不同光质条件下刺葡萄红色愈伤组织的RT-qPCR内参基因筛选

论文摘要

不同光质对刺葡萄红色愈伤组织（DLR）花青素的积累以及细胞生长具有重要影响.利用RT-qPCR进行不同光质培养的刺葡萄红色愈伤组织功能基因的表达分析,筛选适用于不同光质下RT-qPCR分析的内参基因.以9种光质（黑暗、白光、红光、黄光、蓝光、绿光、紫光、暖白光、暖黄光）下培养获得的刺葡萄红色愈伤组织为材料,对10个葡萄中常用的内参基因进行RT-qPCR分析.结果显示,geNorm、Normfinder、BestKeeper等3个内参分析软件因算法不同,内参稳定性排名具有一定差异. ge Norm评估排名前5的内参基因为α-Tubulin=AP-2> 60SRP> EF1-α> UBQ;Normfinder计算排名前5的内参为60SRP> AP-2>α-Tubulin> EF1-α> GAPDH;BestKeeper分析的前5个基因依次为UBQ>α-Tubulin> 60SRP> EF1-α> SAND.α-Tubulin、60SRP在3个软件评估中排名最为稳定靠前,NAD5则为最不稳定候选内参基因.拟定α-Tubulin、60SRP为最适内参,对目的基因UFGT进行验证,验证结果显示α-Tubulin、60SRP表达趋势相似,具有较高的稳定性,其组合可获得较为精准的表达分析结果.本研究结果可为后续光质处理刺葡萄红色愈伤组织的基因表达研究提供理论基础.（图5表2参39）

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 材料处理
•   1.2 总RNA的提取与c DNA合成
•   1.3 引物设计及其特异性检测
•   1.4 实时荧光定量PCR
•   1.5 内参基因稳定性验证
•   1.6 数据分析与内参基因的确认
• 2 结果与分析
•   2.1 RNA质量、引物特异性及扩增效率
•   2.2 候选内参基因的转录丰度
•   2.3 内参基因表达稳定性
•   2.4 内参基因组合数
•   2.5 内参稳定性的验证
• 3 讨论与结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 潘红,赖呈纯,张静,黄贤贵,林玉玲,赖钟雄

关键词: 刺葡萄,红色愈伤组织,光质,内参基因,实时荧光定量

来源: 应用与环境生物学报 2019年06期

年度: 2019

分类: 基础科学,工程科技Ⅰ辑,农业科技

专业: 园艺

单位: 福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福建省农业科学院农业工程技术研究所,福建省农产品(食品)加工重点实验室

基金: 福建省自然科学基金项目（2016J01126）,福建省农业科学院科技创新团队项目（STIT2017-1-10）,福建农林大学应用基础研究科技创新专项基金（CXZX2017189）资助~~

分类号: S663.1

DOI: 10.19675/j.cnki.1006-687x.2019.01038

页码: 1407-1413

总页数: 7

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