导读:本文包含了染色体构建论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:染色体,图谱,芥菜,标记,病毒,油菜,片段。
染色体构建论文文献综述
邓成艳[1]（2019）在《基于数学模型构建减数分裂染色体数目变化的教学设计》一文中研究指出根据构建数学模型的一般流程:模型准备、模型假设、模型建立、模型检验、模型应用,对"减数分裂"一节中染色体数目的变化进行模型构建,使学生掌握相关知识,理解建模过程,提高建模能力。(本文来源于《中学生物教学》期刊2019年08期）
孟卓玲,曹玉洁,单丹丹,方春,缪小菲[2]（2019）在《秀水134为背景的染色体片段代换系的构建》一文中研究指出染色体片段代换系作为发掘和鉴定有利基因的有力工具得到了广泛的应用。本研究以秀水134为背景亲本,以扬稻6号为供体亲本,构建了一套染色体片段代换系。该代换系包含53个株系,其代换片段长度在7.4～182.15 cM之间,占水稻全基因组的0.49%～12.15%,平均占水稻全基因组的5.0%。这套代换系的代换片段总长度为1 995 cM,覆盖水稻基因组的1.33倍。本文还对染色体片段代换系的构建策略和应用进行了讨论。(本文来源于《中国稻米》期刊2019年02期）
赵姬[3]（2019）在《巧用四合扣和软磁片构建染色体系列模型》一文中研究指出利用四合扣和软磁片制作的染色体系列模型,可以较好地解决其他模型所存在的一些问题,如无法吸附在白板上进行演示、染色体两臂不能自由移动、着丝点无法一分为二、无法呈现染色体与DNA的数量关系、无法在染色体上标注基因……从而使学生更好地对微观、抽象的染色体行为变化有一个直观、感性的认识,能够取得良好的教学效果。(本文来源于《教育与装备研究》期刊2019年03期）
刘青霞[4]（2019）在《基于下一代测序技术构建42个常染色体短串联重复序列分型体系》一文中研究指出目的:在法医实践检案中,常常遇到失踪人口身份认定、复杂亲缘关系鉴定等疑难案件,对这些案件的鉴定,通常需要检测更多的遗传标记,获得更多的遗传信息。短串联重复序列(short tandem repeats,STR)仍然是目前法医DNA分析主流的遗传标记,应用毛细管电泳技术构建复合分型体系,目前可以做到一个体系中复合20多个STR位点,但仍不能满足实际需求。下一代测序技术(next generation sequencing,NGS)不受荧光标记限制可以在一个体系中检测更多遗传标记,而且可以同时获得各基因座的长度和序列信息,增加了STR的有效等位基因数目,提高了信息含量,是解决上述疑难案件的更好选择。因此,本研究拟选取目前法医DNA检验过程中常用的42个常染色体STR和Amelogenin基因构建NGS-STR分型体系,基于Illumina MiSeq FGx~(TM)平台进行测序,建立测序数据的分析模块和方法;对分型体系进行法医学应用评估,为NGS-STR分型技术的发展提供新数据,为需要联合应用多个试剂盒的STR位点达到检测目的疑难案件提供新的检测方案。方法:1.NGS-STR分型体系构建:从本课题组生物样本库中选取58个健康无关个人全基因组DNA样本,选取2800 Control DNA作为阳性对照标准品,使用Qubit~(TM) dsDNA HS Assay Kit进行DNA定量,利用Nano-Q~(TM)微型分光光度计检测DNA纯度。选取法医学常用的42个常染色体STR和Amelogenin基因(D1S1656、CSF1PO、D10S1248、D10S1435、D11S2368、D12S391、D13S317、D13S325、D14S608、D15S659、D16S539、D17S1290、D18S51、D18S535、D19S253、D19S433、D20S470、D21S11、D21S1270、D22-GATA198B05、D2S1338、D2S441、D3S1358、D3S1744、D3S3045、D4S2366、D5S2500、D5S818、D6S1043、D6S477、D7S1517、D7S3048、D7S820、D8S1132、D8S1179、D9S925、FGA、Penta D、Penta E、TH01、TPOX、vWA、Amelogenin),采用下一代测序的分子条形码及单端特异性引物延伸技术合成NGS-STR分型体系分型试剂。