玫瑰β-1,3-葡聚糖合成酶基因（RrCalS）克隆与生物信息学分析

论文摘要

为了探明胼胝质对玫瑰授粉亲和性的影响,本研究以‘唐红’玫瑰花柱为试材,采用RT-PCR和RACE方法获得了玫瑰β-1,3-葡聚糖合成酶基因的cDNA全长,命名为RrCalS。该基因全长5742 bp,开放阅读框5295 bp,编码1764个氨基酸。推导编码蛋白的分子量为204.7kD, PI值为9.00,在164-265位具有pfam14288结构域,在869-1642位具有pfam02364保守结构域,属于葡聚糖合成酶超家族;该蛋白属于疏水性、非分泌型蛋白,具有16个跨膜结构域,含有32个Ser磷酸化位点、21个Thr磷酸化位点、12个Tyr磷酸化位点;该蛋白的α-螺旋占49.49%,无规则卷曲占22.68%,β-转角占7.94%;该蛋白与Fragaria vesca等8种植物的Cals氨基酸序列同源性达73%以上,且它们的系统进化关系与传统分类结果一致。本研究为进一步深入研究玫瑰授粉不亲和机理,提高玫瑰育种理论和技术水平奠定了基础。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 试验材料
•   2.2 试验方法
•     2.2.1 授粉取材
•     2.2.2 总RNA提取及cDNA合成
•     2.2.3 中间片段克隆
•     2.2.4 3′RACE和5′RACE
•     2.2.5 基因序列全长拼接
•     2.2.6 基因生物信息学分析
• 2结果与分析
•   2.1玫瑰Cals基因克隆
•   2.2 RrGlu基因生物信息学分析
• 3 讨论与结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 康希泉,亓帅,臧德奎,郑林,徐宗大,邢树堂,于晓艳

关键词: 玫瑰,葡聚糖合成酶,基因克隆

来源: 山东林业科技 2019年02期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,园艺

单位: 胜利油田胜大园林工程有限公司,山东农业大学,青州市花卉产业管理局

基金: 国家自然科学基金青年项目(31200524),国家自然科学基金面上项目(31870688)

分类号: S685.12;Q943.2

页码: 8-11+22

总页数: 5

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