石松类和蕨类植物质体基因组结构演化研究进展

论文摘要

近年来,随着测序技术的发展,石松类和蕨类植物的核基因组、质体基因组以及线粒体基因组研究发展迅速,质体基因组研究工作更是呈爆发式增长。截至2019年3月1日,GenBank公布的石松类和蕨类植物的175个质体基因组中,约3/4为最近两年新增。研究内容从早期对个别质体基因组结构和序列特征的简单报道,逐渐发展到综合性的比较基因组学和系统发育基因组学研究。目前已发表的质体基因组覆盖了石松类和蕨类植物的所有目和大部分科,这两大类群的质体基因组结构变异和系统发育的基本框架已逐渐清晰。这些研究为我们理解维管植物的早期演化提供了重要参考。本文对石松类和蕨类植物的质体基因组结构特征进行了系统梳理,发现其结构变异主要包括大片段倒位、IR区边界变动、基因或内含子丢失等,其中一些结构变异可作为较高分类阶元的共衍征。RNA编辑和长片段非编码序列插入普遍存在于石松类和蕨类植物的质体基因组中,但其起源、演化机制和功能等仍不清楚。我们对质体基因组的应用、系统发育研究中质体和核基因组的优劣性,以及系统发育基因组学的前景进行了评述。

论文目录

• 1质体基因组结构演化
•   1.1石松类质体基因组结构演化
•   1.2蕨类植物质体基因组结构演化
•   1.3 RNA编辑
•   1.4长片段非编码序列插入
• 2质体基因组的系统发育应用和展望
•   2.1质体基因组的系统发育应用
•   2.2系统发育基因组学展望
• 3小结和展望

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 杜新宇,卢金梅,李德铢

关键词: 石松类,蕨类,质体基因组,基因组结构变异,编辑,长片段非编码序列插入,系统发育基因组学

来源: 生物多样性 2019年11期

年度: 2019

分类: 基础科学

专业: 生物学

单位: 中国科学院昆明植物研究所中国西南野生生物种质资源库,中国科学院大学昆明生命科学学院

基金: 中国科学院重大科技基础设施开放研究项目（2017-LSF-GBOWS-02）,云南省科技领军人才培养计划（2017HA014）

分类号: Q943.2

页码: 1172-1183

总页数: 12

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