导读:本文包含了基因编码蛋白论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:拟南芥,运输载体蛋白(SWEET4),理化性质,结构特征
基因编码蛋白论文文献综述
刘晓柱,李银凤[1]（2019）在《拟南芥AtSWEET4基因启动子序列、编码蛋白结构分析及其在病原菌胁迫下表达特性检测》一文中研究指出【目的】分析拟南芥糖运输载体蛋白基因(AtSWEET4)启动子序列及其编码蛋白的结构,并检测病原菌胁迫下AtSWEET4基因的表达特性,为研究AtSWEET4蛋白在拟南芥生长发育和生物胁迫中的作用机制提供理论依据。【方法】采用生物信息学方法分析AtSWEET4基因启动子序列及其编码蛋白的结构,并采用实时荧光定量PCR(qRTPCR)和β-葡萄糖苷酸酶(GUS)组织染色法检测人工接种菜豆晕疫病菌(Pseudomonas syringae pv. phaseolicola,Psp)NPS3121和丁香假单胞菌番茄致病变种(Pseudomonas syringae pathovar tomato,Pst)DC3000后AtSWEET4基因的表达情况。【结果】AtSWEET4蛋白由251个氨基酸组成,分子量为27.8 kD,分子式为C1300H2038N304O346S11,理论等电点(pI)为8.71,脂肪氨基酸指数为118.76,不稳定指数为38.72,平均亲水性指数为0.629,为稳定的亲水蛋白,且含有7个跨膜结构域,无信号肽,为非分泌型蛋白。AtSWEET4蛋白与芥属的亚麻荠和荠菜SWEET4蛋白亲缘关系最近,其次是十字花科的甘蓝和萝卜SWEET4蛋白,与禾本科的二穗短柄草SWEET4蛋白亲缘关系最远。AtSWEET4基因启动子序列中包含核心元件TATA-box、增强子元件CAAT-box、调控植物生长发育相关元件、激素响应相关元件、非生物胁迫响应相关元件和生物胁迫响应相关元件。Psp NPS3121和Pst DC3000均可诱导AtSWEET4基因表达,但表达模式不同:接种Psp NPS3121后6和12 h的AtSWEET4基因表达明显上调,但至接种后24 h又迅速下降;接种Pst DC3000后AtSWEET4基因表达量逐渐增加。【结论】AtSWEET4基因的启动子序列特征及其编码蛋白结构与其参与植物免疫反应密切相关。(本文来源于《南方农业学报》期刊2019年09期）
阳林江,汪铭书,程安春[2]（2019）在《疱疹病毒UL11基因及其编码蛋白的研究进展》一文中研究指出疱疹病毒在自然界分布广泛,可以感染两栖类、禽类、哺乳类,也能感染灵长类和人类。多数疱疹病毒感染后可以引起机体不同程度的临床症状和病理变化,如血管损伤、组织出血、消化道黏膜丘疹样病变、淋巴器官和实质器官的变性[1-2];但也有感染后无临床症状和病理变化的,如成年猪感染伪狂犬病毒为隐性感染[3]。疱疹病毒感(本文来源于《中国预防兽医学报》期刊2019年08期）
刘田,万李,周勇,段佳熙,管茶香[3]（2019）在《结核分枝杆菌Rv1787基因编码蛋白PPE25的原核表达及生物信息学分析》一文中研究指出目的构建结核分枝杆菌Rv1787基因的原核表达质粒进行体外表达,运用生物学信息分析方法分析Rv1787基因编码蛋白PPE25的生物学特征。方法以结核分枝杆菌H37Rv基因组DNA为模板,PCR法扩增Rv1787基因,并与表达载体pET-32a构建重组质粒。原核表达重组质粒,SDS-PAGE分析表达产物并利用亲和层析的方法进行纯化。