导读:本文包含了分子连锁图论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:分子,标记,基因,图谱,大豆,稻瘟病,烤烟。
分子连锁图论文文献综述
周雁,卢兴潮,边银丙[1]（2015）在《毛木耳基因内分子标记开发与遗传连锁图构建》一文中研究指出毛木耳是我国广泛人工栽培的食用菌之一,但其遗传学和分子生物学基础相对薄弱。本研究以毛木耳杂交子APM2-16营养生长期(菌丝体)和生殖生长期(成熟子实体)的转录组为基础,开发了一系列基因内分子标记,包括SSR、InDel、CAPs、SCAR等,并利用这些分子标记开展了遗传连锁图的构建。毛木耳遗传连锁图的构建以APM2-16的123个担孢子单核体后代为作图群体,选用337对SSR引物、373对InDel引物以及23对其他类型的引物作为分子标记进行亲本单核体间的多态性分析和群体基因型分型,经遗传连锁作图分析获得一张包含160个基因内标记的毛木耳遗传连锁图。该遗传连锁图由14个连锁群组成,图谱总长595.7 cM,标记间的平均遗传距离为4.1 cM,交配型A位点和B位点分别位于第9连锁群和第1连锁群,并通过基因的遗传定位发现毛木耳的8个漆酶基因分散分布于5个不同的连锁群上。本遗传连锁图全部由基因内分子标记组成,为进一步开展毛木耳数量性状的QTL定位、功能基因的图位克隆、基因组组装、比较基因组研究和分子标记辅助选择育种等研究奠定了一定的遗传学基础。(本文来源于《中国菌物学会2015年学术年会论文摘要集》期刊2015-09-20）
肖炳光[2]（2013）在《烟草基因组计划进展篇:3.烟草分子标记遗传连锁图构建和重要抗病基因定位》一文中研究指出分子标记遗传连锁图是基因定位、图位克隆、分子标记辅助选择育种的基础[1]。普通烟草基因组较大,分子标记多态性水平较低[2],为遗传连锁图构建、基因定位等相关研究造成较大困难。近年来,Bindler等[3-4]利用美国烟草基因组测序项目的序列数据,开发了大量SSR标记,构建了高密度烟草遗传连锁图。由于他们使用的作图群体为烤烟和晒烟品种间杂交F2群体,遗传差异相对较远,可供烤烟利用的标记数有限。在中国烟草总公司、中国烟草总公司云南省公司多个项目的资助下,云南省烟草农业科学研究院联合行业内外相关单位,开展了烟草分子标记开发、遗传连锁图构建和抗病基因定位等研究工作,取得了重要进展。(本文来源于《中国烟草科学》期刊2013年03期）
殷豪,吴俊,张绍铃[3]（2012）在《梨分子遗传连锁图构建及重要农艺性状定位》一文中研究指出梨分子遗传连锁图谱的构建始于21世纪初,构建高密度的分子遗传图谱将有助于提高梨的分子育种水平。我们就目前国内外梨分子遗传连锁图谱的构建及其在抗病虫、果实性状及树形性状的基因定位和QTL定位,包括其在梨和苹果比较作图研究中的应用等方面进行简要阐述,指出了梨分子遗传图谱构建中存在的图谱密度较低和作图群体偏小等问题。梨育种工作者在今后的梨分子遗传图谱构建工作中,应注意适当扩大作图群体,充分利用蔷薇科基因组数据开发共显性标记,提高图谱标记密度,从而为标记辅助育种和重要农艺性状基因的图位克隆奠定基础。(本文来源于《果树学报》期刊2012年05期）
翟焕趁,王宝华,鲁国东,朱立煌,王宗华[4]（2011）在《稻瘟病菌无毒基因Avr-Pid2的分子标记及其连锁图》一文中研究指出无毒基因的克隆与变异监测可以为水稻抗病品种布局与利用提供重要信息。将菌株GUY11和FJ81278及其有性后代接种水稻品种Pi-d2及其亲本TP309进行毒性分析。结果表明,FJ81278含Avr-Pid2,有性后代在Pi-d2上的无毒、有毒分离比例符合1:1,推断FJ81278对Pi-d2的无毒性由单一基因座控制。通过SSR标记和转座子元件标记分析,确定Avr-Pid2定位于染色体7上,并获得了与无毒基因Avr-Pid2连锁的标记Propiz-t和ms7-27/28,它们与Avr-Pid2的遗传距离分别为6.1 cM、13.0 cM。这些标记的获得将Avr-Pid2限制在第7染色体上约420 kb物理距离范围内,为进一步的克隆奠定了良好基础。(本文来源于《热带作物学报》期刊2011年06期）
