长江下游厌氧氨氧化细菌标记基因相对丰度及影响因素

论文摘要

为探索河流系统中厌氧氨氧化细菌的分布情况,于2014年春秋两季采集长江下游6个断面的水体和沉积物样品,通过宏基因组测序方法,根据优化序列与自建厌氧氨氧化细菌标记基因hzsA, hzsB, hzsC, hdh数据集的比对结果,计算各基因相对丰度。结果表明,水体溶解氧浓度较高导致厌氧氨氧化细菌标记基因丰度极低,而沉积物中各基因相对丰度较高,平均值分别为4.540×10-10, 4.939×10-10, 4.333×10-10和2.859×10-10。随着温度升高,秋季沉积物中各基因相对丰度显著高于春季。大通、南京和徐六泾沉积物中各基因相对丰度较高,这与人类活动扰动的增强以及入海口盐度升高有关。物种分类鉴定结果表明,长江下游沉积物中厌氧氨氧化细菌在属水平上以Candidatus Brocadia和Candidatus Jettenia为主。厌氧氨氧化细菌标记基因相对丰度与NO2--N,NO3--N和NH4+-N等理化因子相关,并且,由于NO2--N浓度远远低于NH4+-N,因此NO2--N浓度是长江下游沉积物中厌氧氨氧化细菌生长的限制性因子。

论文目录

• 1 研究方法
•   1.1 样品采集
•   1.2 水体及沉积物理化指标测定
•   1.3 DNA提取
•   1.4 宏基因组测序及分析
•   1.5 统计分析
• 2 结果与讨论
•   2.1 基因相对丰度及时空变化规律
•   2.2 物种组成
•   2.3 影响因素
• 3 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 王海英,潘瑞,刘树枫,赵云鹏,党晨原,倪晋仁

关键词: 长江下游,厌氧氨氧化细菌,标记基因,物种组成

来源: 北京大学学报(自然科学版) 2019年03期

年度: 2019

分类: 基础科学,工程科技Ⅰ辑

专业: 生物学,环境科学与资源利用

单位: 北京大学环境工程系北京市新型污水深度处理工程技术研究中心

基金: 国家重点研发计划(2016YFC0402102)资助

分类号: X52;X172

DOI: 10.13209/j.0479-8023.2019.021

页码: 519-525

总页数: 7

文件大小: 1505K

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