高原鼢鼠肺组织细胞凋亡相关基因的进化分析及其在不同海拔条件下的表达模式

论文摘要

高原鼢鼠（Myospalax baileyi）是青藏高原特有的地下鼠,其地下洞道严重缺氧。一般来说,低氧会促进细胞凋亡。为了探讨高原鼢鼠适应低氧环境的分子机制,本文应用生物信息学方法对p53下游凋亡促进基因Pidd、Fas、Bax、Puma、Apaf-1、Scotin、Perp、Igfbp3和凋亡抑制基因Bcl-2的序列和编码的氨基酸序列进行了进化分析,并以SD大鼠（Rattusnorvegicus）为对照,研究了这些基因在不同海拔环境条件下（3 300 m和2 260 m）的表达模式。结果表明:（1）高原鼢鼠细胞凋亡基因的序列与以色列鼹鼠（Nannospalax galili）同源性最高;预测的PIDD、PUMA、Apaf-1、IGFBP3和BCL-2编码蛋白结构域与以色列鼹鼠的存在明显的趋同进化位点;SIFT评估发现,高原鼢鼠和以色列鼹鼠与其他物种相比,p53、PIDD、PUMA、Apaf-1和IGFBP3氨基酸序列分别在78、853、157、320和285号位点的变异对其功能有显著影响;（2）在高海拔条件下（3 300 m）,高原鼢鼠肺组织中凋亡促进基因Pidd、Bax、Puma和Apaf-1表达水平显著下降,凋亡抑制基因Bcl-2表达水平显著升高,而在SD大鼠中凋亡促进基因和凋亡抑制基因的表达水平均没有变化;高原鼢鼠中Bcl-2/Bax比值随海拔的升高显著上升,而在SD大鼠中没有变化。以上结果提示,高原鼢鼠p53结构变异可能导致其下游基因表达模式与SD大鼠不同,其中凋亡促进基因Pidd、Bax、Puma和Apaf-1表达水平下降,凋亡抑制基因Bcl-2表达水平上升,从而抑制了细胞在低氧条件下的凋亡;在长期低氧的作用下,高原鼢鼠p53下游基因产物PIDD、PUMA、Apaf-1和IGFBP3产生了影响其功能的变异位点,这可能改变了它们与发挥功能的复合物的结合力,从而抑制了细胞凋亡。因此,通过长期的低氧适应,高原鼢鼠肺组织中与细胞凋亡相关的基因产物结构发生变异,导致其基因表达水平发生变化,从而抑制细胞凋亡,这是高原鼢鼠适应地下低氧洞道生境的分子机制之一。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 实验动物
•   1.2 细胞凋亡基因序列分析
•     1.2.1 序列获取
•     1.2.2 同源性分析
•     1.2.3 物种树构建方法
•     1.2.4 选择压力分析
•     1.2.5 趋同进化分析
•     1.2.6 变异位点对基因功能影响的评估
•   1.3 高原鼢鼠细胞凋亡基因表达水平测定
• 2 结果
•   2.1 高原鼢鼠细胞凋亡基因同源性比对结果
•   2.2 物种树的构建
•   2.3 高原鼢鼠细胞凋亡基因选择压力分析
•   2.4 细胞凋亡基因趋同进化分析
•   2.5 高原鼢鼠p53及细胞凋亡基因变异位点对其功能影响的评估
•   2.6 高原鼢鼠和SD大鼠细胞凋亡基因m RNA表达水平
•   2.7 高原鼢鼠和SD大鼠肺组织中Bcl-2/Bax比值
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 安志芳,魏琳娜,王志洁,李苏华,徐波,魏莲,魏登邦

关键词: 高原鼢鼠,细胞凋亡基因,进化分析,表达,低氧

来源: 动物学杂志 2019年04期

年度: 2019

分类: 基础科学,农业科技

专业: 生物学

单位: 青海大学省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室,青海大学医学院,青海大学农牧学院

基金: 青海省自然科学基金项目(No.2016-ZJ-901)

分类号: Q953

DOI: 10.13859/j.cjz.201904012

页码: 549-566

总页数: 18

文件大小: 1676K

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