拟南芥微管结合蛋白MAP70-4的生物信息学分析

论文摘要

微管结合蛋白对微管蛋白的结构及功能至关重要。为能较全面地揭示拟南芥微管结合蛋白MAP70-4的结构和功能,利用生物信息学方法对该蛋白的理化性质、亲水/疏水性,信号肽,跨膜区域,磷酸化位点,卷曲螺旋结构,蛋白质二级、三级结构,亚细胞定位,表达模式,分子功能及其参与的生物学功能,以及与其它蛋白的相互作用关系进行了预测分析。结果显示,拟南芥MAP70-4蛋白是一种无信号肽,不含跨膜螺旋区域的不稳定蛋白质,属于碱性、亲水性蛋白质,翻译后会产生磷酸化修饰,该蛋白二级结构含有11个α螺旋区和5个β折叠,以及7个卷曲螺旋结构。亚细胞定位显示该蛋白主要分布在细胞质中,具有促进微管结合等功能,和其有相互作用关系的蛋白可能与叶绿体生命活动及胚胎、种子发育有关。从表达模式上看,该蛋白主要在花、果实、叶片中大量表达,根中有少量表达。通过对拟南芥微管结合蛋白MAP70-4进行系统性预测分析,可为下一步对该蛋白功能的深入研究提供理论基础和借鉴。

论文目录

• 1 材料方法
•   1.1 材料
•   1.2 方法
• 2 结果
•   2.1 MAP70-4蛋白的基本理化性质及亲/疏水性分析
•   2.2 MAP70-4蛋白的信号肽和跨膜区预测分析
•   2.3 MAP70-4蛋白的磷酸化位点预测
•   2.4 MAP70-4蛋白的二级结构及卷曲螺旋结构分析
•   2.5 MAP70-4蛋白的三级结构分析
•   2.6 MAP70-4蛋白的亚细胞定位
•   2.7 MAP70-4的互作蛋白预测
• 3 结语

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 吕毅,商澎

关键词: 拟南芥,微管结合蛋白,生物信息学,蛋白质结构和功能预测

来源: 科技通报 2019年08期

年度: 2019

分类: 基础科学

专业: 生物学

单位: 西北工业大学生命学院,空间生物实验模拟技术国防重点学科实验室,西北工业大学深圳研究院

基金: 国家自然科学基金资助项目(编号:31500235)

分类号: Q811.4

DOI: 10.13774/j.cnki.kjtb.2019.08.010

页码: 59-63

总页数: 5

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