论文摘要
目的了解全沟硬蜱细菌的群落结构及种群多样性。方法应用罗氏454高通量测序技术对内蒙古地区全沟硬蜱细菌16S rDNA基因的V3高变异区段进行测定,分析其细菌的群落结构、种群多样性、优势菌群以及常见病原体的分布。结果获得用于分析的序列和操作分类单元（OTUs）数目分别为22 727条和1 570个;所有样本的覆盖度均≥0.95,表明本次测序量充分,基本可覆盖所有细菌物种。其中,雄蜱样本的丰富度指数、多样性指数最高,分别为2 431和4.11;其次为雌蜱和卵。全沟硬蜱中优势菌群依次为变形菌门、厚壁菌门、放线菌门,其中以α-变形菌纲相对丰度最高;在属水平上,不同类别样本中相对丰度较高的菌属组成差异较大。在样本中检测到致病菌塔拉塞维奇立克次体、螺原体和宫本疏螺旋体,环境细菌如金黄杆菌属、欧文菌、短波单胞菌等,以及母系遗传共生菌（Montezuma）。结论内蒙古地区全沟硬蜱不同样本间细菌群落和丰度具有较大差异。
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文章来源
类型: 期刊论文
作者: 李思思,张晓雨,张艳凯,刘敬泽
关键词: 全沟硬蜱,细菌群落结构,多样性,罗氏高通量测序
来源: 中国媒介生物学及控制杂志 2019年06期
年度: 2019
分类: 医药卫生科技,基础科学
专业: 生物学,基础医学
单位: 河北省动物生理生化与分子生物学重点实验室河北师范大学生命科学学院,衡水学院生命科学学院
基金: 国家自然科学基金(31802008)~~
分类号: R384.4
页码: 607-612
总页数: 6
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