卞云龙,邓德祥,王益军,才宏伟[5]（2007）在《基于AFLP和SSR标记的高粱分子遗传连锁图构建》一文中研究指出以茎秆糖份含量高的高粱自交系1095和低糖高粱自交系N3杂交获得的F2分离群体(205个个体)为材料,采用AFLP(amplified fragment length polymorphism)和SSR(simple sequence repeat)两种分子标记,构建了包含273个(232AFLP,41SSR)标记,覆盖基因组长度为978.1cM的高粱分子标记连锁遗传图。以SSR标记为锚标记,19个连锁群中,18个连锁群各自被归并于高粱的10个连锁群(A-J)中。该连锁图平均图距和最大图距分别为3.6cM和19.4cM,未出现大的空隙(gap>25cM),归并后的10个连锁群(A-J)分别对应于高粱染色体SBI-01、SBI-02、SBI-03、SBI-04、SBI-07、SBI-09、SBI-10、SBI-08、SBI-06、SBI-05。(本文来源于《分子植物育种》期刊2007年05期）
肖炳光,徐照丽,陈学军,申爱荣,李永平[6]（2006）在《利用DH群体构建烤烟分子标记遗传连锁图》一文中研究指出以烤烟品种SpeightG-28和NC2326杂交得到的137个DH系为作图群体材料,通过ISSR和RAPD标记的遗传连锁分析,构建了包括27个连锁群、由10个ISSR标记和147个RAPD标记组成的烤烟分子标记遗传连锁图。该图谱覆盖长度1838.2cM,平均图距14.1cM。连锁群上有22个分子标记表现偏分离,其中10个集中在连锁群LG9上,其余分散在不同连锁群。这是国内外构建的第一张烤烟分子标记遗传连锁图,为烤烟性状的基因定位及分子标记辅助选择奠定了良好基础。(本文来源于《中国烟草学报》期刊2006年04期）
巩鹏涛[7]（2006）在《基于SSR标记锚定策略的大豆分子连锁图的整合》一文中研究指出遗传图谱的构建及整合仍然是植物基因组学研究的重要内容。遗传连锁图谱广泛应用在植物的标记辅助选择育种到功能基因图位克隆等方面。大豆(Glycine max)是重要的经济作物，但由于其为古源四倍体和严格自花授粉，基因组含有广泛的复制区和丰富的重复序列，使得其遗传图谱研究落后其他作物。近年来新开发的SSR标记对来自不同群体的遗传图谱的整合起着关键作用。 本研究共有叁个作图群体，RIL作图群体是重组自交系Jinf群体(晋豆23×ZDD2315)，这个包含118个单粒传代(SSD)的RIL株系；F_2作图群体是编号分别为03172和编号为03197。其中编号03172 F_2群体来自哈交96-9和ZYD677的杂交，编号03197的F_2群体来自黑农33和ZDD2315的杂交组合。这些杂交亲本在特定的性状方面有大的差异，在完成图谱整合构建的同时，今后还可以对若干重要的农艺性状进行QTL定位。 选用513对SSR引物对03172群体进行多态性筛选，共有213对引物有明显多态性，多态率为41.5％；选用531对SSR引物对03197群体进行多态性筛选，共有231对引物有多态性，多态率为43.5％。从SSR引物扩增的多态性来看，在03172和03197群体中SSR引物的扩增多态性基本与Jinf群体中的44.1％的多态性相差不大。由此可见SSR在大豆中的多态性远高于其他标记如ISSR、AFLP、RFLP和RAPD的一般不到30％的多态性。在95个株系的F_2群体03172中，共选有132对SSR引物对其进行基因型分析，其中母本基因型占27.8％，父本基因型占26.7％，杂合基因型为45.5％；在180个株系的F_2群体03197中，共选用A2和G上的26个SSR引物进行基因型分析，母本基因型为24.1％，父本基因型为21％，杂合基因型为54.8％；两个F_2组合群体均符合1:2:1的孟德尔的理论分离比率，说明两个F_2群体有正常的遗传结构，可以用于遗传作图分析。 本研究是基于“锚定SSR标记”作图策略，利用2个F_2群体，选用592对SSR引物，对宛煜嵩等利用重组自交系群体Jinf构建的含有(本文来源于《广西大学》期刊2006-06-01）