按照QIAseq Targeted DNA Custom Panel说明构建文库,DNA起始模板量为20 ng,纯度为1.8~2.0。应用MiSeq上机测序试剂盒对文库进行均一化、变性和稀释。使用Illumina Experiment Manager(IEM)进行上机测序参数设置,运用MiSeq FGx~(TM)平台的RUO(Research Use Only Run)模式进行测序。2.测序数据分析:运用Linux系统与hg19版本参考基因组进行序列比对,选取STR两端长度3~10bp不等的特异序列进行匹配和筛选目标区域序列信息,且每个STR基因座的特异性匹配筛选标准较为个性化。通过对国际法医遗传学会的命名指南推荐命名进一步调整,使其与CE分型结果间具有兼容性。3.NGS-STR分型体系法医学应用评估:比较同一文库在不同参数(双端测序(Pair-End,PE)PE150和PE300)下的进行测序参数;对2800 Control DNA中42个STR和Amelogenin基因的核心序列进行测序验证,评估分型结果的准确性;比对58个样本的NGS-STR和CE-STR分型结果,评价其一致性;对2800 Control DNA重复3次构建文库进行重复性研究;将2800 Control DNA以不同起始DNA模板量(10 ng、5 ng、2.5 ng、1.25ng和0.625 ng)构建文库并上机测序评估灵敏度;将2个样本以不同混合比(1:1、1:2、1:4和1:9)构建文库并上机测序进行混合样本研究。结果:1.实验过程质量评估对所构建的文库进行片段质检结果表明,文库既没有小片段接头也没有大片拖尾峰,与预期峰图一致;摩尔浓度质检结果表明,空白对照孔CT值>29、标准曲线斜率在-3.1~-3.5、复孔间的标准差<0.4、扩增效率在90%~110%,质检合格。本实验过程中的3次测序的主要质控指标碱基质量分数(Quality Score)Q30、簇密度(cluster density)和簇通过率(Clusters Passing Filter)平均值分别为85.47%、1007.33 K/mm~2和91.5%,均满足Illumina官方认定可用结果。同一文库采用双端(Pair-End,PE)150测序和PE300两种参数测序,结果表明,两次测序分型结果完全一致。同时,在其他条件不变的情况下,随着双端测序读长PE增加,测序可用数据相对增加。2.NGS-STR分型体系的实验室评估在5%的分析阈值下,能过滤掉绝大多数的背景噪音并进行正确分型,所有样本平均总测序深度为147207×;基因座的平均DoC为2688×;在基因座序列构成比中,%Allele、%Stutte、%Noise平均值分别为97.01%、2.64%、0.35%;所有基因座ACR平均值为0.741。3.准确性和一致性该分型体系对2800 Control DNA的所有基因座的核心序列信息检测结果与ForenSeq~TMM DNA Signature Prep Kit测序和Sanger测序结果一致。对2800 Control DNA测序结果研究发现,9个常染色体STR基因座的NGS-STR分型和CE-STR分型的命名存在不兼容现象,根据序列比对结果对这些基因座进行了核心序列的重复次数修正,提出了新的命名策略。按照新的命名策略进行命名,本实验58个样本的2494个基因座进行NGS-STR分型和CE-STR分型比对,2487个(99.72%)基因座的NGS和CE分型结果完全一致。同时,在23个基因座中观察到新增同等位基因191个。