人HLA-DPB1基因及蛋白的生物信息学分析

论文摘要

HLA-DPB1是MHC区域基因编码的跨膜糖蛋白,是人类免疫系统的重要组成部分。本研究采用生物信息数据库和分析软件对人HLA-DPB1基因的结构、单核苷酸多态性位点（SNP）、蛋白的理化特性、跨膜结构域、信号肽、亚细胞定位、二级结构、三级结构、磷酸化位点、组织表达情况及蛋白相互作用网络进行预测分析。结果表明,人HLA-DPB1基因位于6号染色体,有8种可变剪接体,SNP位点132个,其中移码突变12个,同义突变33个,错义突变87个。人HLA-DPB1蛋白由258个氨基酸组成,含有一个跨膜区和一个信号肽的亲水蛋白,主要定位于细胞内。其二级结构主要元件为无规卷曲和延伸链,三级结构预测结果可信。人HLA-DPB1蛋白有18个磷酸化位点,其中丝氨酸的磷酸化位点最多。人HLA-DPB1蛋白在肺、肾上腺及骨髓等组织表达量较高,并且人HLA-DPB1蛋白存在相互作用的蛋白多数在免疫反应中起重要作用。

论文目录

• 1 结果与分析
•   1.1 人HLA-DPB1基因基本信息
•   1.2 人HLA-DPB1的理化特性预测
•   1.3 人HLA-DPB1信号肽预测
•   1.4 人HLA-DPB1跨膜区、亚细胞定位预测
•   1.5 人HLA-DPB1二级结构预测
•   1.6 人HLA-DPB1三级结构预测
•   1.7 人HLA-DPB1磷酸化位点预测
•   1.8 人HLA-DPB1在不同组织中的表达预测
•   1.9 人HLA-DPB1蛋白质相互作用网络预测
• 2 讨论
• 3 材料与方法
•   3.1 来源
•   3.2 分析方法
• 作者贡献

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 易珊,廖娟,李寻亚,袁小燕,王烨,张朝晖

关键词: 生物信息学,蛋白质结构,免疫

来源: 基因组学与应用生物学 2019年10期

年度: 2019

分类: 基础科学,医药卫生科技

专业: 生物学,生物医学工程

单位: 南华大学公共卫生学院

基金: 国家自然科学基金(81573193),湖南省自然科学基金面上项目(2015JJ2125),湖南省研究生科研创新项目(CX2018B629)共同资助

分类号: Q811.4

DOI: 10.13417/j.gab.038.004389

页码: 4389-4394

总页数: 6

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