回文结构论文_李雪

导读:本文包含了回文结构论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:回文,结构,含量,对称,序列,镜像,枯草杆菌。

回文结构论文文献综述

李雪[1](2017)在《回文结构分布特征及其对蛋白质折迭速率的影响》一文中研究指出回文结构是一种旋转对称结构,它既有序列的信息,又有结构的信息。它广泛地存在于真核生物及原核生物基因序列中,并且在这些基因中发挥着至关重要的作用。也有研究表明,很多疾病与回文结构密切相关,如男性不育、白血病、神经纤维瘤和肥大性骨关节病等,这些疾病都是由于回文结构变异引起的。关于回文结构的特征和作用,到目前为止没有完全弄清楚,有待于人们进一步深入研究。对于一些物种的回文结构,我们研究了回文频数、回文丰度和回文密度等特征。另外,蛋白质折迭问题是分子生物学的重要研究问题之一,其中,蛋白质折迭速率成为近年来一个研究热点。目前,关于蛋白质折迭速率的研究大多数基于蛋白质的结构、蛋白质的环境以及氨基酸序列等,也有研究表明,mRNA序列中也可能携带影响蛋白质折迭速率的因素,我们注意到,从序列的角度来看,回文结构体现了RNA遗传语言的特征;从结构的角度来看,回文结构是构成RNA结构的基本单元。如果蛋白质折迭速率也被mRNA影响的话,很可能体现在回文结构中。基于此想法,我们分析了回文结构各种参量对蛋白质折迭速率的影响。具体内容如下:1.在NCBI中收集到全部冠状病毒的RNA信息,计算出每个序列的回文结构,分析了回文结构中回文频数、回文丰度、回文密度等特征量。结果表明,回文丰度值随着回文长度的增加而减小,短的回文结构多,长的回文结构少,并发现了个别病毒中一些特殊的长回文结构可能会影响到病毒的结构或功能。2.基于相关文献和几个小的蛋白质折迭数据库,收集到具有蛋白质折迭速率信息的蛋白质,根据PDB、EMBL和NCBI数据库之间的交叉引用,找到了相应的mRNA信息,计算出每个mRNA序列回文结构的回文频数和回文密度,建立了一个较大的包括回文结构参量的蛋白质数据库。3.分析了回文频数对蛋白质折迭速率的影响,结果表明,对于所有蛋白质,回文频数与蛋白质折迭速率之间呈负相关,并且长度为4的回文结构的回文频数与其相应蛋白质折迭速率有较显着的相关性;对于不同二级结构类蛋白质,混合类(α-β)蛋白质的回文频数与相应蛋白质的折迭速率相关性更好一些。按不同折迭类分类下发现,回文频数与多态蛋白质的折迭速率之间的相关性更显着一些。回文频数的大小反映了mRNA序列的复杂性,这种复杂性会影响到肽链的延伸速度,进而影响到蛋白质折迭速率。4.分析了回文密度对蛋白质折迭速率的影响,结果表明,对于所有蛋白质,回文密度与蛋白质折迭速率呈负相关;对于不同类蛋白质(二级结构类和折迭类),回文密度与蛋白质折迭速率之间的相关性有较大的差异。进一步分析表明,正是被多个回文结构同时使用的那些碱基对蛋白质折迭速率起到非常重要的作用,它们体现了mRNA序列的可变性,这种可变性影响了肽链的延伸速度,因此,使回文密度成为影响蛋白质折迭速率的重要因素。(本文来源于《内蒙古师范大学》期刊2017-05-26)

黄跃进[2](2015)在《非范畴化与回文结构逆向对称重迭》一文中研究指出回文语言的独特性,绝妙的文字驾驭,是其它修辞所无法比拟的。从认知语言学角度分析回文的语义范畴,认为回文语义存在一定非范畴化特征,即在语义上表现为范畴成员逆向对称重迭的并列组合关系;句法上,范畴成员位置移动,突破了组合关系或聚合关系的常规限制,使得回文的后部分语义发生非范畴化变异;语境上,在认知参照点的作用下,回文的前后部分语义关系可能相似而形成统一关系,也可能相反而产生对立关系。这种关系使得回文语义发生非范畴化变异,在语用功能上违背了常规语言关系的限制,从而实现回文前景化语言的震撼性修辞表达效果。(本文来源于《成都理工大学学报(社会科学版)》期刊2015年04期)

王欢[3](2013)在《回文结构中的“事件性”分析》一文中研究指出回文是英汉语中一种常见又具有平衡美的修辞手法。本文旨在心智哲学视角下对回文结构中存在的"事件性"进行分析,从而为回文结构的理解提供一个全新的视角。回文的基本句式表达的是一种"事件",而其回返往复的效果则是在"事件"基础上通过主体的意向性和反思意识并结合语境而涌现成为的不同的"用例事件"。(本文来源于《佳木斯教育学院学报》期刊2013年08期)