利用生物信息学软件ProtParam分析PPE25蛋白的理化性质,TMPRED和SignalP4.1 Service预测蛋白的跨膜区和信号肽,NPS@SOPMA和Swissmodel分别预测蛋白的二级结构和叁级结构,Bepipred 1.0b server和DNAStar综合预测蛋白的B细胞抗原表位,综合运用SYFPEITHI、BIMAS、NetCTL、RANKPEP、NetMHCⅡPAN 4.0 server预测蛋白的CTL细胞表位,综合运用SYFPEITHI、RANKPEP、NetMHCⅡpan 3.2 server预测蛋白的Th细胞表位。结果 pET-32a-Rv1787重组质粒测序结果与目的基因完全一致;SDS-PAGE分析表明,该融合蛋白以包涵体形式存在,相对分子质量为56×10~3,与预期大小相符。生物信息学分析结果显示,PPE25蛋白为疏水性蛋白,含多个跨膜结构域,无信号肽。二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲构成,结构比较松散。综合多种表位预测软件分析结果,筛选出3个优势B细胞抗原表位,7个CTL优势抗原表位和9个Th优势抗原表位。结论成功构建结核分枝杆菌PPE25蛋白编码基因Rv1787重组原核表达质粒,并利用生物信息学筛选出多个优势抗原表位,为进一步研究PPE25蛋白在结核病发生发展中的作用奠定了基础。(本文来源于《中国病原生物学杂志》期刊2019年07期）
聂向民,朱海峰,朱传福,乔文本,刘艳[4]（2019）在《HLA新等位基因A~*02:355序列及其编码蛋白分子叁维结构模拟分析》一文中研究指出目的:鉴定分析HLA新等位基因A*02:355的序列变异并预测分析其氨基酸残基改变在编码蛋白分子叁维空间结构中的影响。方法:应用Luminex SSO流式、PCR-SBT及单等位基因特异性测序对1例A位点变异序列进行鉴定。应用Phyre2蛋白折迭识别在线服务器以及RasMol和PDB Protein Workshop分析软件,对其编码蛋白分子叁级结构及其氨基酸残基改变特点在MHC分子叁维空间结构中所处位置及可能影响进行模拟分析。结果:相较于A*02:03:01,其第98、102位核苷酸发生T->A、A->C替代,导致其编码氨基酸发生9F→Y改变。其编码蛋白分子叁维结构模拟分析表明,该氨基酸变异位置位于α1和α2结构域抗原多肽结合凹槽β折叠片层底面的第1β股链的中心位置,该位置亦参与构成抗原多肽结合凹袋B和凹袋C。结论:该等位基因序列被WHO HLA命名委员会正式命名为A*02:355。分析预测此编码氨基酸改变将可能影响其MHC分子的抗原多肽结合及呈递功能。(本文来源于《中国免疫学杂志》期刊2019年13期）
董晴晴[5]（2019）在《疾病相关基因编码蛋白固有无序特征研究》一文中研究指出固有无序蛋白是在生理状态下缺乏稳定叁维结构的一类特殊蛋白,在生命活动中行使多种功能,并且与人类疾病有着密切的关联。研究表明许多与疾病相关的蛋白大部分都是固有无序蛋白,但由于实验和计算难度大等原因,多数研究还只是集中在少数蛋白,缺少针对疾病相关基因及其编码蛋白固有无序特征的大规模研究。因此,为了揭示疾病相关基因与固有无序蛋白之间的关系,本文以实验证实的肾细胞癌和宫颈癌相关基因为基础,充分利用多种生物信息工具,系统研究了疾病相关基因编码蛋白固有无序特征,注释了疾病相关基因对应核酸序列及其编码蛋白序列的固有无序区及其重要结合位点信息,从结合位点角度分析了蛋白质无序区/有序区与疾病之间的潜在关联,在此基础上构建了目前首个疾病相关基因及固有无序蛋白数据库,为今后固有无序蛋白相关研究奠定了坚实的理论基础和数据库资源,论文工作主要如下:1.疾病相关基因固有无序蛋白的分布特征本文以实验验证的肾癌基因数据库和宫颈癌基因数据库为基础,分别获取了蛋白质序列和与其对应的CDS,经过序列翻译后核对和去除重复序列等环节,最终分别构建了肾癌(211条)与宫颈癌(781条)相关基因CDS及其编码蛋白数据集。