丁成龙[8]（2005）在《多花黑麦草遗传连锁图的构建及抗灰叶斑病基因的分子标记》一文中研究指出多花黑麦草(Lolium multiflorum Lam．)为黑麦草属中最具利用价值的牧草之一，也是我国南方及其它冷凉地区栽培利用面积最广的冷季型牧草。病害是影响多花黑麦草饲草产量和品质的重要因素，多花黑麦草灰叶斑病是由病原真菌Pyricularia sp.引起的一种严重病害。遗传连锁图的构建及基于基因组DNA分子标记的开发将有助于多花黑麦草的遗传及育种研究。本研究以多花黑麦草为材料，利用简并引物PCR扩增法进行多花黑麦草抗病基因类似物(RGA)的克隆并根据获得的RGA序列设计STS引物；以多花黑麦草细胞质雄性不育分离群体(CMS群体)为材料，以SSR、AFLP、EST-CAPS和RGA-CAPS等分子标记构建多花黑麦草遗传连锁图；以多花黑麦草灰叶斑病抗病植株和感病植株杂交构建F_1抗、感病分离群体，分别采用RGA-CAPS、EST-CAPS以及AFLP等分子标记方法进行抗病基因的分子标记和分析，主要结果如下：1．多花黑麦草RGA的克隆利用简并引物和巢式PCR扩增克隆法从多花黑麦草基因组中获得24000个300-500bp的DNA片段，采用单通道法对所得DNA序列进行测序，对所得序列进行公共数据库的搜索。结果表明，9344个克隆的DNA序列同已知的抗病基因或从其它植物中获得的RGA序列同源性较高，根据所得克隆的核苷酸序列的相似性，通过聚类分析将其分为185个簇，每簇中选取一个具代表性克隆作为多花黑麦草的抗病基因类似物，对185个抗病基因类似物序列进行开放阅读框的检查，舍弃无效序列，最后对115个被选择的克隆序列进行STS引物设计，成功地设计RGA-STS引物113对。2．多花黑麦草遗传连锁图的构建利用多花黑麦草假测交细胞质雄性不育(CMS)分离群体(124个个体)，以来自父本和母本的分离位点采用SSR、AFLP、EST-CAPS和RGA-CAPS等标记方法进行多态性的选择和并对父、母本分别构建遗传连锁图。母本连锁图包含362个标记位点，分别包含SSR标记240个、AFLP标记84个、EST-CAPS标记24个和RGA-CAPS标记14个，整个连锁图由LG1—LG7共7个连锁群组成，覆盖全长776.4cM，7个连锁群中最长的为LG3，135cM，最短的为LG5，85.8cM。相邻标记之间的平均距离为2.14cM。以来自父本的分离位点进行作图所得的LG1—LG7共7个连锁群，包含376个标记，其中SSR标记252个、AFLP标记82个、EST-CAPS标记29个和RGA-CAPS标记13个，连锁图全长710.0cM，7个连锁群中最长的为LG6，117.3cM，最短的为LG7，为80.5cM，相邻标记之间的平均距离为1.89cM。同已报道的多年生黑麦草遗传连锁图相比，本研究中所构建的遗传连锁图具有标记密度高、标记分布均匀和连锁图长度中等等特点。3．黑麦草RGA在基因组中的分布应用由RGA序列设计的113对RGA-STS引物进行CMS群体中各个体基因组DNA的PCR扩增，扩增产物分别以识别4到6对碱基的限制性内切酶MseⅠ、AluⅠ，HpyCH4Ⅳ、ScrFⅠ、Sau96Ⅰ、Epy188Ⅲ、DdeⅠ、NlaⅣ、HpyCH4Ⅲ，Fnu4HⅠ、Hpy188Ⅰ，AfaⅠ、MspⅠ、HaeⅢ、HhaⅠ、MboⅠ、HindⅢ、和HinfⅠ共18种进行酶切，酶切产物经2.0％琼脂糖凝胶电脉、显像和多态性检测，共检测到25对引物及相应的限制性内切酶酶切后产生多态性。所检测到的多态性位点经遗传作图，23个标记被标于多花黑麦草遗传连锁图中。结果表明多花黑麦草RGA分布于整个基因组中，但局部有RGA的聚集，其中标记RG124E11-2、RG001E01-2和RG088C11-1聚集于LG2，之间的遗传距离为8.5cM，标记RG192G09-2、RG073A04-3和RG119F12-1聚集于LG7，之间的遗传距离为10.2 cM，标记RG021F04-2和RG227D4-1聚集于LG3，标记间距离仅为2.0cM。RGA-CAPS标记聚集的位点可能存在多花黑麦草抗病基因。4．