纳污河流抗性基因和微生物群落相关性

论文摘要

通过Miseq高通量测序分析和荧光定量PCR技术,研究某纳污河流中四环素类与磺胺类抗性基因(ARGs)的分布特征、传播情况及微生物群落结构相关性.结果表明:在河流地表水与沉积物中均检测到四环素类抗性基因tetA和tetB与磺胺类抗性基因sul1和sul2,四环素类抗性基因和磺胺类抗性基因的绝对丰度分别为5.09×10~3～1.26×10~7,3.94×10~5～1.32×10~9copics/L,磺胺sul1抗生素抗性基因丰度显著高于其它基因;河流主要优势菌门为Proteobacteria,Bacteroidetes,Firmicutes,Actinobacteria和Cyanobacteria,其平均总相对丰度占总比例的95.62%,且总体差异较小.抗性基因与微生物群落冗余分析显示, Methylotenera菌属是影响tetA抗性基因分布丰度的主要因素, Dechloromonas和Clostridium sensu stricto 1菌属是影响tetB抗性基因分布丰度的主要因素,Dechloromonas、Clostridium sensu stricto 1和Methylotenera菌属是影响sul1、sul2抗性基因分布丰度的主要因素.

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 样品采集
•   1.2 水样分析
•   1.3 样品抽滤及DNA提取
•   1.4 PCR检测
•     1.4.1 PCR扩增
•     1.4.2 抗性基因定性检测
•     1.4.3 抗性基因定量检测
•   1.5 统计分析
• 2 结果与讨论
•   2.1 抗生素抗性基因的分布
•   2.2 微生物群落多样性分析
•   2.3 微生物菌群结构分析
•     2.3.1 在门分类水平上分析
•     2.3.2 在属分类水平上分析
•   2.4 抗性基因和微生物群落相关性
• 3 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 罗晓,张文丽,袁立霞,许曼,何磊,蒋永丰,钟为章,张迎

关键词: 抗性基因,荧光定量,高通量测序,微生物群落结构

来源: 中国环境科学 2019年06期

年度: 2019

分类: 工程科技Ⅰ辑,基础科学

专业: 生物学,环境科学与资源利用

单位: 河北科技大学环境科学与工程学院河北省污染防治生物技术实验室,河北科技大学建筑工程学院

基金: 国家自然科学基金资助项目(51708170)

分类号: X172;X522

DOI: 10.19674/j.cnki.issn1000-6923.2019.0310

页码: 2606-2613

总页数: 8

文件大小: 1118K

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