六十二株水貂源大肠杆菌分离株耐药表型与耐药基因及克隆菌群分析

论文摘要

为了调查诸城地区某水貂养殖场粪便源大肠杆菌的表观及其分子特征,采集某个水貂养殖场的水貂粪便进行大肠杆菌分离鉴定,对分离鉴定的大肠杆菌进行血清型鉴定和对14种常见抗菌药物的耐药表型鉴定;使用PCR检测耐药基因以及Ⅰ整合子基因盒的携带情况,利用多位点序列分型（MLST）来分析菌株的克隆关系并构建系统发育树来分析相同克隆群菌株的遗传相似性。结果显示,自82份水貂粪便样品分离到62株大肠杆菌,分离率75.61%;大肠杆菌分离株对AMP和TET的耐药率超过90%,多重耐药菌株（MDR）占比为85.48%。PCR检测到5类耐药基因的存在,qnrS检出率最高,为61.29%（38/62）;aaC2、aaC4、sul1和aac（6′）-Ib-cr耐药基因与菌株产生相应的耐药抗性存在一致性（P<0.01）。分离菌株中Ⅰ类整合子可变区域的优势结构为dfrA27-aadA2-qnrA。鉴定出致病性血清型的存在,且对应菌株都具有多重耐药性,优势血清型为O104:H4。分离株中存在33个STs,ST46为优势STs（16.13%）,具有3个主要克隆群,依次为CC10、CC46和CC176;与致病性相关菌株的STs和人源大肠杆菌具有共同的遗传背景。本研究表明,养殖场的水貂受到致病性和多重耐药性大肠杆菌的污染,相同克隆群菌株的耐药基因分布具有多态性,表观特征差异明显。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 样品采集
•   1.2 分离鉴定和菌株保存
•   1.3 血清型鉴定
•   1.4 耐药表型的检测
•   1.5 耐药基因和Ⅰ类整合子基因盒的检测
•   1.6 多位点序列分型和系统发育分析
•   1.7 数据处理
• 2 结 果
•   2.1 大肠杆菌分离鉴定
•   2.2 耐药表型分析
•   2.3 耐药基因检测和统计分析
•   2.4 Ⅰ类整合子基因盒的检测
•   2.5 血清型鉴定
•   2.6 MLST序列类型和克隆群分析
• 3 讨 论
• 4 结 论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 蒋智宇,王凡,杨溢,衣首静,杨杰,鞠孜敬,宋艳,朱国强,孙淑红

关键词: 水貂源大肠杆菌,致病性血清型,耐药基因,克隆群,系统发育树

来源: 畜牧兽医学报 2019年12期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,畜牧与动物医学

单位: 山东农业大学,扬州大学兽医学院,山东省动物生物工程与疾病防治重点实验室,山东省畜禽疫病防制工程技术研究中心

基金: “十三五”国家重点研发计划(2017YFD0500105),泰山学者计划(201511023),山东省“双一流”计划

分类号: S852.612

页码: 2498-2508

总页数: 11

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