多花黑麦草抗灰叶斑病的分子标记以多花黑麦草灰叶斑病抗病个体(Sachiaoba)和敏感个体(Minamiaoba)杂交构建F_1分离群体，F_1群体的致病菌接鉴定结果显示多花黑麦草抗灰叶斑病由单个主效基因(LmPi1)控制。采用分群分离分析(BSA)法进行多花黑麦草抗灰叶斑病的AFLP和EST-CAPS以及RGA-CAPS标记筛选，筛选到27个标记同多花黑麦草抗灰斑病基因LmPi1紧密连锁，其中AFLP标记25个、EST-CAPS标记1个和RGA-CAPS标记1个。经连锁分析，结果表明，27个标记构成一个紧密连锁的连锁群，标记间最大遗传距离19.6 cM。其中12个标记包括1个EST-CAPS标记和11个聚集于相同的位点，经QTL分析，该连锁区间支持1-LOD，进一步证实本研究中多花黑麦草抗灰叶斑病由单基因所控制。EST-CAPS标记p56的限制性酶切片段同多花黑麦草LmPi1位点的抗病等位基因一致。参考对照群体的遗传连锁图，抗病基因LmPi1位于多花黑麦草的第五连锁群(LG5)。标记p56试用于多花黑麦草抗灰叶斑病抗病和感病品种的基因型分析结果表明，标记p56对于感病种质中引入抗病基因LmPi1以提高其抗病性具有重要作用。多花黑麦草抗病基因类似物的克隆以及遗传连锁图的构建将为多花黑麦草抗病基因的分子标记、抗病基因的图位克隆以及抗病育种提供了方便。(本文来源于《南京农业大学》期刊2005-12-01）
张永生,王飞,庄云龙,秦国政,张举仁[9]（2005）在《玉米分子标记连锁图的构建》一文中研究指出对于主要农作物而言,一个高质量的分子标记连锁图谱是进行大量基础研究和采用生物工程技术改良所需的重要资料。目前,已有多张利用不同材料构建的玉米分子标记连锁图谱和整合的遗传图谱。然而,玉米基因组多样性和染色体结构变异会影响到不同种质玉米的基因定位和基因克隆以及分子标记辅助育种,因此,采用不同种质材料构建玉米的遗传图谱是非常必要的。在本工作中,利用掖478×90110的F2群体构建了玉米的分子标记连锁图谱。自交系掖478具有高配合力、高产、抗倒及抗病性强等特点,为我国玉米生产做出了突出贡献。自交系90110具有高配合力和高抗玉米粗缩病等优良特性,是一个新的玉米类群-P类群的重要成员。(本文来源于《全国作物生物技术与诱变技术学术研讨会论文摘要集》期刊2005-11-01）
栾晓燕,满为群,刘鑫磊,巩鹏涛,木金贵[10]（2005）在《以构建大豆分子遗传连锁图为目的的大豆重组自交系群体的培育》一文中研究指出大豆分子遗传连锁图是大豆分子遗传学研究的重要内容,也是开展大豆基因组研究的重要平台。构建一张理想的大豆分子遗传连锁图需要有遗传多样性高、构成群体个体或家系数量足够多、可重复使用的遗传群体作基础(吕蓓等,2005)。迄今为止,还没有用一个群体就可以构建一张理想的饱和遗传连锁图的先例。国内外能用于大豆遗传连锁图研究的遗传群体相当少,国际上报道的用于大豆遗传连锁图研究的分离群体有叁套,第1个是美国农业部与依阿华州大学建立的由栽培大豆自交系A81-356022和野生大豆P1468916种间杂交而成59个F_2植株组成的分离群体;第2个是美国犹他大学由两个栽培大豆品种Min-soy 和Noirl 杂交后得到的240家系的F_7重组自交系群体;第3个是美国内布拉斯加大学的近等基因系群体,该群体由栽培大豆近等基因系Clark 和Harosoy 杂交产生的57株F_2衍生系组成。我国目前报道用于作图研究的遗传群体有3个RIL 群体。第1个是中科院遗传所陈受宜研究员等构建的由88个家系组成的重组自交系(长农4×新民6号)。第2个也是陈受宜研究员课题组与南京农业大学盖钧镒教授课题组构建的由201个家系组成重组自交系群体NJRIKY(科丰1号×南农1138-2)。第3个是刘学义研究员课题组与方宣钧研究员课题组共同构建的含有474个家系得F_(10)代大豆重组自交系Jinf(晋豆23×灰布支黑豆)(刘学义等,2003)。显而易见,用于大豆遗传连锁图构建的遗传群体是非常缺乏的,这也是大豆这样的重要作物在构建DNA 标记连锁图谱、分子遗传及基因组学研究等领域远远落后于水稻的重要原因之一。鉴于上述认识,方宣钧博士课题组和杜维广研究员课题组利用中国丰富的大豆遗传资源从2003年开始着手培育主要用于构建遗传图谱为目标的重组自交系群体(表1)。