犬细小病毒临床分离株VP2基因进化分析

论文摘要

为了对犬细小病毒临床分离株的VP2基因进行遗传变异分析,了解本地区犬细小病毒流行的优势型别及病毒变异情况。采集2例患犬细小病毒病的动物粪便,提取病毒基因组,设计特异性引物,PCR扩增VP2基因,对扩增产物测序,对序列结果与同属其他毒株VP2基因序列用MEGA 7和MegAlign进行同源性分析和遗传进化分析。同时比较其氨基酸变异情况。结果显示,PCR扩增出VP2基因,测序结果显示大小为1 755 bp,2株病毒VP2基因NCBI序列登录号分别为MH155192和MH155193, MH155192与MF467233.1和JQ743891.1的核苷酸同源性为99.9%,MH155193与KY937651.1、KP260509.1、KY937641.1核苷酸同源性为99.8%。MH155192主要位点氨基酸分别为为267Y,324I,370Q,426D,440A。MH155193主要位点氨基酸分别为267Y,324I,370R,426E,440T。且2株病毒297位均为A。表明分离到的2株病毒分别为新CPV-2b和CPV-2c型。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 病料
•   1.2 试剂
•   1.3 方法
•     1.3.1 引物设计
•     1.3.2 病毒基因组DNA提取
•     1.3.3 VP2基因的扩增
•     1.3.4 连接与转化
•     1.3.5 阳性重组质粒的鉴定
•     1.3.6 序列测定与分析:
• 2 结果
•   2.1 PCR扩增结果
•   2.2 核苷酸遗传进化及同源性分析
•   2.3 氨基酸变异分析
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 温峰琴,项海涛,郝宝成,邢小勇,包世俊,胡永浩

关键词: 犬细小病毒,基因,序列分析

来源: 中国兽医杂志 2019年12期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,畜牧与动物医学

单位: 甘肃农业大学动物医学院,中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所

基金: 盛彤笙科技创新基金(GSAU-STS-1521),甘肃农业大学动物医学院教研产学支持计划(JYCX-KX014)

分类号: S852.655

页码: 41-45

总页数: 5

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