DNA条形码技术在白洋淀流域浮游动物调查中的应用

论文摘要

DNA条形码在物种鉴定中得到了有效的应用,有助于分类学和生物多样性研究.本研究基于线粒体COI基因序列,使用邻接法(neighbor joining method,NJ)和最大似然法(maximum Likelihood,ML)构建系统发育树,对2018年5月在白洋淀流域采集的浮游动物样品进行初步研究.结果表明,在对桡足类的系统发育树分析时,NJ树和ML树的结果保持一致,而且和形态学鉴定结果保持一致.在对枝角类的系统发育树的分析中,NJ树和ML树的结果有所差异,和形态学鉴定结果也有所不同,分析原因,可能是由于拼接序列时剪短了部分序列,使序列间差异性变小引起误差.总体上看,基于COI基因的DNA条形码可以有效地应用到白洋淀流域的浮游动物鉴定中,并可以逐步完善,最终建立一个完整的DNA条形码数据库.

论文目录

• 1 材料和方法
•   1.1 样本的采集和形态鉴定
•     1.1.1 样品采集
•     1.1.2 形态学鉴定
•   1.2 DNA的提取、PCR扩增及测序分析
•     1.2.1 DNA的提取
•     1.2.2 PCR体系
•     1.2.3 电泳检测和基因测序
•     1.2.4 系统发育分析
• 2 鉴定结果
•   2.1 枝角类
•     2.1.1 枝角类系统发育的聚类分析
•     2.1.2 枝角类种内种间遗传距离
•     2.1.3 枝角类的碱基组成
•   2.2 桡足类
•     2.2.1 桡足类系统发育的聚类分析
•     2.2.2 桡足类种内种间遗传距离
•     2.2.3 桡足类的碱基组成
• 3 讨论与分析

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 张蒙,孙枭琼,方楠,曹智涵,王宏伟

关键词: 浮游动物,条形码,系统发育树,白洋淀流域

来源: 河北大学学报(自然科学版) 2019年02期

年度: 2019

分类: 基础科学

专业: 生物学

单位: 河北大学生命科学学院

基金: 国家自然科学基金联合基金资助项目(U1133005),教育部留学回国基金资助项目(2014-2016),河北省高层次人才基金资助项目(C2015003034),比利时东弗兰德省与中国河北联合研究项目(2013),河北大学2018年实验室开放项目(sy201842)

分类号: Q958.8

页码: 217-224

总页数: 8

文件大小: 840K

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