我们按照作图群体的要求,首先对亲表1大豆作图群体Table 1 Mapping populations in soybean组合类型组合名称F_1粒数F_2株数预计群体家系数(F_8)Combination type Combination name No.of F_1 grain No.of F_2 grain No.of the prefigure population line栽培豆×野生豆黑农44×ZYD7 2828 2329 1800～2100G.max×G.soja Heinong44×ZYD7栽培豆×半野生豆哈交96-9×ZYD667 2343 2130 1800～2000G.max×G.gracilis Hajiao96-9×ZYD667栽培豆×农家豆黑农33×灰布支2037 1835 1500～1800G.max×G.max Heinong33×Huibuzhi栽培豆×农家豆黑农33×灰布支1530 1337 1000～1200G.max×G.max Heinong33×Huibuzhi 本进行了严格的选择,组配了栽培豆×野生豆(G.max×G.soja),栽培豆×半野生豆(G.max×G.gracilis),栽培豆×农家豆(G.max×G.Max)叁种组合类型,以单株对单株进行杂交,采取特殊的栽培措施使每个F1单株获得尽量多的种子,然后按单粒混传的方法(刘学义等,2003),每年在海南加繁两代,在黑龙江加繁1代,无人为选择压培育大豆RIL 群体,2006年9月我们可以获得F_8代的RIL 群体。(本文来源于《2005植物分子育种国际学术研讨会论文集》期刊2005-10-01）
分子连锁图论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
分子标记遗传连锁图是基因定位、图位克隆、分子标记辅助选择育种的基础[1]。普通烟草基因组较大,分子标记多态性水平较低[2],为遗传连锁图构建、基因定位等相关研究造成较大困难。近年来,Bindler等[3-4]利用美国烟草基因组测序项目的序列数据,开发了大量SSR标记,构建了高密度烟草遗传连锁图。由于他们使用的作图群体为烤烟和晒烟品种间杂交F2群体,遗传差异相对较远,可供烤烟利用的标记数有限。在中国烟草总公司、中国烟草总公司云南省公司多个项目的资助下,云南省烟草农业科学研究院联合行业内外相关单位,开展了烟草分子标记开发、遗传连锁图构建和抗病基因定位等研究工作,取得了重要进展。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
分子连锁图论文参考文献
[1].周雁,卢兴潮,边银丙.毛木耳基因内分子标记开发与遗传连锁图构建[C].中国菌物学会2015年学术年会论文摘要集.2015
[2].肖炳光.烟草基因组计划进展篇:3.烟草分子标记遗传连锁图构建和重要抗病基因定位[J].中国烟草科学.2013
[3].殷豪,吴俊,张绍铃.梨分子遗传连锁图构建及重要农艺性状定位[J].果树学报.2012
[4].翟焕趁,王宝华,鲁国东,朱立煌,王宗华.稻瘟病菌无毒基因Avr-Pid2的分子标记及其连锁图[J].热带作物学报.2011
[5].卞云龙,邓德祥,王益军,才宏伟.基于AFLP和SSR标记的高粱分子遗传连锁图构建[J].分子植物育种.2007
[6].肖炳光,徐照丽,陈学军,申爱荣,李永平.利用DH群体构建烤烟分子标记遗传连锁图[J].中国烟草学报.2006
[7].巩鹏涛.基于SSR标记锚定策略的大豆分子连锁图的整合[D].广西大学.2006
[8].丁成龙.多花黑麦草遗传连锁图的构建及抗灰叶斑病基因的分子标记[D].南京农业大学.2005
[9].张永生,王飞,庄云龙,秦国政,张举仁.玉米分子标记连锁图的构建[C].全国作物生物技术与诱变技术学术研讨会论文摘要集.2005
[10].栾晓燕,满为群,刘鑫磊,巩鹏涛,木金贵.以构建大豆分子遗传连锁图为目的的大豆重组自交系群体的培育[C].2005植物分子育种国际学术研讨会论文集.2005
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