刘国庆[4](2013)在《果蝇基因组中回文结构的非均匀分布》一文中研究指出回文序列是与基因表达调控、DNA复制和重组密切相关的重要DNA模体.回文的功能直接决定其在基因组中的丰度和分布,关于回文丰度和分布的信息从而促进回文的功能研究.文章研究回文在黑腹果蝇基因组中的分布规律.结果发现:(1)在不同类型的基因组序列(如编码区、内含子、基因间区、5'UTR和3'UTR)中,回文在3'UTR中分布最密集,编码序列中的分布最少;(2)序列的碱基组分偏好性不能够完全解释回文在基因组序列中的出现频数;(3)回文的相对丰度随着回文长度的增加而增加;(4)回文序列越长,其GC含量越低.所有这些都在启示,回文的功能多样性强烈依赖于其长度和GC含量.(本文来源于《内蒙古大学学报(自然科学版)》期刊2013年02期)

李瑞芳,李宏[5](2008)在《高致病病毒序列中高AT含量回文结构的研究》一文中研究指出统计分析了SARS病毒及其他几种冠状病毒全序列、艾滋病病毒全序列、丙型肝炎病毒全序列中,中间间隔S从0~100、侧翼序列长度L从4开始的所有回文结构.通过分析不同S,L的回文结构的频数以及AT含量,发现了一些特殊的回文结构,这些特殊结构的共同特点是AT含量高,而且都处于病毒中编码重要蛋白的序列中.综合考虑3种高致病病毒序列中高AT含量的回文结构的特点及其所处位置的特殊性,推测高AT含量的回文结构是某种具有生物学意义的结构,在病毒的侵入、复制等方面扮演着非常重要的角色.(本文来源于《内蒙古师范大学学报(自然科学汉文版)》期刊2008年06期)

李瑞芳,李宏[6](2008)在《SARS病毒序列中回文结构的研究》一文中研究指出统计了SARS病毒全序列中间间隔S从0到100、侧翼序列长度L从4开始的所有回文结构,并从AT含量及频数分布等方面分析了不同区域(编码及非编码区域等)回文结构的特征,同时,找出SARS病毒及其它几种冠状病毒各蛋白编码序列,并统计出它们中的回文结构,分析它们的回文特征,发现了一些SARS病毒序列中回文结构的分布规律,如L大于7的回文主要分布在编码区;绝大部分编码蛋白序列的回文结构数密度小于整个SARS病毒序列回文结构数密度等.(本文来源于《内蒙古大学学报(自然科学版)》期刊2008年06期)

李瑞芳,李宏,刘国庆,王芳平[7](2008)在《爱滋病病毒全序列回文结构的研究》一文中研究指出统计分析了爱滋病病毒全序列中中间间隔S从0到100、侧翼序列长度L从4开始的所有回文结构,通过分析不同S、L的回文结构的频数以及AT含量,发现回文结构的AT含量普遍高于全序列的AT含量.有叁种辅助蛋白(Vif、Vpu、Nef)存在于病毒颗粒内,我们找出编码这叁种蛋白的DNA序列,并统计出它们的回文结构,分析它们的AT含量及回文数密度(平均每1000个碱基中包含的回文数),并与丙型肝炎病毒序列回文结构进行对比.发现编码Vpu(HIV-1特有的蛋白)蛋白序列的回文结构在AT含量,和回文数密度方面均显示其特性.由此推测高AT含量的回文结构在HIV-1中起到重要作用.(本文来源于《内蒙古大学学报(自然科学版)》期刊2008年01期)

李培芳,李宏,林昊[8](2007)在《枯草杆菌基因组中的回文结构》一文中研究指出统计了枯草杆菌全序列中中间间隔S从0到29、侧翼序列长度L从4开始的所有回文结构,以及这些回文结构在编码区和非编码区的分布。通过分析不同S、L的回文结构的频数以及AT含量,发现枯草杆菌基因组中长的回文结构是过表达的、AT含量高并且对非编码区有偏好。(本文来源于《生物信息学》期刊2007年04期)

