
• 3 讨论
•   3.1 珠江河网浮游细菌群落组成及优势种
•   3.2 珠江河网浮游细菌群落差异及其影响因素
• 4 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 王松鸽,赖子尼,麦永湛,刘乾甫

关键词: 珠江河网,浮游细菌,群落结构

来源: 中国水产科学 2019年03期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学

单位: 中国水产科学研究院珠江水产研究所,上海海洋大学水产与生命学院

基金: 国家重点研发计划项目(2018YFD0900802),中国水产科学研究院中央非盈利机构专项科研基金项目(2015A01YY02)

分类号: Q938.8

页码: 522-533

总页数: 12

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