芍药MADS-box基因家族的鉴定及适应性进化分析

论文摘要

在植物生长发育过程中,MADS-box是一大类重要的转录调控因子,尤其是在植物花器官发育过程中起到重要的作用。本研究以已经公开的芍药（Paeonia lactiflora） MADS-box相关的基因信息为研究对象,利用生物信息学方法对芍药MADS-box基因家族进行鉴定和注释,并对其基本理化性质、保守基序以及适应性进化等方面进行分析。结果表明,在芍药中鉴定出23个MADS-box基因家族成员,编码的氨基酸序列长度在209～244 aa之间,相对分子量介于24.29～28.13 kD之间,氨基酸组成以Leu含量最为丰富。系统进化树的分析表明,23个芍药MADS-box基因可分为AP1亚族、AP3亚族、PI亚族、SEP1亚族、AG亚族、AGL亚族和SEP3亚族等7个。保守基序分析发现,所有芍药MADS-box基因家族成员中都包含有高度保守的MADS和K-box基序,均属于MIKCC型基因。适应性进化分析发现,PlMADS基因虽存在有正选择的分支,但大多数分支受到强烈的负选择作用。研究结果为深入理解芍药MADS-box基因的生物学功能提供了重要的参考信息。

论文目录

• 1 结果与分析
•   1.1 鉴定出23个MADS-box基因家族成员
•   1.2 芍药MADS-box基因家族系统进化为7个亚族
•   1.3 芍药MADS-box基因家族成员的理化性质差异不大
•   1.4 芍药MADS-box家族蛋白的保守结构域分析
•   1.5 芍药MADS-box基因受到正向和负向的选择压的影响
• 2 讨论
• 3 材料与方法
•   3.1 芍药MADS-box基因家族的鉴定
•   3.2 芍药MADS-box基因系统进化和基序分析
•   3.3 芍药MADS-box编码蛋白的基本理化分析
•   3.4 选择压力检测
• 作者贡献

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 张加强,朱开元,史小华

关键词: 芍药,花器官发育,基因,适应性进化

来源: 分子植物育种 2019年21期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,园艺

单位: 浙江省萧山棉麻研究所

基金: 浙江省农科院青年科技人才培养项目(2017R25R08E02),浙江省公益技术应用研究计划项目(2017C32039),2016年度浙江省农科院中青年科技人员国内外进修培养项目(2016),杭州市科技计划引导项目(20163501Y80)共同资助

分类号: Q943.2;S682.12

DOI: 10.13271/j.mpb.017.006959

页码: 6959-6966

总页数: 8

文件大小: 2258K

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