4.重复性和灵敏度研究3次重复性实验等位基因分型一致,并且%Allele和ACR经统计学检验均无显着性差异,表明分型体系重复性良好。在5%的分析阈值下,起始DNA模板量降至2.5 ng时,可以对各基因座进行准确分型。当起始模板量为1.25 ng时,样本的测序深度、%Allele出现了锐减现象,%Stutter和%Noise呈现反向增加的趋势。对不同起始模板量ACR分析,当起始模板量在2.5 ng时,ACR变异系数相对较小(20.8%);当起始模板量降至0.625 ng时,变异系数增高到41.1%,各基因座间的离散程度增大。5.混合物分析在5%的分析阈值下,混合比为1:1和1:2的样本没有发生等位基因的丢失;混合比为1:4和1:9的样本中均出现了低组分等位基因丢失现象。并且随着样本混合比的增大,呈现出等位基因检出数目减少、丢失数目增多、检出率降低的趋势。6.群体遗传学分析对58个无关个体NGS-STR分型数据进行群体遗传学参数分析,所有基因座的等位基因频率均符合Hardy-Weinberg平衡,各基因座均呈连锁平衡状态。对长度多态性和序列多态性所获得的杂合度Het、个人识别概率DP和多态性信息含量PIC进行比较,表明通过NGS检测STR的多态性较CE结果有明显的提高。结论:本研究构建了42个常染色体STR和Amelogenin基因的NGS-STR分型体系、测序数据分析方法及命名策略,具有较好的准确性、灵敏度和重复性,对混合样本分型具有较好的应用价值,为NGS-STR分型技术的发展提供新数据,为需要联合应用多个试剂盒的STR位点达到检测目的疑难案件提供新的检测方案。(本文来源于《河北医科大学》期刊2019-03-01）
李乐,刘芳瑛,陆赢,刘忠松[5]（2019）在《芥菜型油菜A9染色体物理图谱构建和结构变异分析》一文中研究指出以四川黄籽自交系和紫叶芥自交系多次杂交形成的F6代重组自交系(RIL)群体为材料,运用基因分析技术,构建芥菜型油菜遗传图谱。采用锚定BAC的方法,构建重迭群,最终构建了由16个重迭群共计538个BAC组成的芥菜型油菜A9染色体物理图谱,参考芥菜基因组,估计该物理图谱长度为46.26 Mb,与已发表的白菜、甘蓝型油菜和芥菜参考基因组进行比较,发现芥菜型油菜A9染色体均发生了倒位和缺失等结构变异。(本文来源于《湖南农业大学学报(自然科学版)》期刊2019年01期）
刘娅梅,乔永峰,顾一奇,柳畅,许梦微[6]（2018）在《猪源伪狂犬病病毒变异株AH02LA株细菌人工染色体的构建与鉴定》一文中研究指出为构建猪源伪狂犬病病毒(PRV)变异株AH02LA的细菌人工染色体(BAC),本研究将转移载体pHA2-pUC19-H1-H2的DNA与PRV AH02LA株基因组DNA共转染鸡胚成纤维细胞(CEF)进行同源重组,利用转移载体中的GFP为筛选标记,获得携带GFP基因的gE/gI基因缺失突变株PRV-AH02LA(gE-/gI-)-pHA2。提取纯化的该重组病毒DNA转化E.coli DH10B,对获得的阳性克隆命名为BAC~(PRV-G)。提取BAC~(PRV-G)的DNA,将含gE、gI和其上下游同源片段的DNA与BAC~(PRV-G)的DNA共转染CEF,获得gE、gZ基因恢复的病毒命名为PRVAH02LA~(Rec)。比较亲本株PRV AH02LA、基因缺失株和恢复株的生长动力学,结果表明,恢复株的生长特性与亲本株无显着差异。本研究成功构建了PRV变异株AH02LA的BAC,并证实其为全基因组的感染性克隆,为PRV变异株的致病机理研究和新型疫苗研制提供了重要的平台。(本文来源于《中国预防兽医学报》期刊2018年10期）
