拟南芥NSP家族基因序列分析及响应干旱胁迫表达分析

论文摘要

芥子油苷是十字花科植物中的一种重要的次生代谢产物,它被酶水解的降解过程与植物响应逆境胁迫有关。NSP蛋白是一类能与黑芥子酶结合从而改变芥子油苷降解途径最终生成腈类物质的特异蛋白,其与ESP家族蛋白在功能上存在冗余。本研究以拟南芥NSP家族基因为对象,对家族成员基因序列、蛋白质序列、启动子序列进行生物信息学分析,并使用实时荧光定量PCR技术检测了该家族基因在干旱胁迫下的表达量。结果表明:该家族成员基因分布于3条染色体上,外显子数目2～4个;AtNSP5蛋白亚细胞定位于细胞核,其他成员定位于细胞质;结构域预测显示,该家族蛋白均含有4个Kelch结构域,除AtNSP5外,其他四个成员还含有1～2个Jacalin结构域;启动子序列中均含有CAAT-box、TATA-box核心元件及数量不一的逆境响应元件;干旱胁迫表达量分析显示,该家族中AtNSP5基因受干旱胁迫诱导表达,其他成员响应干旱胁迫不显著。本研究为进一步研究NSP蛋白在植物响应干旱胁迫中的分子机制提供依据,并为植物抗旱基因工程提供潜在候选基因。

论文目录

• 1 结果与分析
•   1.1 拟南芥NSP家族基因基本信息
•   1.2 拟南芥NSP家族基因结构分析
•   1.3 拟南芥NSP家族基因编码蛋白序列分析
•   1.4 AtNSP家族基因启动子序列分析
•   1.5 拟南芥NSP基因家族成员响应干旱胁迫表达分析
• 2 讨论
• 3 材料与方法
•   3.1 试验材料
•   3.2 拟南芥NSP家族基因序列分析
•   3.3 拟南芥NSP家族基因启动子序列分析
•   3.4 拟南芥平板培养及胁迫处理
•   3.5 干旱胁迫下AtNSP家族基因表达量分析
• 作者贡献

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 姚正培,谢莉,阿斯姆古丽·奥斯曼

关键词: 拟南芥,家族,生物信息学分析,干旱胁迫,基因表达

来源: 分子植物育种 2019年04期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学

单位: 新疆农业大学农业生物技术重点实验室

基金: 国家自然科学基金地区基金项目(31660070),新疆农业大学大学生创新创业训练计划项目(dxscx2017012)共同资助

分类号: Q943.2;Q945.78

DOI: 10.13271/j.mpb.017.001169

页码: 1169-1174

总页数: 6

文件大小: 173K

下载量: 239