基于该数据集,本文利用生物信息学方法,通过Disprot数据库、MobiDB数据库和SPOT-Disorder软件,获取各序列蛋白质固有无序区信息,并分别对蛋白质数据集及其对应CDS数据集进行固有无序区位置注释。结果得到肾癌相关固有无序蛋白119条,在肾癌蛋白数据集中占比例为56.40%;宫颈癌相关固有无序蛋白558条,在宫颈癌蛋白数据集中占据比例高达71.45%,因而固有无序蛋白在两种癌症基因中均有高比例的分布,表明疾病相关蛋白中多数为固有无序蛋白,这与近年来固有无序蛋白研究推断相一致。2.疾病相关基因在核酸及蛋白层次结合位点分布特征分析为了能够进一步分析固有无序蛋白与疾病之间的潜在联系,本文从作用位点角度出发,对677条具有固有无序蛋白注释的疾病相关基因分别在蛋白质层面和核酸层面进行相关结合位点的预测。结果显示结合位点在不同层面上分布有所差异,在蛋白质层面有绝大多数序列能够预测出结合位点,其中仅有3条序列不含有蛋白质-肽结合位点,在含有结合位点的固有无序蛋白中,结合位点位于有序区的序列数居多,仅少部分结合位点偏好无序区;而在核酸层面上有491条DNA序列预测出DNA-转录因子结合位点,对其中有序区和无序区均含有结合位点的少数序列进一步分析发现,更多DNA-转录因子结合位点偏好无序区。3.疾病相关基因与固有无序蛋白数据库构建在上述研究基础上,本文构建了首个疾病相关基因与固有无序蛋白数据库,在当前版本中包含疾病相关基因677条,其中119条为肾癌基因,558条为宫颈癌基因。数据库中提供了各基因在核酸及蛋白质层次对应有序区/无序区位点信息,同时提供了核酸及蛋白序列层次预测得到的相互作用位点信息。用户可通过登录http://biophy.dzu.edu.cn/D-Disprot/index.php直接访问,该数据库为今后固有无序蛋白及疾病研究提供了可靠数据资源。(本文来源于《山东师范大学》期刊2019-06-06）
郭佳[6]（2019）在《拟南芥HOOKLESS1基因的功能研究及其编码蛋白的抗体制备》一文中研究指出双子叶植物种子在黑暗中萌发时,为了使植物快速穿破土壤见光并进行光合作用,形成顶端弯钩结构来保护植物幼嫩分生组织不受损害。顶端弯钩的形成受生长素、赤霉素和乙烯等激素以及光照等外界环境条件的复杂调控。研究表明乙烯应答基因HOOKLESS1对顶端弯钩的形成具有调控作用。此外,拟南芥HLS1基因还参与调控生长素的分布和糖响应基因的表达以及植物免疫。本研究以拟南芥HLS1基因为研究对象,以HLS1突变体hls1-1和Salk_136528c为材料,对HLS1基因进行克隆和功能的研究。得出以下实验结果:(1)通过对不同环境的T2代转基因植物进行GUS组织化学染色,结果显示HLS1主要在植物新生组织和器官中表达。通过拟南芥WT叶肉细胞原生质体转化实验对HLS1进行亚细胞定位发现HLS1定位在细胞核和晚期内体,推测HLS1与内体参与的生物学途径有关。系统进化树和蛋白序列比对分析发现HLS1的生物学功能具有较强保守型。(2)构建二元表达载体,以HLS1基因突变体hls1-1和Salk_136528c为遗传背景,农杆菌转化法过表达HLS1建立回复系。对回复系的研究发现,过表达HLS1可以使hls1-1和Salk_136528c顶端弯钩缺失、早花以及碳饥饿诱导衰老下的早衰表型均回复为野生型,说明HLS1参与调控顶端弯钩的形成和植物叶片衰老。(3)构建pET28a-HLS1原核表达载体,转化到BL21(DE3),用异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)诱导获得重组蛋白HLS1-His。镍柱亲和纯化重组蛋白后免疫家兔获得抗HLS1血清,利用抗原亲和纯化抗血清获得HLS1多克隆抗体,并在HLS1转基因株系中检测HLS1的表达。成功制备拟南芥HLS1多克隆抗体,为HLS1在植物发育中的功能研究奠定基础。(本文来源于《西北农林科技大学》期刊2019-06-01）
