人呼吸道合胞病毒兰州株基因组全长cDNA克隆的构建及鉴定

论文摘要

目的构建用于呼吸道合胞病毒（respiratory syncytial virus,RSV）体外拯救的RSV基因组全长cDNA克隆,并进行鉴定。方法根据RSV Long株基因组序列设计并合成引物,利用RT-PCR技术分6段扩增RSV LZ01/09基因组序列并构建克隆载体;测序后,利用重叠PCR与酶切连接技术,根据基因组序列选择特异性酶切位点,引入Kpn I、Xma I和Sal I酶切位点,构建成4个亚克隆载体;将亚克隆载体的插入片段连接至经过改造且包含T7启动子、锤头状核酶、多克隆位点、丁肝核酶、T7终止子的p RSV1载体中,构建RSV基因组全长cDNA克隆;对克隆全长cDNA序列进行测定,与亲本RSV LZ01/09基因组进行同源性比对分析,并与RSV实验参比株进行系统进化树分析。结果测序结果显示,RSV LZ 01/09的基因组全长为15 204 bp,与GenBank公布的RSV基因组序列长度相当,将完整的序列提交GenBank,登录号为KY782635;酶切及测序结果显示,用于RSV全长cDNA克隆构建的基本载体p BSKS-MCS（简称p RSV1）与预期相符,RSV全长基因组cDNA克隆质粒（简称转录载体p RSV1-4F）酶切片段大小与预期一致;同源性比对结果显示,全长cDNA序列与亲本RSV LZ01/09基因组序列同源性高达99.83%;系统进化树分析结果显示,其与RSV-A亚型序列同属于一个分支。结论测序及酶切分析结果表明已成功构建RSVLZ01/09基因组全长cDNA克隆,为建立拯救RSV重组病毒的反向遗传学系统平台奠定了基础。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 毒种
•   1.2 主要试剂及仪器
•   1.3 引物设计与合成
•   1.4 RT-PCR
•   1.5 PCR产物的克隆及测序
•   1.6 载体构建
•   1.7 序列分析
• 2 结果
•   2.1 RSV兰州株基因组全长DNA的测序
•   2.2 基本载体的构建
•   2.3 RSV兰州株4个亚克隆载体的构建
•   2.4 RSV兰州株基因组全长DNA的构建与鉴定
•   2.5 序列分析
•   2.6 系统进化树分析
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 朱传凤,瓦晓霞,包红,寇桂英,傅生芳,马超

关键词: 呼吸道合胞病毒,拯救,全长克隆,序列分析

来源: 微生物学免疫学进展 2019年01期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技,基础科学

专业: 生物学,基础医学

单位: 兰州生物制品研究所有限责任公司第二研究室甘肃省疫苗工程技术研究中心

基金: 中国生物技术集团科研基金(NBG-LZ-014)

分类号: R373.14

DOI: 10.13309/j.cnki.pmi.2019.01.001

页码: 1-7

总页数: 7

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