黑龙江省活禽市场6株H9N2亚型禽流感病毒全基因组序列分析

论文摘要

目的了解2018年黑龙江省活禽市场H9N2亚型禽流感病毒变异特点和进化规律。方法采集黑龙江省禽流感监测点活禽市场的环境标本进行H9N2亚型的核酸检测,阳性标本进行病毒分离,对分离的禽流感病毒毒株进行全基因组序列测定,应用生物信息学软件分析其基因特征。结果 6株H9N2亚型禽流感病毒HA基因裂解位点附近氨基酸序列均为PSRSSRGLF,符合典型低致病性禽流感病毒基因的特征,HA蛋白受体结合位点第226位Q→L,具有与α-2,6唾液酸受体亲和力增强的特性,第183位突变为天冬酰氨;NA蛋白中63-65位茎部全部缺失,使病毒的生长受到抑制,在3个可能的血凝素结合位点中,6株病毒发生变异（368N,369G,402D）;另外,HA和NA基因潜在糖基化位点也存在增加或缺失的现象;与参考序列相比,PB1、PB2蛋白有3处发生突变,增强了病毒的致病性;M2蛋白发生V27G和S31N突变,对金刚烷类药物产生耐药;NP和NS基因在几个关键位点上均未发生变异。遗传进化分析显示,6株H9N2亚型禽流感病毒在NA、M和NP基因中相似度更高,HA、NA基因位于Y280/97-like分支,PB2、M基因位于G1/97-like分支,PB1、PA、NP和NS基因均位于F/98-like分支。结论 6株H9N2亚型禽流感病毒发生了3配体重组,可能成为高致病性禽流感病毒H5、H7亚型部分基因的供体。因此,应加强对H9N2亚型禽流感病毒的监测,密切关注其变异情况及重组趋势。

论文目录

• 材料与方法
•   1 毒株来源
•   2 主要试剂和仪器
•     2.1 主要试剂
•     2.2 主要仪器
•   3 方法
• 结 果
•   1 H9N2亚型禽流感病毒8个基因片段关键位点比较及同源性分析
•     1.1 HA基因
•     1.2 NA基因
•     1.3 PB1、PB2、PA基因
•     1.4 M基因
•     1.5 NP基因
•     1.6 NS基因
•   2 H9N2亚型禽流感病毒基因遗传进化分析
• 讨 论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 舒畅,冷焱,石鑫,曹博,许军

关键词: 禽流感病毒,基因组,遗传进化分析

来源: 中国病原生物学杂志 2019年08期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技,基础科学,农业科技

专业: 生物学,畜牧与动物医学,感染性疾病及传染病

单位: 黑龙江省疾病预防控制中心,鸡西市疾病预防控制中心

基金: 国家科技重大专项传染病监测技术平台项目(No.2017ZX10103007-004)

分类号: S852.65;R511.7

DOI: 10.13350/j.cjpb.190805

页码: 886-895

总页数: 10

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