周小龙,符策纠,李冰,丁晓雯,林晋军[7]（2019）在《稻瘟菌无毒基因AvrPii编码蛋白分子特性及转基因水稻的构建》一文中研究指出为了解稻瘟菌无毒基因AvrPii在水稻病原菌相关分子模式诱导的免疫反应(PTI)抗病分子信号调控中的功能,对AvrPii基因编码蛋白的分子结构特性进行分析,构建了AvrPii基因的植物表达载体幵进行遗传转化。结果表明:AvrPii蛋白由70个氨基酸组成,相对分子质量约为7 500,等电点为6.0,总平均亲水性值为–0.159;AvrPii蛋白包含1个信号肽、1个跨膜结构域和2个基序为LxAR和CxxCxxxxxxxxxxxH的保守结构域;利用农杆菌侵染转化法,获得AvrPii基因全长序列和不含信号肽AvrPiinsp的转基因株系13个,PCR扩增和实时荧光定量PCR鉴定结果表明,AvrPii和AvrPiinsp基因已成功转入受体品种日本晴幵得到稳定表达。(本文来源于《湖南农业大学学报(自然科学版)》期刊2019年02期）
黎维丽,余乃通,李俊成,王健华,李宾宾[8]（2019）在《香蕉条斑病毒ORF Ⅰ基因克隆及编码蛋白和同源物的生物信息学分析》一文中研究指出【目的】探明杆状DNA病毒属病毒的ORFⅠ基因功能。【方法】本研究从香蕉条斑病毒云南分离株(BSV-YN)中克隆了BSV ORFⅠ基因,通过核苷酸和氨基酸序列分析和同源关系分析,确定了BSV-YN的分类地位;对其编码蛋白及同源物的理化性质、氨基酸序列组成、亲疏水性、跨膜区域、信号肽、亚细胞定位、磷酸化位点、同源结构域、蛋白二级和叁级结构等进行预测和分析。【结果】BSV ORFⅠ基因片段大小为528 bp,编码175个氨基酸,通过核苷酸和氨基酸序列分析和同源关系分析,确定了BSV-YN属于BSGFV种。生物信息学分析表明,BSV-YN ORFⅠ及同源蛋白都是不稳定的、亲水性蛋白,以丝氨酸和苏氨酸磷酸化为主。这些蛋白二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成,无信号肽或跨膜区域。亚细胞定位预测表明,BSV-YN ORFⅠ及同源蛋白主要在细胞核分布,推测它们在病毒感染的宿主细胞核中发挥重要作用。【结论】推测BSV-YN ORFⅠ在病毒感染的宿主细胞核中参与病毒复制、转录等相关过程。本研究为进一步开展该蛋白的功能研究提供科学线索。(本文来源于《果树学报》期刊2019年05期）
王星宇,徐玥,戴欣池,付欣,王茜[9]（2019）在《人CDC73基因编码蛋白的理化性质及功能研究》一文中研究指出采用生物信息学方法对人CDC73 (cell division cycle 73)基因编码蛋白的理化性质、亲疏水性、跨膜区域、信号肽区域、二级结构、叁级结构、蛋白质之间的相互作用、亚细胞定位进行预测分析。使用多种分析软件对人CDC73基因编码蛋白进行预测分析。研究可知,人CDC73基因属于抑癌基因,该基因编码一个由531个氨基酸组成的肿瘤抑制因子Parafibromin,其等电点为9.63,半衰期为30 h且在哺乳动物中高度保守;二级结构预测发现13个α螺旋和10个β折叠片层,叁级结构预测结果的可靠性达69.01%,亚细胞定位主要分布于细胞质及细胞核。由本研究可知,人CDC73基因编码蛋白是一个存在核定位序列的不稳定亲水蛋白,在细胞内广泛分布并参与多种生命活动过程,且能够抑制肿瘤的产生。对人CDC73基因编码蛋白结构和功能的预测分析,可为其进一步的研究提供一定的理论依据,也为相关疾病的诊治提供新的思路。(本文来源于《基因组学与应用生物学》期刊2019年01期）
