桦褐孔菌GPD基因cDNA序列和启动子的克隆与分析

论文摘要

利用RACE和染色体步移技术首次从桦褐孔菌中克隆得到三磷酸甘油醛脱氢酶（GPD）基因和启动子序列。桦褐孔菌GPD基因的cDNA序列全长1 223 bp,其中,编码区1 020 bp,共编码339个氨基酸,相对分子质量约为36.39 kDa,理论等电点为8.28。序列比对结果表明:桦褐孔菌GPD基因与鲍姆桑黄（Sanghuangporusbaumii）相似度为88%。利用染色体步移技术方法克隆得到GPD基因起始密码子上游446 bp启动子序列,分析表明在152 bp和160 bp处有2个转录起始位点,含有TATA、CAAT、CCAAT box及重要顺势作用元件LTR、O2-site、circadian、Sp1、TCCC-motif等,这将为桦褐孔菌菌株的分类鉴定、功能研究及高效表达载体的建立提供基因资源。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 供试菌株
•   1.2 主要试剂
•   1.3 菌核培养与RNA、DNA提取
•   1.4 GPD基因的克隆
•   1.5 GPD基因启动子的克隆
• 2 结果与分析
•   2.1 GPD基因序列分析
•   2.2 GPD基因编码蛋白的生物信息学分析
•     2.2.1 氨基酸序列比对分析
•     2.2.2 三磷酸甘油醛脱氢酶基因的亚细胞定位预测
•     2.2.3 IoGPD的保守结构域和功能域分析
•     2.2.4 疏水性分析
•     2.2.5 IoGPD的二级结构预测
•   2.3 GPD启动子的克隆
•   2.4 三磷酸甘油醛脱氢酶启动子序列分析
• 3 讨论与结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 张宇婷,朴钟云,刘迪,曲柏宏

关键词: 桦褐孔菌,基因,启动子,克隆,序列分析

来源: 延边大学农学学报 2019年04期

年度: 2019

分类: 农业科技

专业: 农作物

单位: 延边大学农学院,沈阳农业大学园艺学院

基金: 国家自然科学基金项目(31160408,31460536)

分类号: S567.3

DOI: 10.13478/j.cnki.jasyu.2019.04.002

页码: 7-13

总页数: 7

文件大小: 2525K

下载量: 108