翁炳焕,徐威,苏岚,沈敏,李蓉[7]（2018）在《脂质体介导SV40LT基因转染构建羊水染色体核型分析质控细胞系研究》一文中研究指出目的:研究羊水染色体核型分析质控细胞系的构建方法。方法:以T4DNA连接经BamHⅠ单酶切的SV40LTag-pcDNA和pcDNA3.1 (-) DNA,重组SV40LTag-pcDNA3.1(-)克隆,以脂质体介导法将重组克隆转染至染色体结构异常的羊水细胞,以G418筛选阳性克隆,观察细胞系的传代生长特性及其作为染色体核型分析质量评估的可行性。结果:构建了染色体核型为46,XY,t(8; 19)(q24.3;q13.1)的羊水细胞系,传至第15代的细胞系经染色体核型分析,其核型与原代细胞一致。结论:染色体结构异常的羊水细胞转染SV40LT基因后可转化为无限扩增且染色体核型稳定的细胞系,从而制成羊水细胞染色体核型分析的质控细胞系。(本文来源于《浙江大学学报(医学版)》期刊2018年05期）
田然[8]（2018）在《玉米染色体片段导入系群体构建及雄穗分枝数QTL qTBN7-1定位分析》一文中研究指出染色体片段导入系群体(Chromosome Segment Substitution Lines,CSSLs)是进行QTL精细定位及基因克隆的理想材料,是通过回交及自交选择出覆盖作物全基因组的供体片段构建起来的次级作图群体。本研究通过使用掖478与齐319构建了一套包含180份材料的染色体片段导入系群体,并对该群体进行了10个性状的QTL分析。主要研究结果如下:(1)以掖478为轮回亲本、齐319为供体亲本,使用在MaizeGDB数据库中筛选出的132个多态性SSR引物,以及根据掖478、齐319全基因组重测序序列设计的68个InDel标记,对导入系群体进行基因型分析。通过连续多代回交并自交,最终获得180份染色体片段导入系,片段覆盖玉米10条染色体200个分子标记,背景恢复率达到98%以上。(2)于2016年、2017年在北京昌平和顺义对染色体片段导入系群体进行两年四点田间表型鉴定,大部分性状的变异率均小于15%,说明本实验的误差控制较好。共检测到5个玉米农艺性状72个QTL,其中13个株高QTL,穗位高24个、雄穗长13个、雄穗分枝数18个、节间数4个;以及5个玉米穗部性状43个QTL,其中11个穗长QTL,6个穗粗QTL,6个穗行数QTL,10个粒长QTL,10个粒宽QTL。(3)染色体片段导入系CL103在bin7.02区域控制雄穗分枝数QTL,通过与掖478回交构建次级群体开展精细定位工作。利用完备区间作图法将该主效QTL定位在第7染色体110,088,645-110,160,101 bp区域,LOD值为25.06,可解释11.47%的表型,加性效应为1.74。该精细定位区间包含14个候选基因,包括已报道的玉米雄穗分枝数突变体基因ramosa1(ra1)。前人研究结果表明,候选基因ra1编码拟南芥同源顺反异构酶家族蛋白,该基因在玉米雄穗中表达量较高,能够显着增加雄穗分枝数。(本文来源于《沈阳农业大学》期刊2018-06-15）
李乐[9]（2018）在《芥菜型油菜A9染色体物理图谱构建和结构变异分析》一文中研究指出作为芸薹属叁个异源四倍体之一的芥菜型油菜在世界上有很长的种植历史。芥菜型油菜是由白菜和黑芥杂交产生的,漫长的进化过程中染色体是否发生变异、产生了什么类型的结构变异等还不为人们所知。研究者首先利用开发的各种标记来进行变异分析,后来,随着测序技术的不断完善,人们开始探究对芥菜型油菜进行全基因组测序,期望从序列水平解答进化过程中发生的结构变异。作为芥菜型油菜A基因组最长的一条染色体,A9染色体上有很多控制植株性状的基因。因此,构建芥菜型油菜A9染色体遗传图谱和物理图谱对芥菜型油菜研究和生产具有指导意义。利用不基于参考序列基因型分析的方法开发标记,最终获得一张芥菜型油菜高密度遗传图谱。同时,基于标记定位的BAC进行BAC双末端测序,利用BAC末端序列、白菜基因组、芥菜型油菜GSS序列等设计引物来筛选BAC文库构建芥菜型油菜A9染色体物理图谱。以四川黄籽自交系和紫叶芥进行自交系多次杂交形成的172个RIL单株及2个亲本为材料,利用基因分型技术鉴定大量的SNP位点,开发高密度GBS标记。