赵国欢,张小兵,李凡,李为民[10]（2019）在《柑橘黄龙病病原CLIBASIA＿03230基因的克隆及其编码蛋白的原核表达》一文中研究指出【目的】柑橘黄龙病(Citrus Huanglongbing,HLB)是由韧皮部杆菌(Candidatus Liberibacter spp.)引发的重要柑橘病害。本试验利用生物信息学方法分析韧皮部杆菌全基因组,推测CLIBASIA_03230基因(命名为Clsp11)编码分泌蛋白,克隆该基因并构建其原核表达载体,表达、纯化Clsp11蛋白,以用于制备特异抗体。【方法】利用CTAB法从感染柑橘黄龙病病原的长春花中提取总DNA,以此为模板经PCR扩增Clsp11,并克隆至pMD18-T载体,挑取阳性克隆测序验证;利用无缝克隆技术将Clsp11克隆至原核表达载体pET30a,通过PCR和酶切鉴定筛选阳性克隆,命名为pET30a-Clsp11;转化大肠杆菌BL21,经IPTG诱导,表达N-端融合6×His标签的Clsp11重组蛋白,SDS-PAGE电泳检测,分析目的蛋白的表达水平,并利用镍柱进行纯化。【结果】Clsp11蛋白成功表达,IPTG诱导5 h表达量显着提高,主要以包涵体形式存在于宿主菌中。【结论】本研究克隆了柑橘黄龙病病原Clsp11基因,构建了原核表达载体pET30a-Clsp11,并成功表达、纯化了Clsp11重组蛋白,为进一步制备特异性抗体和研究Clsp11生物学功能奠定了基础。(本文来源于《云南农业大学学报(自然科学)》期刊2019年01期）
基因编码蛋白论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
疱疹病毒在自然界分布广泛,可以感染两栖类、禽类、哺乳类,也能感染灵长类和人类。多数疱疹病毒感染后可以引起机体不同程度的临床症状和病理变化,如血管损伤、组织出血、消化道黏膜丘疹样病变、淋巴器官和实质器官的变性[1-2];但也有感染后无临床症状和病理变化的,如成年猪感染伪狂犬病毒为隐性感染[3]。疱疹病毒感
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
基因编码蛋白论文参考文献
[1].刘晓柱,李银凤.拟南芥AtSWEET4基因启动子序列、编码蛋白结构分析及其在病原菌胁迫下表达特性检测[J].南方农业学报.2019
[2].阳林江,汪铭书,程安春.疱疹病毒UL11基因及其编码蛋白的研究进展[J].中国预防兽医学报.2019
[3].刘田,万李,周勇,段佳熙,管茶香.结核分枝杆菌Rv1787基因编码蛋白PPE25的原核表达及生物信息学分析[J].中国病原生物学杂志.2019
[4].聂向民,朱海峰,朱传福,乔文本,刘艳.HLA新等位基因A~*02:355序列及其编码蛋白分子叁维结构模拟分析[J].中国免疫学杂志.2019
[5].董晴晴.疾病相关基因编码蛋白固有无序特征研究[D].山东师范大学.2019
[6].郭佳.拟南芥HOOKLESS1基因的功能研究及其编码蛋白的抗体制备[D].西北农林科技大学.2019
[7].周小龙,符策纠,李冰,丁晓雯,林晋军.稻瘟菌无毒基因AvrPii编码蛋白分子特性及转基因水稻的构建[J].湖南农业大学学报(自然科学版).2019
[8].黎维丽,余乃通,李俊成,王健华,李宾宾.香蕉条斑病毒ORFⅠ基因克隆及编码蛋白和同源物的生物信息学分析[J].果树学报.2019
[9].王星宇,徐玥,戴欣池,付欣,王茜.人CDC73基因编码蛋白的理化性质及功能研究[J].基因组学与应用生物学.2019
[10].赵国欢,张小兵,李凡,李为民.柑橘黄龙病病原CLIBASIA＿03230基因的克隆及其编码蛋白的原核表达[J].云南农业大学学报(自然科学).2019
标签：拟南芥; 运输载体蛋白(SWEET4); 理化性质; 结构特征;