酶法合成核苷三磷酸和脱氧核苷三磷酸

酶法合成核苷三磷酸和脱氧核苷三磷酸

论文摘要

核苷三磷酸(NTP)和脱氧核苷三磷酸(dNTP)不仅是重要的生化物质,也广泛应用于医药、食品和科学研究。本文中联合利用冰核蛋白(INP)进行细胞表面展示的核苷酸激酶(INP-N-NMKase)与乙酸激酶(INP-N-ACKase)的多酶合成体系,由核苷酸或脱氧核苷酸(NMP/dNMP)一步式生成NTP/dNTP,其中,偶联了 ACKase/ACP催化的磷酸供体ATP循环再生体系。通过ATP的循环再生,反应起始只需要添加少量(底物浓度1/20,UMP反应时需添加1/5)ATP即可满足反应需求。将来自保加利亚乳杆菌的核苷酸激酶nmk(包括cmk、amk、tmk和umk)基因片段和乙酸激酶ack基因片段分别插入到含有冰核蛋白N端基因inp-n的质粒pET-28a(+)下游,构建表面展示菌E-INP-N-NMK和E-INP-N-ACK,导入到大肠杆菌进行表达。以完整细胞作为催化剂,5mM底物的反应体系中,CTP、dCTP转化率分别为96%、93%,ATP、dATP转化率均达到96%,dTTP转化率为90%,UTP转化率为80%,反应过程中无明显产物降解。表面展示的融合蛋白在37℃下温育,尤其在底物存在下,稳定性得到显著提升,不亚于甚至优于胞内游离酶。并且由于整细胞的特性,通过离心回收重复利用可达8次以上。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 第1章 前言
  •   1.1 核苷三磷酸类物质简介
  •     1.1.1 核苷三磷酸
  •     1.1.2 脱氧核苷三磷酸
  •   1.2 核苷三磷酸类物质的合成
  •     1.2.1 传统合成方法
  •     1.2.2 基于NTP循环再生的酶法合成
  •   1.3 多酶级联催化体系简介
  •   1.4 完整细胞生物催化研究
  •   1.5 研究目的与流程
  • 第2章 联合表面展示的CMKase和ACKase合成dCTP和CTP
  •   2.1 实验材料
  •     2.1.1 菌株与质粒
  •     2.1.2 实验生化试剂
  •   2.2 实验方法
  •     2.2.1 基因组提取
  •     2.2.2 质粒抽提
  •     2.2.3 引物序列设计及质粒构建方案
  •     2.2.4 目的基因的扩增及纯化
  •     2.2.5 PCR纯化产物与质粒双酶切
  •     2.2.6 琼脂糖凝胶电泳与片段回收
  •     2.2.7 目的片段与质粒的连接
  •     2.2.8 重组质粒的转化及验证
  •     2.2.9 目标蛋白的诱导表达
  •     2.2.10 聚丙烯酰胺凝胶电泳
  •     2.2.11 蛋白含量检测
  •     2.2.12 酶活检测
  •     2.2.13 CTP和dCTP的生物酶法合成
  •     2.2.14 核苷酸的测定
  •   2.3 实验结果与讨论
  •     2.3.1 SDS-PAGE蛋白电泳分析
  •     2.3.2 重组菌酶活测定
  •     2.3.3 应用完整细胞E-CMK酶法合成(d)CTP
  •     2.3.4 温度对表面展示INP-N-CMKase反应的影响
  •     2.3.5 反应热稳定性研究
  •     2.3.6 表面展示整细胞E-INP-N-CMK添加量对(d)CTP合成的影响
  •     2.3.7 不同磷酸供体对(d)CTP合成的影响
  •     2.3.8 磷酸供体浓度对(d)CTP合成的影响
  •     2.3.9 完整细胞E-NP-N-CMK的重复利用
  •   2.4 本章小结
  • 第3章 联合表面展示的AMKase和ACKase合成(d)ATP
  •   3.1 实验材料
  •     3.1.1 菌株与质粒
  •     3.1.2 实验生化试剂
  •   3.2 实验方法
  •     3.2.1 引物序列设计
  •     3.2.2 蛋白含量检测和酶活检测
  •     3.2.3 ATP和dATP的生物酶法合成
  •   3.3 实验结果与讨论
  •     3.3.1 SDS-PAGE蛋白电泳分析
  •     3.3.2 重组菌酶活测定
  •     3.3.3 完整细胞E-AMK催化合成(d)ATP
  •     3.3.4 温度对表面展示INP-N-AMKase反应的影响
  •     3.3.5 反应热稳定性研究
  •     3.3.6 E-INP-N-AMK添加量对(d)ATP合成的影响
  •     3.3.7 不同磷酸供体对(d)ATP合成的影响
  •     3.3.8 磷酸供体浓度对(d)ATP合成的影响
  •     3.3.9 完整细胞E-NP-N-AMK的重复利用
  •   3.4 本章小结
  • 第4章 联合细菌表面展示的TMKase和ACKase合成dTTP
  •   4.1 实验材料
  •     4.1.1 菌株与质粒
  •     4.1.2 实验生化试剂
  •   4.2 实验方法
  •     4.2.1 引物序列设计
  •     4.2.2 蛋白含量检测和酶活检测
  •     4.2.3 dTTP的生物酶法合成
  •   4.3 实验结果与讨论
  •     4.3.1 SDS-PAGE蛋白电泳分析
  •     4.3.2 重组菌酶活测定
  •     4.3.3 完整细胞E-TMK催化合成dTTP
  •     4.3.4 温度对表面展示INP-N-TMKase反应的影响
  •     4.3.5 INP-N-TMKase热稳定性研究
  •     4.3.6 应用E-INP-N-TMK完整细胞酶法合成dTTP
  •     4.3.7 不同磷酸供体对dTTP合成的影响
  •     4.3.8 磷酸供体浓度对dTTP合成的影响
  •     4.3.9 整细胞催化剂的重复利用研究
  •   4.4 本章小结
  • 第5章 联合表面展示的UMKase和ACKase合成UTP
  •   5.1 实验材料
  •     5.1.1 菌株与质粒
  •     5.1.2 实验生化试剂
  •   5.2 实验方法
  •     5.2.1 引物序列设计
  •     5.2.2 蛋白含量检测和酶活检测
  •     5.2.3 UTP的生物酶法合成
  •   5.3 实验结果与讨论
  •     5.3.1 SDS-PAGE蛋白电泳分析
  •     5.3.2 重组菌酶活测定
  •     5.3.3 完整细胞E-UMK催化合成UDP
  •     5.3.4 温度对表面展示INP-N-UMKase反应的影响
  •     5.3.5 INP-N-UMKase热稳定性研究
  •     5.3.6 表面展示整细胞E-INP-N-UMK添加量对UTP合成的影响
  •     5.3.7 不同磷酸供体对UTP合成的影响
  •     5.3.8 磷酸供体浓度对UTP合成的影响
  •     5.3.9 完整细胞E-NP-N-UMK的重复利用
  •   5.4 本章小结
  • 第6章 结论与展望
  •   6.1 结论
  •   6.2 展望
  • 参考文献
  • 致谢
  • 附录Ⅰ
  • 文章来源

    类型: 硕士论文

    作者: 丁翌

    导师: 欧伶

    关键词: 核苷三磷酸,核苷酸激酶,乙酸激酶,表面展示,循环再生

    来源: 华东理工大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学

    单位: 华东理工大学

    分类号: Q54

    DOI: 10.27148/d.cnki.ghagu.2019.000120

    总页数: 86

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