长春花过氧化物酶PwPOD基因克隆及其在黄龙病菌侵染后的表达变化

论文摘要

为获得长春花（Catharanthus roseus）过氧化物酶（peroxidase,POD）基因的全长cDNA序列以及黄龙病菌（Candidatus Liberibacter asiaticus）侵染后长春花POD基因（PwPOD）的表达情况,本研究根据不同作物POD基因的同源性,筛选出长春花过氧化物酶基因的引物,采用SMARTer-RACE方法扩增其3′和5′末端,运用qRT-PCR的分析病原感染后不同时间长春花叶、主茎和根中PwPOD基因的mRNA转录水平的变化。经拼接后获得PwPOD的全长cDNA序列,该基因全长1 611 bp （GenBank登录号KT032115）。生物信息学分析表明,该基因与其他已知物种的POD基因同源性达89%,编码一个无跨膜结构域,N末端含有信号肽的稳定蛋白。分析染病后长春花各组织中PwPOD的表达发现其表达量随着感染时间的增加呈先升后降的趋势,分别在嫁接后第30天（叶片）、第35天（主茎）和第35天（根）达到峰值,表达量分别上调12.8倍、3.96倍和5.53倍。证实PwPOD的表达确实受到黄龙病菌侵染的诱导,其表达量可能与寄主的抗病能力相关。

论文目录

• 1 结果与分析
•   1.1 PwPOD cDNA克隆与分析
•   1.2 PwPOD cDNA序列同源性分析
•   1.3 PwPOD cDNA分子系统进化分析
•   1.4 长春花感染黄龙病菌后PwPOD的时序表达
• 2 讨论
• 3 材料与方法
•   3.1 病原材料
•   3.2 植物材料
•   3.3 取样方法
•   3.4 提取长春花各组织总RNA后反转录cDNA
•   3.5 PwPOD基因保守片段克隆
•   3.6 PwPOD cDNA全长克隆
•   3.7 序列的生物信息学分析
•   3.8 PwPOD基因的定量表达
• 作者贡献

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 李亚,鲍敏丽,陈燕玲,许美容,邓晓玲

关键词: 长春花,过氧化物酶,基因克隆,黄龙病菌,表达分析

来源: 基因组学与应用生物学 2019年11期

年度: 2019

分类: 基础科学,医药卫生科技,农业科技

专业: 生物学,植物保护,园艺

单位: 广东海洋大学农学院,华南农业大学农学院广东省微生物信号与作物病害防控重点试验室

基金: 广东海洋大学博士启动(R17060),广东海洋大学校选课题(C17385)共同资助

分类号: Q943.2;S436.8

DOI: 10.13417/j.gab.038.005099

页码: 5099-5106

总页数: 8

文件大小: 3778K

下载量: 62