李培芳[9](2006)在《基因组中核苷酸序列的字频和回文结构》一文中研究指出随着大规模基因组测序计划的实施,大量原核和真核生物的基因组已被测定。在基因和基因组水平上分析这些序列的结构特征是亟待解决的问题。基因组序列可以看成是由四个字母A、G、C、T(分别代表腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶四种核苷酸)组成的“字母表”序列,本文分析了若干个基因组序列中k-字频数分布的几个特征和枯草杆菌基因组序列中各种回文结构的分布情况。 论文的第一部分为了描述基因组中k-字频数分布的特征,对几个典型原核生物、真核生物基因组序列进行了统计分析。区分“字”域和“频数”域,运用两种求信息熵的方法——Shannon信息熵和Fisher信息熵,定义了五种k-字频数的泛函。发现对于每一物种,由Shannon信息熵定义的四种泛函与字长k之间都具有很好的线性关系,并且这种线性关系在所研究的物种间具有普适性。 第二部分研究了枯草杆菌基因组中一种重要的字——回文结构。统计了枯草杆菌基因组中中间间隔S从0到29、侧翼序列长度L从4开始的所有回文结构,以及这些回文结构在编码区和非编码区的分布,并与同样长的随机序列中的回文结构数量做了比较。通过分析不同S、L的回文结构频数、标准频数(Z分数)以及AT含量,发现枯草杆菌基因组中长回文结构是过表达的、AT含量偏高并且对非编码区有偏好。(本文来源于《内蒙古大学》期刊2006-05-25)

王丽娟[10](2006)在《镜像DNA回文结构的量子化学研究》一文中研究指出镜像DNA的存在是分子生物学史上一个重要发现。镜像作为自然界基本的对称之一,早已成为化学和生物学领域关注的焦点。人们通常发现某些左手的化合物是有用的药物,而右手的异构体却没有期望的药效。大多数化学反应得到的产物是左手分子和右手分子的等量混合物。因此,镜像分子的存在是化学中的一种常见现象,而化学家碰到的困难则是将这两种互为镜像的分子(外消旋化合物)的分离。与此相反,优先选择的手征性是生命物质的普遍特征,天然生物分子不存在镜像形式,合成具有镜像功能的生物分子是长期以来化学家面临的挑战之一。 而本论文所研究的这对镜像DNA分子自身还存在回文对称性,计算结果表明,镜像DNA分子——d(CGCGCG)的HOMO与LUMO及其相邻的20条轨道中,有15条轨道是镜像对称的,7条轨道是镜像反对称的,镜像对称与镜像反对称的比例为15:7,具有回文结构的镜像DNA产生了较多的镜像对称轨道,这正是“对称产生对称”的典范,回文对称产生了镜像对称。 而我们所研究的另一对非回文结构的镜像DNA——d(AGCGCG)的HOMO与LUMO及其相邻的20条轨道中,有7条轨道是镜像对称的,15条轨道是镜像反对称的,镜像对称与镜像反对称的比例为7:15,具有非回文结构的镜像DNA产生了较多的镜像反对称轨道,这印证了“不对称产生不对称”,回文对称的破坏产生了镜像反对称的结果。 同时,我们还对组成这对奇特DNA的C,G碱基进行了对称性分析,并首次提出了碱基的“超对称性”。(本文来源于《兰州大学》期刊2006-05-01)

回文结构论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

回文语言的独特性,绝妙的文字驾驭,是其它修辞所无法比拟的。从认知语言学角度分析回文的语义范畴,认为回文语义存在一定非范畴化特征,即在语义上表现为范畴成员逆向对称重迭的并列组合关系;句法上,范畴成员位置移动,突破了组合关系或聚合关系的常规限制,使得回文的后部分语义发生非范畴化变异;语境上,在认知参照点的作用下,回文的前后部分语义关系可能相似而形成统一关系,也可能相反而产生对立关系。这种关系使得回文语义发生非范畴化变异,在语用功能上违背了常规语言关系的限制,从而实现回文前景化语言的震撼性修辞表达效果。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

回文结构论文参考文献

[1].李雪.回文结构分布特征及其对蛋白质折迭速率的影响[D].内蒙古师范大学.2017

[2].黄跃进.非范畴化与回文结构逆向对称重迭[J].成都理工大学学报(社会科学版).2015

[3].王欢.回文结构中的“事件性”分析[J].佳木斯教育学院学报.2013

[4].刘国庆.果蝇基因组中回文结构的非均匀分布[J].内蒙古大学学报(自然科学版).2013

[5].李瑞芳,李宏.高致病病毒序列中高AT含量回文结构的研究[J].内蒙古师范大学学报(自然科学汉文版).2008

[6].李瑞芳,李宏.SARS病毒序列中回文结构的研究[J].内蒙古大学学报(自然科学版).2008

[7].李瑞芳,李宏,刘国庆,王芳平.爱滋病病毒全序列回文结构的研究[J].内蒙古大学学报(自然科学版).2008

[8].李培芳,李宏,林昊.枯草杆菌基因组中的回文结构[J].生物信息学.2007

[9].李培芳.基因组中核苷酸序列的字频和回文结构[D].内蒙古大学.2006

[10].王丽娟.镜像DNA回文结构的量子化学研究[D].兰州大学.2006

论文知识图

直接施加弯矩的拟静力试验装置柱中施加荷载的拟静力试验装置爱滋病病毒序列回文结构频数的...在K二8的框架下6种具有回文结构mtrR启动子区域基因部分测序结果图(箭...爱滋病病毒序列回文结构的AT含...

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