西藏青稞根际土壤可培养放线菌的遗传多样性及其促生功能分析

西藏青稞根际土壤可培养放线菌的遗传多样性及其促生功能分析

论文摘要

【目的】认识藏区青稞根际土壤中可培养放线菌的遗传多样性及应用价值。【方法】采集藏区青稞根际土壤,对根际样品中的放线菌进行分离,测定分离菌株的溶磷能力、抗病促生(IAA产量)能力,并运用反转录重复因子扩增(BOXA1RPCR)技术、16S r RNA基因测序和系统发育分析系统分析可培养放线菌的系统发育地位。【结果】通过7种培养基共分离得129株放线菌菌株,其中有51株菌株(占总分离菌株的39.5%)产IAA,8株产量较高(>57 mg/L),77株(占总分离菌株的60.0%)表现出溶磷活性。基于BOXA1R-PCR图谱,采用平均连锁聚类法(UPGMA)进行聚类分析,129株菌被分成19种不同的遗传图谱类型。基于分离菌株的菌落特征和遗传聚类图谱选取32株代表菌株进行16S rRNA基因序列测定。通过Mothur软件对分离菌株进行OTUs(operational taxonomic units)聚类分析,共得到5个OTU分类单元,其中以OTU1为主。系统发育显示代表菌株分属于链霉菌属(Streptomyces),拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis),类诺卡氏菌属(Nocardioides),小单孢菌属(Micromonospora),放线菌属(Actinomyces)等5个属,其中链霉菌属(Streptomyces)为优势种属。【结论】西藏青稞根际土中放线菌多样性明显,这些放线菌中蕴藏着大量的有开发应用前景的菌株。

论文目录

  • 1 材料和方法
  •   1.1 材料
  •     1.1.1 采样点介绍
  •     1.1.2 样品采集
  •     1.1.3 培养基
  •     1.1.4 植物病原菌菌株
  •     1.1.5 主要试剂和仪器
  •   1.2 试验方法
  •     1.2.1 放线菌分离
  •     1.2.2 分泌吲哚乙酸(IAA)特性测定
  •     1.2.3 溶磷特性测定
  •     1.2.4 抗病活性测定
  •     1.2.5 DNA提取及BOXA1R-PCR分析
  •     1.2.6 16S rRNA基因测序
  •   1.3 数据处理
  • 2 结果与分析
  •   2.1 土样理化性质
  •   2.2 土壤放线菌的分离计数
  •   2.3 不同菌株分泌吲哚乙酸(IAA)能力
  •   2.4 不同菌株溶磷能力
  •   2.5 放线菌拮抗特性评价
  •   2.6 BOXA1R-PCR分析与系统发育分析
  • 3 讨论与结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 高雪,辜运富,尼玛扎西,刘国一,刘婷,刘怡,普布贵吉

    关键词: 青稞根际,放线菌,多样性,功能分析

    来源: 四川农业大学学报 2019年06期

    年度: 2019

    分类: 农业科技

    专业: 农作物

    单位: 省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传国家重点实验室/西藏自治区农牧科学院农业资源与环境研究所,四川农业大学资源学院

    基金: 西藏自治区重点研发项目“新型有机肥引进与研发(XZ201702NB09)”

    分类号: S512.3

    DOI: 10.16036/j.issn.1000-2650.2019.06.005

    页码: 777-784

    总页数: 8

    文件大小: 3510K

    下载量: 203

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