杜仲SQS基因的特征信息分析

论文摘要

鲨烯合酶（SQS）是催化植物细胞合成甾醇和三萜类化合物的一种关键酶。为探明杜仲SQS基因家族成员的存在及其特性,本文通过生物信息学分析方法,对杜仲SQS基因（EuSQS）进行发掘,并对其进化关系、基因结构、保守基序、染色体定位、蛋白理化性质、空间结构、调控元件等进行分析。从杜仲基因组数据中获得3条EuSQS基因,它们分布于不同的scaffold上,有5～6个外显子;EuSQS蛋白含396～440 aa,相对分子质量为45.73～49.06 kDa,均属于不稳定蛋白,主要由α-螺旋和无规则卷曲构成;EuSQS1和EuSQS3在结构上较为接近,二者与EuSQS2差异较大;除含有基本元件外,EuSQSs的顺式作用元件还包括光照和激素响应、分生组织表达、逆境胁迫及类黄酮生物合成等六类;在进化关系上,杜仲EuSQSs与产胶植物橡胶草及橡胶树的亲缘关系较近。分析结果为进一步对EuSQS基因的功能鉴定和利用提供了依据。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 材料来源
•   1.2 分析方法
• 2 结果与分析
•   2.1 杜仲SQS基因家族成员组成
•   2.2 杜仲SQS基因的结构特征
•   2.3 杜仲SQS基因在染色体上的位置
•   2.4 杜仲SQS蛋白的理化特性
•   2.5 SQS蛋白的二级结构和三维结构特征
•   2.6 杜仲SQS基因的顺式作用元件组成
•   2.7 杜仲SQS基因的进化特性
• 3 结论与讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 雷跃,杨仕梅,张天缘,赵德刚,宋莉

关键词: 杜仲鲨烯合酶基因,萜类化合物,生物信息学,基因结构,功能预测

来源: 山地农业生物学报 2019年06期

年度: 2019

分类: 农业科技

专业: 农作物

单位: 贵州大学生命科学学院/农业生物工程研究院/山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室/贵州省农业生物工程重点实验室,贵州省农业科学院

基金: 国家转基因生物新品种培育重大专项(2016ZX08010003)

分类号: S567.19

DOI: 10.15958/j.cnki.sdnyswxb.2019.06.001

页码: 1-7

总页数: 7

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