最终开发的15,543个标记定位在18条染色体上,遗传图总长为1,526.8cM,每条染色体平均有888个标记,平均标记密度为0.751cM。将遗传位置相同的标记划分为一个标记簇(bin),最后得到了2,085个bin。将A9染色体上的GBS标记锚定在白菜和甘蓝型油菜A9染色体参考基因组上进行共线性分析,发现与白菜、甘蓝型油菜A9染色体存在大小不一的结构变异。通过标记锚定BAC的方法来构建重迭群,同时在参考基因组基础上通过BES锚定BAC,最终构建了由16个重迭群共计538个BAC组成的芥菜型油菜A9染色体物理图谱。将BAC末端序列映射到芥菜型油菜参考基因组上,估计该物理图谱长度为46.26Mb。与已发表的白菜、甘蓝型油菜和芥菜参考基因组A9染色体比较,发现芥菜型油菜A9染色体均发生了倒位和缺失等结构变异。(本文来源于《湖南农业大学》期刊2018-06-01）
耿青,肖炜,李大宇,邹芝英,祝璟琳[10]（2018）在《尼罗罗非鱼1号染色体分离及文库构建方法研究》一文中研究指出以尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)为对象,采用体内注射植物血细胞凝集素(PHA)方式收集有丝分裂后期的鱼体头肾细胞,低渗法制片,运用激光显微分离获得尼罗罗非鱼1号染色体,分离后的单染色体通过特异性酶切和LA-PCR体外扩增,得到500~2 000 bp之间的DNA片段,并通过Southern blot和微卫星标记得到验证。扩增片段通过电泳回收、连接转化、感受态细胞培养等步骤构建尼罗罗非鱼1号染色体微克隆文库,克隆片段长度在300~600 bp之间。(本文来源于《淡水渔业》期刊2018年04期）
染色体构建论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
染色体片段代换系作为发掘和鉴定有利基因的有力工具得到了广泛的应用。本研究以秀水134为背景亲本,以扬稻6号为供体亲本,构建了一套染色体片段代换系。该代换系包含53个株系,其代换片段长度在7.4～182.15 cM之间,占水稻全基因组的0.49%～12.15%,平均占水稻全基因组的5.0%。这套代换系的代换片段总长度为1 995 cM,覆盖水稻基因组的1.33倍。本文还对染色体片段代换系的构建策略和应用进行了讨论。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
染色体构建论文参考文献
[1].邓成艳.基于数学模型构建减数分裂染色体数目变化的教学设计[J].中学生物教学.2019
[2].孟卓玲,曹玉洁,单丹丹,方春,缪小菲.秀水134为背景的染色体片段代换系的构建[J].中国稻米.2019
[3].赵姬.巧用四合扣和软磁片构建染色体系列模型[J].教育与装备研究.2019
[4].刘青霞.基于下一代测序技术构建42个常染色体短串联重复序列分型体系[D].河北医科大学.2019
[5].李乐,刘芳瑛,陆赢,刘忠松.芥菜型油菜A9染色体物理图谱构建和结构变异分析[J].湖南农业大学学报(自然科学版).2019
[6].刘娅梅,乔永峰,顾一奇,柳畅,许梦微.猪源伪狂犬病病毒变异株AH02LA株细菌人工染色体的构建与鉴定[J].中国预防兽医学报.2018
[7].翁炳焕,徐威,苏岚,沈敏,李蓉.脂质体介导SV40LT基因转染构建羊水染色体核型分析质控细胞系研究[J].浙江大学学报(医学版).2018
[8].田然.玉米染色体片段导入系群体构建及雄穗分枝数QTLqTBN7-1定位分析[D].沈阳农业大学.2018
[9].李乐.芥菜型油菜A9染色体物理图谱构建和结构变异分析[D].湖南农业大学.2018
[10].耿青,肖炜,李大宇,邹芝英,祝璟琳.尼罗罗非鱼1号染色体分离及文库构建方法研究[J].淡水渔业.2018
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