论文摘要
大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)属于食肉目、大熊猫科,是保护生物中的旗舰物种,中国的"国宝"。斑秃是哺乳动物中一种常见的多基因参与的复杂性疾病,在小鼠、恒河猴、北极熊中有均有报道,表现为身体部分区域的毛发稀少和脱毛、断毛现象。圈养大熊猫中雄性斑秃较常见,通常发生在春夏季繁殖季节。为探究斑秃大熊猫斑秃发生的原因,本研究收集了5只正常大熊猫和5只斑秃大熊猫外周血液,提取总RNA,采用Illumina HiSeq 2000测序,分析差异表达基因,对差异表达基因进行GO功能注释、KEGG通路富集、PPI蛋白互作等生物信息学分析。我们共鉴定了1154个差异表达基因,其中表达上调的803个,表达下调的351个。Wnt10b作为一种毛发生长促进因子,在斑秃大熊猫中显著下调,热休克蛋白HSP90AA1与一些炎症相关基因显著上调。差异基因GO分析显著富集在一些代谢过程条目,KEGG分析显示上调基因显著富集在剪接体通路,下调基因显著富集在人类免疫疾病通路,PPI分析表明差异基因参与一些产热通路。初步结果推测大熊猫斑秃可能与炎症相关的免疫异常有关。
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文章来源
类型: 国内会议
作者: 沈海波,李才武,何鸣,吴虹林,黄炎,范振鑫,岳碧松,张修月
关键词: 大熊猫,斑秃,血液转录组,差异表达基因,功能富集
来源: 第八届中国西部动物学学术研讨会 2019-07-18
年度: 2019
分类: 基础科学
专业: 生物学,生物学
单位: 濒危动物繁殖与保护四川省重点实验室四川大学生命科学学院中国大熊猫保护中心生物资源与生态环境教育部重点实验室四川大学生命科学学院
分类号: Q953
页码: 83
总页数: 1
文件大小: 566k
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